Usos del Microarray de la proteína

Los Microarrays ofrecen una manera de ordenar las muestras biológicas para el análisis de la alto-producción. Las muestras se arreglan en olumnas y filas sobre una superficie del apoyo que consiste en una diapositiva de cristal, una membrana de la nitrocelulosa o una placa de microtítulo.

Haber: Sergei Drozd/Shutterstock.com

Los microarrays de la proteína se utilizan para determinar la función de proteínas, así como para vigilar sus acciones recíprocas. La estructura del arsenal permite para que las proteínas numerosas sean rastreadas paralelamente. Los microarrays de la proteína fueron desarrollados utilizando la tecnología de los microarrays de la DNA, que son de uso general analizar la expresión génica.

Los requisitos de los microarrays de la proteína son, sin embargo, más complejos y necesitan el arreglo para requisitos particulares material para hacerlos convenientes. Aunque no están tan común - visto como los microarrays de la DNA, microarrays de la proteína se están utilizando cada vez más para los usos múltiples en las ciencia biológicas.

Uso para descubrir acciones recíprocas de la proteína

Uno de los usos más tempranos de los microarrays de la proteína estaba para la detección de propiedades proteína-obligatorias. Los ligands de la prueba directa o indirectamente etiqueta con los tintes fluorescentes para analizar acciones recíprocas de la proteína-proteína. Una de las proteínas en los pares que son probados se pone en orden en muestras múltiples en diapositivas y cada muestra se sonda con una diversa proteína fluorescente etiqueta. Las acciones recíprocas se determinan en los sitios de la muestra donde está visible la escritura de la etiqueta fluorescente.

Los microarrays de la proteína se han utilizado para vigilar las acciones recíprocas en medio:

  • Diversas proteínas tales como enzimas y substratos
  • Proteínas y anticuerpos
  • Proteínas y lípidos
  • Proteínas y péptidos
  • Proteínas y composiciones en masa de poco peso molecular
  • Proteínas y oligosacáridos
  • Proteínas y DNA
  • Proteínas y ARN
  • Lectin (proteínas hidrato de carbono-obligatorias) y células

Uso para los diagnósticos y el pronóstico clínicos

Los microarrays de la proteína también se han solicitado uso en diagnósticos y pronóstico clínicos. Las herramientas de la identificación del Biomarker pueden ser formadas cuando las proteínas se tratan como antígenos potenciales que se puedan probar para la asociación con enfermedades determinadas.

Por ejemplo, fluorescente etiqueta los anticuerpos anti-humanos de la inmunoglobulina se utilizan para descubrir los pairings de antígenos y de anticuerpos. El autoanticuerpo asociado a una enfermedad humana determinada reconocerá la muestra humana de la proteína en el arsenal y la escritura de la etiqueta fluorescente ofrece un método de determinar emparejar producido. Este método crea un perfil de los autoanticuerpos asociados a la enfermedad.

Una técnica similar se ha desarrollado para la detección de enfermedades infecciosas. Un ejemplo es el microarray de la proteína del coronavirus producido para diagnosticar neumonía asiática (SARS).  El arsenal incluyó muestras de las proteínas del coronavirus del SARS y de cinco coronaviruses infecciosos adicionales.

La presencia de los anticuerpos humanos contra las proteínas del coronavirus del SARS en el microarray llevó a la capacidad de distinguir las muestras pacientes del suero que incluyeron el virus con la exactitud del 94%. En fin, la tecnología del microarray de la proteína proveyó de un método diagnóstico por lo menos cientos veces la sensibilidad que métodos diagnósticos estándar, junto con requisitos más inferiores del volumen de muestra.

Uso del microarray reverso de la proteína de la fase (RPPA)

Los microarrays reversos de la proteína de la fase (RPPA) ofrecen un método para el uso en los lysates puros de la proteína aislados de tejido o de las células cultivadas. Los microarrays de las cosechadoras de la tecnología con el laser capturan el microdissection (LCM).

LCM es un método de obtener las células usando un laser capaz de fundir un área entre 7,5 y 30 micrómetros en diámetro. El tejido se mancha, se coloca en una diapositiva después se visualiza bajo un microscopio en tiempo real.

Las células se pueden aislar dentro del diámetro del laser, con más células obtenidas moviendo la diapositiva. Las células aisladas entonces lysed con objeto de la colocación en el microarray reverso de la proteína de la fase. Los sitios de la muestra en el arsenal contienen las proteínas dentro de una célula que corresponden al estado patológico dado.

Mientras que las matrices convencionales de la proteína inmovilizan la antena del anticuerpo, el microarray reverso de la proteína de la fase inmoviliza la proteína que es analizada. Los microarrays reversos de la proteína de la fase se han utilizado para los diagnósticos, para investigar caminos de la transducción de la señal entre las hormonas y la membrana celular, así como para determinar a candidatos vaccíneos potenciales.

Fuentes:

  1. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0021967303007696
  2. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10976071
  3. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3680110/#S10title
  4. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16537477
  5. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15239896

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Last Updated: May 24, 2019

Shelley Farrar Stoakes

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Shelley Farrar Stoakes

Shelley has a Master's degree in Human Evolution from the University of Liverpool and is currently working on her Ph.D, researching comparative primate and human skeletal anatomy. She is passionate about science communication with a particular focus on reporting the latest science news and discoveries to a broad audience. Outside of her research and science writing, Shelley enjoys reading, discovering new bands in her home city and going on long dog walks.

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