Il progetto umano Metabolome

Metabolomics è lo studio sul metabolome, un numero che è caratterizzato mentre un insieme completo dei metaboliti a basso peso molecolare presenta nelle celle, nei tessuti, nei liquidi biologici, o nell'organismo.

Confrontato a genomica e al proteomics, il metabolomics è un campo relativamente nuovo e molti tentativi sono stati fatti ed ancora stanno emergendo, efficacemente per descrivere lo scenario metabolico completo degli organismi viventi.

Poiché le concentrazioni e le attività di metaboliti sono regolamentate sia ai livelli (proteomic) trascrizionali (genomica) che di traduzione, il metabolomics è considerato come mezzi efficienti di conversione genomica e proteomic si trasforma i fenotipi cellulari particolari, che sono visibili in occhi nudi.

Per questo motivo, il metabolomics sta trasformandosi in in un requisito principale per molti campi oltre ad istruzione generale, compreso la regolazione di sanità, le industrie farmaceutiche, la chimica clinica, le prove precliniche e la tossicologia.

A differenza del genoma umano, che ora completamente è ordinato e liberamente disponibile, il metabolomics è ancora nella sua fase di sviluppo.

L'una difficoltà più grave nella stima dei metaboliti è che il numero dei metaboliti non è stesso in tutti i tessuti, poichè ogni tessuto servisce le funzioni metaboliche differenti.

Inoltre, la concentrazione di metaboliti non è costante e non continua cambiare da un punto di volta ad un altro, secondo la domanda metabolica dell'organismo. Malgrado queste transenne, molti riusciti sforzi sono stati fatti per arruolare un numero sempre crescente dei metaboliti.

Il progetto umano Metabolome

Il progetto Metabolome dell'essere umano (HMP) è un tentativo che è stato deciso per aiutare la ricerca di metabolomics.

Lanciato nel gennaio 2005 e costituito un fondo per dal genoma Canada, gli obiettivi principali $7,5 milioni del progetto HMP includono: miglioramento nell'identificazione, nella prognosi e nel video di malattia; valutazione del metabolismo e della tossicologia della droga; creazione del collegamento fra il metabolome umano ed il genoma umano; e lo sviluppo di un software per il metabolomics.

Il progetto è soprattutto l'identificazione puntata su, quantificare, indicizzare e memorizzare di tutti i metaboliti che potrebbero essere trovati nel corpo umano alle concentrazioni maggiori di 1 micromolar.

Il progetto egualmente ha mirato a creare un database umano di Metabolome, un database elettronico, per mettere a disposizione i dati liberamente di tutti i ricercatori.

Inoltre, HMP egualmente mira a creare una libreria umana di Metabolome per mettere a disposizione tutti i composti pubblicamente -.

Quindi, il fuoco primario di HMP è di fornire i dati chimici ed i composti chimici in comunità scientifica per la sua utilizzazione nella ricerca e nell'università; tuttavia, il progetto non è inteso per l'utilizzazione di tali composti chimici per l'identificazione e la caratterizzazione di malattia.

Il database umano di Metabolome

Il database di Metabolome dell'essere umano (HMDB) è un database elettronico libero-accessibile che combina la bioinformatica, l'informatica chimica e l'informatica medica.

Il database contiene le informazioni su concentrazione e struttura nel metabolita, enzimi o trasportatori associati, beni fisiologici e in relazione con la malattia e vie metaboliche chimiche relative e del reazione.

L'ultima versione del database, HMDB 4,0, egualmente comprende dati spettrali di un riferimento di tantissimi MS/MS preveduti (spettrometria di massa) e di GC-MS (spettrometria della cromatografia-massa del gas) ed ha predetto le strutture del metabolita per facilitare l'identificazione dei metaboliti novelli.

Inoltre, le informazioni sulle metabolita-singole interazioni di polimorfismo del nucleotide e l'effetto delle droghe su metabolita concentrazione-egualmente sono inclusi.

Attualmente, HMDB comprende i dettagli di 114.100 conosciuti, metaboliti previsti e e preveduti. Inoltre, contiene i dati a risonanza magnetica, di GC-MS nucleari sperimentalmente (NMR) misurati e di calcolo-predetti e di MS/MS di riferimento di spettri di 351.754 metaboliti; i dettagli metabolici di via di 25.700 metaboliti; ed i dettagli di 5.498 metaboliti che sono associati con le circostanze malate.

Secondo il database, il numero dei metaboliti in siero umano, l'urina, il liquido cerebrospinale, la saliva, il sudore e le feci sono 25.424, 4.225, 440, 1.234, 90 e 1.170, rispettivamente.

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Last Updated: Feb 26, 2019

Dr. Sanchari Sinha Dutta

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Dr. Sanchari Sinha Dutta

Dr. Sanchari Sinha Dutta is a science communicator who believes in spreading the power of science in every corner of the world. She has a Bachelor of Science (B.Sc.) degree and a Master's of Science (M.Sc.) in biology and human physiology. Following her Master's degree, Sanchari went on to study a Ph.D. in human physiology. She has authored more than 10 original research articles, all of which have been published in world renowned international journals.

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