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Técnicas usadas en el perfilado apuntado de Metabolomic

Metabolomic que perfila caídas en dos categorías: metabolomics apuntado y untargeted. El metabolomics de Untargeted refiere a un análisis completo de todas las pequeñas moléculas en una célula, un tejido, o un organismo, mientras que el metabolomics apuntado refiere a la presencia y a la concentración de metabilitos específicos asociados a una enfermedad determinada.

Ejemplo del metabolomics - que se puede utilizar para estudiar los metabilitos en una célula y para determinar el estado de la enfermedadarleksey | Shutterstock

El metabolome consiste en todos los metabilitos en una célula, un tejido, o un organismo. Midiendo el número y el tipo de metabilitos en un organismo, o el tejido determinado del interés, en el contexto de una enfermedad específica, es posible determinar el estado de la enfermedad de los metabilitos presentes.

Técnicas usadas en el perfilado del metabilito

Las técnicas analíticas para determinar cambios en la población de metabilitos incluyen la espectroscopia de resonancia magnética nuclear, espectrometría de masa, Fourier-transforman la espectroscopia infrarroja, y la cromatografía líquida. Los metabilitos endógenos incluyen muchas clases químicas que requieran los métodos analíticos determinados para la identificación acertada.

In silico las bibliotecas se emplean generalmente durante metabolomics untargeted para determinar fácilmente especie química. Aunque sea extenso las cantidades de informaciones en bruto generadas a menudo hagan determinando los metabilitos determinados difícil. Además, las pequeñas moléculas presentes en altas concentraciones ocluyen a menudo la detección de otras moléculas menos comunes.

En el perfilado metabólico apuntado, como los metabilitos del interés se saben la preparación de la muestra y el análisis se puede aerodinamizar solamente a la técnica más apropiada. También, los patrones internos se pueden utilizar para ofrecer resultados cuantitativos. Por ejemplo, al extraer una muestra determinada del metabilito el protocolo se puede adaptar para adaptarse idealmente a la polaridad, al pH, y a la temperatura preferidos de la molécula.

¿Cómo se separan los metabilitos?

Puesto que las muestras metabolomic son altamente complejas, las técnicas de separación se utilizan para categorizarlas y para agrupar juntas. Así, los métodos de detección específicos se pueden aplicar a las moléculas de clases determinadas, y el ratio señal/ruido puede ser perfeccionado. La cromatografía de gas es ampliamente utilizada como ofrece la buena resolución cromatográfica entre los metabilitos volátiles, y se puede combinar fácilmente con espectrometría de masa o la detección de la ionización de la llama. Las moléculas menos volátiles y polares son separadas generalmente por cromatografía líquida del alto rendimiento.

¿Cómo se descubren los metabilitos?

La espectrometría de masa se utiliza para fijar para pulsar y la concentración de metabilitos, separación generalmente siguiente por cromatografía del líquido o de gas. La configuración distinta de la fragmentación generada por los metabilitos se puede comparar con las bibliotecas de datos para determinar su identidad. Los progresos en técnicas de la espectrometría de masa reducen la necesidad de la separación anterior, puesto que es suficientemente selectiva distinguir entre los metabilitos.

La espectroscopia de resonancia magnética nuclear es también de uso general determinar los metabilitos, y los metabilitos no necesitan ser separados antes de la detección mientras que usan la espectroscopia de resonancia magnética nuclear. Así, puede recuperar la muestra después del análisis. Todos los metabilitos son capaces de ser descubierto con técnicas 1de resonancia magnética nucleares 13ordinarias de H y de C, con alta reproductibilidad analítica y la preparación relativamente simple de la muestra. Sin embargo, la cantidad de datos generados es altamente complejo comparado con espectrometría de masa, determinado si la muestra no se separa de antemano.

Fuentes

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Last Updated: Nov 26, 2019

Michael Greenwood

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Michael Greenwood

Michael graduated from Manchester Metropolitan University with a B.Sc. in Chemistry in 2014, where he majored in organic, inorganic, physical and analytical chemistry. He is currently completing a Ph.D. on the design and production of gold nanoparticles able to act as multimodal anticancer agents, being both drug delivery platforms and radiation dose enhancers.

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