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Delineamento di MicroRNA

Delineamento di MicroRNA

MicroRNAs, o i miRNAs, è piccolo RNAs che regolamentano l'espressione genica dopo che la trascrizione ha avuto luogo. Ciò si presenta sia negli stati fisiologici sani che negli stati malati in molti organismi. dovuto l'intervallo dei trattamenti che contribuiscono a regolamentare, miRNAs può fornire i biomarcatori apprezzati nei contesti di malattia; ecco perché profilare l'espressione del miRNA è un campo di studio crescente.

Il miRNA di Interestin

i miRNAs sono brevi, frammenti del RNA di non codifica che contribuiscono a regolamentare l'espressione genica. Dopo trascrizione del DNA originale, il RNA messaggero (mRNA) è rilasciato e il miRNA può legare a. Questa associazione promuove la degradazione del mRNA o dell'inibizione di traduzione, quindi ostacolante la formazione proteica. I miRNAs sono pochi rispetto agli obiettivi del mRNA, a approssimativamente 1 miRNA per ogni 30 mRNA. Tuttavia, questi pochi miRNAs possono regolamentare molti mRNAs e quindi per avere un effetto profondo sull'espressione.

Poichè un miRNA può potenzialmente regolamentare le centinaia di mRNA, è stato arguito che il reticolo di espressione di quelle centinaia di mRNA può essere catturato in un singolo miRNA. Questa ricchezza di informazioni biologiche sta facendo appello a ai ricercatori nei campi quali biologia dello sviluppo, differenziazione del tessuto e la malattia. il delineamento del miRNA comprende l'analisi dell'espressione dei miRNAs che variano dalle specie a livello ai più piccoli gruppi di interesse biologico.

Applicazioni di delineamento

il miRNA può regolamentare che i mRNAs ottengono tradotti in proteine e quindi può sopprimere l'espressione genica inadeguata. In biologia dello sviluppo, il confronto dei profili del miRNA può contribuire a mostrare quali miRNAs sono compresi in determinati trattamenti inerenti allo sviluppo. Tale ricerca ha indicato che i profili del miRNA, o l'espressione picchietta, può essere specifica a determinati tipi delle cellule. Inoltre, i miRNAs possono fermare le transizioni inerenti allo sviluppo e contribuire a mantenere lo stato delle cellule una volta che si è differenziato. Ciò piombo i ricercatori credere che il miRNA potesse avere applicazioni apprezzate in cellule staminali di comprensione.

Nei contesti di malattia, i miRNAs stanno esplorandi come sorgenti dei biomarcatori di determinate malattie. i profili del miRNA dei tessuti sani e malati sono confrontati per identificare i biomarcatori di malattia e gli obiettivi terapeutici potenziali. Questa tattica è stata impiegata nelle malattie autoimmuni e e neurologiche del cancro.

In particolare, i miRNAs anormali sono dal punto di vista terapeutico di interesse sia che nello studio della progressione del tumore nel cancro. La causa fondamentale per le differenze nell'espressione del miRNA fra i tessuti sani e malati può essere dovuto le mutazioni puntiformi del DNA, la variazione epigenetica, o i cambiamenti cromosomici ai geni del miRNA. Nel cancro, il delineamento del miRNA egualmente è stato usato per diagnosticare clinicamente l'origine del cancro quando l'altra identificazione è difficile. il miRNA anche è stato impiegato nella dialettica per ragioni analoghe, poichè i profili del miRNA possono contribuire a distinguere i tipi di liquidi organici trovati nelle scene del crimine.

Metodi di delineamento del miRNA

il delineamento del miRNA può essere fatto facendo uso di un intervallo dei metodi, come reazione a catena inversa quantitativa della polimerasi della trascrizione (qRT-PCR), il microarray del miRNA ed ordinamento del RNA. QRT-PCR comprende la trascrizione inversa del miRNA in cDNA e l'ordinamento successivo del prodotto.

Questo metodo si applica comunemente all'altro studio genetico e quindi sta facendo appello a ai laboratori già esperti con il metodo. Per profilare il miRNA facendo uso di qRT-PCR, parecchi miRNAs sono analizzati parallelamente nelle stesse circostanze della reazione. Tuttavia, i miRNAs possono differire drasticamente nelle loro circostanze ottimali che i mezzi che analizzano i miRNAs parallelamente possono essere difficili. Per sormontare questo, i ricercatori possono utilizzare gli acidi nucleici bloccati (LNAs) nelle mani di fondo stessi.

I Microarrays egualmente analizzano parecchi miRNAs parallelamente durante il delineamento. Nel microarray, i miRNAs fluorescente sono etichettati. a sonde basate a DNA di bloccaggio poi sono usate per ibridare il miRNA etichettato. Queste sonde possono o non possono contenere LNAs, appena come in qRT-PCR. La schiera poi è scandita e la fluorescenza è quantificata per profilare il miRNA. I Microarrays permettono che molti altri campioni siano profilati in tandem, comunque questo metodo è solitamente più costoso.

Un approccio più novello al delineamento del miRNA è ordinamento di prossima generazione. Il RNA che ordina (RNA-seguente) è un tale metodo e spesso è considerato la nuova tecnica più potente per il delineamento del miRNA. Come qRT-PCR, in RNA-seguente il campione subisce la trascrizione inversa per generare una libreria del cDNA. I convertitori sono inseriti sopra alle estremità dei fili del cDNA ed i campioni sono ampliati facendo uso della PCR. I dati da rivedere di sequenza sono analizzati facendo uso di bioinformatica per rivelare i miRNAs conosciuti. La previsione di nuovi miRNAs è egualmente possibile.

Sorgenti

  1. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4517822/
  2. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29380324
  3. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0959437X13000129

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Last Updated: Feb 26, 2019

Sara Ryding

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Sara Ryding

Sara is a passionate life sciences writer who specializes in zoology and ornithology. She is currently completing a Ph.D. at Deakin University in Australia which focuses on how the beaks of birds change with global warming.

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