Le projet humain de Metabolome

Metabolomics est l'étude du metabolome, un numéro qui est caractérisé pendant qu'un ensemble complet de métabolites de faible poids moléculaire présentent dans les cellules, des tissus, des fluides biologiques, ou le fuselage.

Comparé à la génomique et à la protéomique, metabolomics est un inducteur relativement neuf, et beaucoup de tentatives ont été effectuées, et apparaissent toujours, pour donner effectivement le scénario métabolique complet des organismes vivants.

Puisque des concentrations et les activités des métabolites sont réglementées aux niveaux (proteomic) transcriptionnels (génomique) et de translation, le metabolomics est considéré en tant que des moyens efficaces de convertir les modifications génomiques et proteomic en phénotypes cellulaires particuliers, qui sont visibles dans les yeux nus.

Pour cette raison, le metabolomics devient une condition requise principale pour beaucoup d'inducteurs indépendamment de l'enseignement général, y compris le réglage de santé, les industries pharmaceutiques, la chimie clinique, les essais précliniques, et la toxicologie.

À la différence du génome humain, qui est maintenant entièrement ordonnancé et librement procurable, le metabolomics est toujours à son étape se développante.

Une difficulté principale en estimant des métabolites est que le nombre de métabolites n'est pas même en tous les tissus, car chaque tissu remplit différents fonctionnements métaboliques.

De plus, la concentration des métabolites n'est pas continuelle et ne continue pas à changer d'une remarque de temps à l'autre, selon la demande métabolique du fuselage. En dépit de ces barrières, beaucoup d'efforts couronnés de succès ont été effectués pour enrôler un numéro toujours croissant des métabolites.

Le projet humain de Metabolome

Le projet de Metabolome d'être humain (HMP) est une tentative qui a été entreprise pour faciliter la recherche de metabolomics.

Lancé en janvier 2005 et financé par le génome Canada, les objectifs principaux $7,5 millions du projet HMP comprennent : amélioration d'identification, de pronostic, et de surveillance de la maladie ; bilan de métabolisme et de toxicologie de médicament ; produire une tige entre le metabolome humain et le génome humain ; et le développement d'un logiciel pour le metabolomics.

Le projet est principalement recensement visé, mesure, diviseur, et enregistrer de toutes les métabolites qui pourraient être trouvées au corps humain aux concentrations plus grandes que 1 micromolar.

Le projet a également visé à produire une base de données humaine de Metabolome, une base de données électronique, pour rendre les caractéristiques librement procurables à tous les chercheurs.

De plus, HMP vise également à produire une bibliothèque humaine de Metabolome pour rendre tous les composés publiquement - procurables.

Ainsi, le centre primaire de HMP est de fournir des caractéristiques chimiques et des composés chimiques en communauté scientifique pour son utilisation dans la recherche et le milieu universitaire ; cependant, le projet ne se destine pas pour l'utilisation de tels composés chimiques pour l'identification et la caractérisation de la maladie.

La base de données humaine de Metabolome

La base de données de Metabolome d'être humain (HMDB) est une base de données électronique libre-accessible combinant la bio-informatique, l'informatique chimique, et l'informatique médicale.

La base de données contient l'information sur la concentration et la structure en métabolite, les enzymes ou les tambours de chalut associés, les propriétés physiologiques et liées à la maladie, et les voies de réaction chimique et métaboliques relatives.

La dernière version de la base de données, HMDB 4,0, également des caractéristiques spectrales comprend d'un grand nombre de MS/MS prévus (spectrométrie de masse) et de GC-MS (chromatographie gazeuse/spectrométrie de masse) référence et a prévu des structures de métabolite pour faciliter l'identification des métabolites nouvelles.

De plus, l'information sur des interactions métabolite-uniques de polymorphisme de nucléotide et l'effet des médicaments sur la métabolite concentration-sont également compris.

Actuellement, HMDB comprend des détails de 114.100 connus, prévues, et prévues métabolites. De plus, il contient résonance magnétique nucléaire expérimental mesurée et de calcul-prévue (NMR), des caractéristiques de spectres de référence de MS/MS, et de GC-MS de 351.754 métabolites ; détails métaboliques de voie de 25.700 métabolites ; et détails de 5.498 métabolites qui sont associées aux états pathologiques.

Selon la base de données, le nombre de métabolites en sérum humain, l'urine, le liquide céphalo-rachidien, la salive, la sueur, et les fèces sont 25.424, 4.225, 440, 1.234, 90, et 1.170, respectivement.

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Last Updated: Feb 26, 2019

Dr. Sanchari Sinha Dutta

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Dr. Sanchari Sinha Dutta

Dr. Sanchari Sinha Dutta is a science communicator who believes in spreading the power of science in every corner of the world. She has a Bachelor of Science (B.Sc.) degree and a Master's of Science (M.Sc.) in biology and human physiology. Following her Master's degree, Sanchari went on to study a Ph.D. in human physiology. She has authored more than 10 original research articles, all of which have been published in world renowned international journals.

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