Breve interferenza del RNA della forcella (shRNA)

Che cosa è breve RNA della forcella?

Il RNA servisce un'ampia varietà di ruoli all'interno di una cella, delle funzioni transferal catalitiche, regolarici, strutturali e genetiche di avanzamento. Un tipo di RNA artificiale, chiamato breve RNA della forcella (shRNA), contiene un giro stretto della forcella e frequentemente è usato per fare tacere i geni in un trattamento chiamato interferenza dello shRNA.

Il piccolo RNA d
Piccolo RNA d'interferenza limitato all'RNA messaggero, modello dell'illustrazione con superficie semi-trasparente. i siRNAs sono strumenti sintetici di interferenza del RNA utilizzati per l'induzione della riduzione temporanea dell'espressione del mRNA. Credito di immagine: Petarg/Shutterstock

Questo RNAs è presentato nella cella con integrazione e l'inserzione del DNA vettori batterici/virali o nei plasmidi.

I plasmidi possono essere usati soltanto in vitro, che limita il loro potenziale dell'applicazione. Molti tipi differenti di vettori virali sono stati utilizzati negli studi precedenti, quali i virus, i lentiviruses e gli adenovirus adeno-associati. Tuttavia, parecchi problemi recentemente sono stati indicati nei test clinici, quale lo sviluppo di cancro dovuto l'inserzione inesatta del plasmide.

Per concludere, i vettori batterici recentemente sono stati suggeriti soltanto come vettori per shRNA. Parecchi tipi possono essere usati, quale Escherichia coli, che è stato utilizzato nei test clinici per Polyposis adenomatoso familiare.

Che cosa è interferenza del RNA?

Questo trattamento comprende l'inibizione di geni con l'ottimizzazione delle molecole del mRNA. il mRNA è ripartito, impedente la trascrizione e la formazione proteica. Ciò è effettuata attraverso l'introduzione di RNA (ds) a doppia elica nella cella, che poi è fenduta e limitata dal complesso facente tacere indotto da RNA (RISC), che finalmente degrada il mRNA in un modo sequenza-specifico, facendo uso di piccolo RNA d'interferenza (siRNA) come guida.

Che cosa è breve interferenza del RNA della forcella (shRNA)?

La sintesi degli shRNAs ha luogo nel nucleo delle celle che transfected o transduced. Successivamente sono presentate via i vettori virali o batterici nei nuclei delle celle mirate a che tengono conto in alcuni casi integrazione stabile nel genoma.

gli shRNAs formano le strutture che somigliano ad una forcella e consistono di un ciclo dei nucleotidi spaiati che sono connessi ad una regione del tipo di gambo di senso e di fili antisenso che sono accoppiati. lo shRNA è esportato dal nucleo da Exportin 5. In un complesso con TRBP e Ago2, Dicer poi taglia lo shRNA in siRNA duplex del nucleotide 19-23.

Questo duplex egualmente contiene 3' sporgenze di circa 2 nucleotidi. Ulteriore fenditura da Ago2 piombo alla perdita del filo del passeggero, lasciante soltanto il filo della guida.

Questo filo poi si combina all'interno della specificità attiva di interferenza del RNA complessa (RISC) ed è usato come guida per mirare al mRNA in un modo molto specifico. Una volta che lega al mRNA, un organismo di P è formato, dove il mRNA è fenduto e ripartito.

Applicazioni

Una delle applicazioni principali di interferenza dello shRNA corrente in esame è fare tacere dei geni malattia-associati. Per esempio, gli studi hanno studiato gli usi potenziali di questa analisi per il trattamento di FAP, di cancro metastatico e di altri cancri avanzati. Tuttavia, questi studi hanno tutti i problemi difficili considerati, quali i metodi della consegna.

I metodi virali sono stati dimostrati per essere pericolosi, con alcuni pazienti che sviluppano la leucemia. Un'altra questione è gli effetti dell'fuori obiettivo, in grado di piombo a fare tacere non specifico del gene. Ciò, in particolare, ha potuto avere conseguenze disastrose. Di conseguenza, questo metodo ancora richiede l'ottimizzazione prima che possa essere comunemente usato curare i pazienti.

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Last Updated: Nov 1, 2018

Hannah Simmons

Written by

Hannah Simmons

Hannah is a medical and life sciences writer with a Master of Science (M.Sc.) degree from Lancaster University, UK. Before becoming a writer, Hannah's research focussed on the discovery of biomarkers for Alzheimer's and Parkinson's disease. She also worked to further elucidate the biological pathways involved in these diseases. Outside of her work, Hannah enjoys swimming, taking her dog for a walk and travelling the world.

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