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Tecniche utilizzate nel delineamento mirato a di Metabolomic

Metabolomic che profila gli entrare in due categorie: metabolomics mirato a e untargeted. Il metabolomics di Untargeted si riferisce ad un'analisi completa di tutte le piccole molecole in una cella, in un tessuto, o in un organismo, mentre il metabolomics mirato a si riferisce alla presenza ed alla concentrazione di metaboliti specifici connessi con una malattia particolare.

Illustrazione del metabolomics - che può essere usata per studiare i metaboliti in una cella e per determinare lo stato di malattiaarleksey | Shutterstock

Il metabolome consiste di tutti i metaboliti in una cella, in un tessuto, o in un organismo. Dalla misurazione dal numero e dadel tipo di metaboliti in un organismo, o dal tessuto particolare di interesse, nel contesto di una malattia specifica, è possibile determinare lo stato di malattia dai metaboliti presenti.

Tecniche utilizzate nel delineamento del metabolita

Le tecniche analitiche per identificare i cambiamenti nella popolazione dei metaboliti comprendono la spettroscopia a risonanza magnetica nucleare, la spettrometria di massa, la spettroscopia infrarossa di trasformata di fourier e la cromatografia a fase mobile liquida. I metaboliti endogeni comprendono molte classi chimiche che richiedono i metodi analitici particolari per la riuscita identificazione.

In silico le librerie sono impiegate solitamente durante il metabolomics untargeted per identificare facilmente le specie chimiche. Sebbene vasto le quantità di dati grezzi generati spesso renda identificando i metaboliti particolari difficile. Ulteriormente, le piccole molecole presenti nelle alte concentrazioni occludono spesso la rilevazione di altre molecole meno comuni.

Nel delineamento metabolico mirato a, mentre i metaboliti di interesse sono conosciuti il preparato del campione e l'analisi può essere aerodinamico soltanto ai la maggior parte tecnica appropriata. Inoltre, gli standard interni possono essere usati per fornire i risultati quantitativi. Per esempio quando estrae un campione particolare del metabolita il protocollo può essere adattato per essere adatta idealmente alla polarità, al pH ed alla temperatura preferiti della molecola.

Come i metaboliti sono separati?

Poiché i campioni metabolomic sono altamente complessi, le tecniche di separazione sono usate per categorizzarle insieme e raggruppare. Quindi, i metodi di rilevazione specifici possono applicarsi alle molecole delle classi particolari ed il rapporto segnale-rumore può essere migliorato. La gascromatografia è ampiamente usata mentre offre la buona risoluzione cromatografica fra i metaboliti volatili e può combinarsi facilmente con spettrometria di massa o rilevazione di ionizzazione della fiamma. Le molecole meno volatili e polari sono separate solitamente da cromatografia liquida a alta pressione.

Come i metaboliti sono individuati?

La spettrometria di massa è usata per valutare per digitare e concentrazione di metaboliti, la separazione solitamente seguente da liquido o da gascromatografia. Il reticolo distinto di frammentazione generato dai metaboliti può essere paragonato alle raccolte di dati per determinare la loro identità. Gli sviluppi nelle tecniche di spettrometria di massa diminuiscono l'esigenza della separazione priore, poiché è sufficiente selettiva differenziarsi fra i metaboliti.

La spettroscopia a risonanza magnetica nucleare è egualmente comunemente usata identificare i metaboliti ed i metaboliti non devono essere separati prima di rilevazione mentre usando la spettroscopia a risonanza magnetica nucleare. Quindi, può recuperare il campione dopo l'analisi. Tutti i metaboliti sono capaci di rilevazione con le tecniche 1a risonanza magnetica nucleari 13ordinarie di C e di H, con l'alta riproducibilità analitica ed il preparato relativamente semplice del campione. Tuttavia, la quantità di dati generati è altamente complesso rispetto a spettrometria di massa, specialmente se il campione non è separato in anticipo.

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Last Updated: Nov 26, 2019

Michael Greenwood

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Michael Greenwood

Michael graduated from Manchester Metropolitan University with a B.Sc. in Chemistry in 2014, where he majored in organic, inorganic, physical and analytical chemistry. He is currently completing a Ph.D. on the design and production of gold nanoparticles able to act as multimodal anticancer agents, being both drug delivery platforms and radiation dose enhancers.

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