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Técnicas usadas no perfilamento visado de Metabolomic

Metabolomic que perfila quedas em duas categorias: metabolomics visado e untargeted. O metabolomics de Untargeted refere uma análise detalhada de todas as moléculas pequenas em uma pilha, em um tecido, ou em um organismo, quando o metabolomics visado referir a presença e a concentração de metabolitos específicos associados com uma doença particular.

Ilustração do metabolomics - que pode ser usada para estudar os metabolitos em uma pilha e para determinar o estado da doençaarleksey | Shutterstock

O metabolome consiste em todos os metabolitos em uma pilha, em um tecido, ou em um organismo. Pela medição do número e do tipo de metabolitos em um organismo, ou pelo tecido particular do interesse, no contexto de uma doença específica, é possível determinar o estado da doença dos metabolitos actuais.

Técnicas usadas no perfilamento do metabolito

As técnicas analíticas para identificar mudanças na população dos metabolitos incluem a espectroscopia da ressonância magnética nuclear, espectrometria em massa, Fourier-transformam a espectroscopia infravermelha, e a cromatografia líquida. Os metabolitos endógenos incluem muitas classes químicas que exigem métodos analíticos particulares para a identificação bem sucedida.

As bibliotecas são empregadas in silico geralmente durante o metabolomics untargeted para identificar facilmente a espécie química. Embora vasto as quantidades de dados brutos gerados fazem frequentemente identificando metabolitos particulares difícil. Adicionalmente, as moléculas pequenas actuais em concentrações altas fecham frequentemente a detecção de outras moléculas menos comuns.

No perfilamento metabólico visado, como os metabolitos do interesse são sabidos a preparação da amostra e a análise pode ser aerodinamizada somente à técnica a mais apropriada. Também, os padrões internos podem ser usados para fornecer resultados quantitativos. Por exemplo, ao extrair uma amostra particular do metabolito o protocolo pode ser costurado para serir idealmente a polaridade, o pH, e a temperatura preferidos da molécula.

Como os metabolitos são separados?

Desde que as amostras metabolomic são altamente complexas, as técnicas de separação são usadas para categorizá-las junto e agrupar. Assim, os métodos de detecção específicos podem ser aplicados às moléculas de classes particulares, e a relação de relação sinal-ruído pode ser melhorada. A cromatografia de gás é amplamente utilizada como oferece a boa definição cromatográfica entre metabolitos temporários, e pode facilmente ser combinada com a detecção da espectrometria em massa ou da ionização de chama. As moléculas menos temporárias e polares são separadas geralmente pela cromatografia líquida do elevado desempenho.

Como os metabolitos são detectados?

A espectrometria em massa é usada para avaliar para dactilografar e a concentração de metabolitos, separação geralmente seguinte pela cromatografia do líquido ou de gás. O teste padrão distinto da fragmentação gerado pelos metabolitos pode ser comparado com as bibliotecas de dados para determinar sua identidade. As revelações em técnicas da espectrometria em massa reduzem a necessidade para a separação prévia, desde que é suficientemente selectiva se diferenciar entre metabolitos.

A espectroscopia da ressonância magnética nuclear é igualmente de uso geral identificar metabolitos, e os metabolitos não precisam de ser separados antes da detecção ao usar a espectroscopia da ressonância magnética nuclear. Assim, pode recuperar a amostra depois da análise. Todos os metabolitos são capazes da detecção com técnicas 1da ressonância magnética 13nuclear ordinária de H e de C, com reprodutibilidade analítica alta e preparação relativamente simples da amostra. Contudo, a quantidade de dados gerados é altamente complexo comparado com a espectrometria em massa, particularmente se a amostra não é separada de antemão.

Fontes

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Last Updated: Nov 26, 2019

Michael Greenwood

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Michael Greenwood

Michael graduated from Manchester Metropolitan University with a B.Sc. in Chemistry in 2014, where he majored in organic, inorganic, physical and analytical chemistry. He is currently completing a Ph.D. on the design and production of gold nanoparticles able to act as multimodal anticancer agents, being both drug delivery platforms and radiation dose enhancers.

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