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Techniques utilisées dans le profilage visé de Metabolomic

Metabolomic profilant des entrer dans deux catégories : metabolomics visé et untargeted. Le metabolomics d'Untargeted se rapporte à une analyse globale de toutes les petites molécules dans une cellule, un tissu, ou un organisme, alors que le metabolomics visé se rapporte à la présence et à la concentration des métabolites spécifiques liées à une maladie particulière.

Illustration de metabolomics - qui peut être employée pour étudier les métabolites dans une cellule et pour déterminer la condition de la maladiearleksey | Shutterstock

Le metabolome se compose de toutes les métabolites dans une cellule, un tissu, ou un organisme. En mesurant le nombre et le type de métabolites dans un organisme, ou le tissu particulier d'intérêt, dans le cadre d'une maladie spécifique, il est possible de déterminer la condition de la maladie des métabolites actuelles.

Techniques utilisées dans le profilage de métabolite

Les techniques analytiques pour recenser des changements de la population des métabolites comprennent la spectroscopie de résonance magnétique nucléaire, la spectrométrie de masse, la spectroscopie infrarouge de transformée de Fourier, et la chromatographie liquide. Les métabolites endogènes comprennent beaucoup de types chimiques qui exigent des méthodes analytiques particulières pour l'identification couronnée de succès.

In silico des bibliothèques sont habituellement utilisées pendant le metabolomics untargeted pour recenser facilement la substance chimique. Bien que l'immense quantité de données brutes produites rende souvent recensant les métabolites particulières difficile. Supplémentaire, les petites molécules actuelles dans les fortes concentrations occluent souvent le dépistage d'autres molécules moins courantes.

Dans le profilage métabolique visé, pendant que les métabolites d'intérêt sont connues la préparation des échantillons et l'analyse peut être profilée seulement aux la plupart technique appropriée. En outre, des normes internes peuvent être employées pour fournir des résultats quantitatifs. Par exemple, en extrayant un échantillon particulier de métabolite le protocole peut être réglé pour adapter idéalement à la polarité, au pH, et à la température préférés de la molécule.

Comment est-ce que des métabolites sont séparées ?

Puisque les échantillons metabolomic sont hautement complexes, des techniques de séparation sont employées pour les classer par catégorie et grouper ensemble. Ainsi, des méthodes de dépistage spécifiques peuvent être appliquées aux molécules des types particuliers, et le rapport signal/bruit peut être amélioré. La chromatographie gazeuse est très utilisée pendant qu'elle offre la bonne définition chromatographique entre les métabolites volatiles, et peut facilement être combinée avec la spectrométrie de masse ou le dépistage d'ionisation de la flamme. Des molécules moins volatiles et polaires sont habituellement séparées par la chromatographie liquide de haute performance.

Comment est-ce que des métabolites sont trouvées ?

La spectrométrie de masse est employée pour évaluer pour taper et concentration des métabolites, séparation habituellement suivante par le liquide ou chromatographie gazeuse. La configuration distincte de fragmentation produite par les métabolites peut être avec des bibliothèques de caractéristiques pour déterminer leur identité. Les développements dans des techniques de spectrométrie de masse réduisent le besoin de séparation antérieure, puisqu'elle est suffisamment sélectrice pour différencier entre les métabolites.

La spectroscopie de résonance magnétique nucléaire est également utilisée généralement pour recenser des métabolites, et des métabolites n'ont pas besoin d'être séparées avant dépistage tout en employant la spectroscopie de résonance magnétique nucléaire. Ainsi, elle peut récupérer l'échantillon après analyse. Toutes les métabolites sont capables d'être trouvé des techniques par 1résonance magnétique nucléaire normale 13de H et de C, avec la reproductibilité analytique élevée et la préparation des échantillons relativement simple. Cependant, la quantité de caractéristiques produites est hautement complexe avec la spectrométrie de masse, en particulier si l'échantillon n'est pas séparé à l'avance.

Sources

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Last Updated: Nov 26, 2019

Michael Greenwood

Written by

Michael Greenwood

Michael graduated from Manchester Metropolitan University with a B.Sc. in Chemistry in 2014, where he majored in organic, inorganic, physical and analytical chemistry. He is currently completing a Ph.D. on the design and production of gold nanoparticles able to act as multimodal anticancer agents, being both drug delivery platforms and radiation dose enhancers.

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