Applications de puce ADN de protéine

Les puces ADN fournissent une voie de dispenser des échantillons biologiques pour l'analyse de haut-débit. Des échantillons sont arrangés dans les lignes et colonnes sur une surface de support se composant d'une lamelle de verre, d'une membrane de nitrocellulose ou d'une plaque de microtitre.

Crédit : Sergei Drozd/Shutterstock.com

Des puces ADN de protéine sont employées pour déterminer le fonctionnement des protéines, ainsi que pour surveiller leurs interactions. La structure du choix tient compte pour que de nombreuses protéines soient suivies en parallèle. Des puces ADN de protéine ont été développées en utilisant la technologie des puces ADN d'ADN, qui sont utilisées généralement pour analyser l'expression du gène.

Les conditions des puces ADN de protéine sont, cependant, plus complexes et rendent nécessaire la personnalisation matérielle pour les rendre adaptées. Quoiqu'elles ne soient pas aussi couramment - vu que des puces ADN d'ADN, puces ADN de protéine de plus en plus sont employés pour des applications multiples en biosciences.

Demande de trouver des interactions de protéines

Une des applications les plus tôt des puces ADN de protéine était pour le dépistage des propriétés protéine-grippantes. Des ligands de test directement ou indirectement sont marqués avec les teintures fluorescentes pour analyser des interactions protéine-protéine. Une des protéines dans les paires étant vérifiées est rangée dans les échantillons multiples sur des guides et chaque échantillon est sondé avec une protéine fluorescent marquée différente. Des interactions sont recensées dans les endroits témoin où la marque fluorescente est visible.

Des puces ADN de protéine ont été utilisées pour surveiller les interactions entre :

  • Différentes protéines telles que des enzymes et des substrats
  • Protéines et anticorps
  • Protéines et lipides
  • Protéines et peptides
  • Protéines et composés de masse à faible poids moléculaire
  • Protéines et oligosaccharides
  • Protéines et ADN
  • Protéines et ARN
  • Lectin (protéines hydrate de carbone-grippantes) et cellules

Demande de diagnose clinique et de pronostic

Des puces ADN de protéine ont été également appliquées pour l'usage dans la diagnose clinique et le pronostic. Des outils d'identification de biomarqueur peuvent être formés quand des protéines sont traitées en tant qu'antigènes potentiels qui peuvent être vérifiés pour l'association avec les maladies particulières.

Par exemple, fluorescent marqué les anticorps anti-humains d'immunoglobuline sont employés pour trouver les pairings des antigènes et des anticorps. L'autoanticorps lié à une maladie humaine particulière identifiera l'échantillon humain de protéine sur le choix et la marque fluorescente fournit une méthode de recenser l'appareillement produit. Cette méthode produit un profil des autoanticorps liés à la maladie.

Une technique assimilée a été développée pour le dépistage des maladies infectieuses. Un exemple est la puce ADN de protéine de coronavirus produite pour diagnostiquer le syndrôme respiratoire aigu sévère (SARS).  Le choix a compris des échantillons de protéines de coronavirus de radar à ouverture synthétique et de cinq coronaviruses infectieux complémentaires.

La présence des anticorps humains contre les protéines de coronavirus de radar à ouverture synthétique sur la puce ADN a mené à la capacité de discerner les échantillons de sérum patients qui ont compris le virus avec l'exactitude de 94%. En bref, la technologie de puce ADN de protéine a fourni à une méthode diagnostique au moins cents fois la sensibilité que des méthodes diagnostiques normales, avec des conditions inférieures de volume témoin.

Application de la puce ADN inverse de protéine de phase (RPPA)

Les puces ADN inverses de protéine de phase (RPPA) fournissent une méthode pour l'application sur les lysates purs de protéine d'isolement dans le tissu ou les cellules cultivées. Les puces ADN de cartels de technologie avec le laser captent la microdissection (LCM).

LCM est une méthode de procurer des cellules utilisant un laser capable de fondre un endroit entre 7,5 et 30 micromètres de diamètre. Le tissu est souillé, mis sur un guide puis conçu sous un microscope en temps réel.

Des cellules peuvent être isolées dans le diamètre du laser, avec plus de cellules obtenues en déménageant le guide. Les cellules d'isolement sont alors lysées en vue d'être mis sur la puce ADN inverse de protéine de phase. Les endroits témoin sur le choix contiennent les protéines dans une cellule qui correspondent à la condition pathologique donnée.

Tandis que les choix conventionnels de protéine immobilisent la sonde d'anticorps, la puce ADN inverse de protéine de phase immobilise la protéine s'analysant. Des puces ADN inverses de protéine de phase ont été employées pour la diagnose, pour vérifier des voies de transduction du signal entre les hormones et la membrane cellulaire, ainsi que pour recenser les candidats vacciniques potentiels.

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Last Updated: May 24, 2019

Shelley Farrar Stoakes

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Shelley Farrar Stoakes

Shelley has a Master's degree in Human Evolution from the University of Liverpool and is currently working on her Ph.D, researching comparative primate and human skeletal anatomy. She is passionate about science communication with a particular focus on reporting the latest science news and discoveries to a broad audience. Outside of her research and science writing, Shelley enjoys reading, discovering new bands in her home city and going on long dog walks.

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