Le je-motif dans l'ADN

Les séquences d'ADN riches de cytosine peuvent plier dans une structure appelée un je-motif. Ces structures apparaissent type dans des régions de promoteur sur l'ADN, et sont pensées pour aider avec le règlement de gène.

L'impression d'un artiste de la structure du je-motif ADN à l'intérieur des cellules, avec l'outil basé sur anticorps utilisé pour le trouver. Crédit d'image : Chris Hammang/Shutterstock

Environ 98% de l'ADN se compose des régions de non-codage, qui sont souvent impliquées dans le règlement transcriptionnel et de translation du génome. Ces régions se composent des séquences répétitives.

B-DNA, ou la double helice droitière, est la structure d'ADN la plus répandue dans des conditions physiologiques normales. Mais dans des conditions spécifiques, l'ADN peut se plier dans l'épingle à cheveux ou les structures de Z ADN où l'ADN a une torsion gauchère avec un réseau général de phosphate de sucre de zigzag.

Les structures Non-B-ADN peuvent mener à l'instabilité génomique et aux troubles. Les séquences riches en g peuvent se plier dedans à un G-quadruplex appelé de la structure non-B-ADN. Ces structures ont été trouvées in vivo également car elles sont stables à la température physiologique et au pH.

De même, les régions riches en c peuvent se plier dedans à un je-motif de structure ou un i-tetraplex ou un je-ADN appelé. Ce sont quatre structures échouées d'ADN qui sont liées par l'intercalation des paires de bases de cytosine.

Structure du je-motif

Le je-motif est une structure tetrameric ou par quatre échouée se composant de deux duplex parallèles (doubles boucles) avec la séquence d (TCCCCC). Les deux duplex combinent d'une façon antiparallèle dans le je-motif. Cette combinaison se produit par l'intercalation ou la mise en place des paires de bases de cytosine-cytosine.

Pour la structure à la forme, une de la cytosine dans les paires de bases doit protonated et l'autre doit des paires de bases de B. cc sont collées par trois liaisons hydrogènes, qui forment des obligations plus intenses que des paires conventionnelles de CHROMATOGRAPHIE GAZEUSE. L'énergie de paire de bases de l'obligation de cc dans un motif d'I est 169,7 kJ/mol, alors que l'énergie de paire de bases de la paire de bases de CHROMATOGRAPHIE GAZEUSE de torticolis de Watson est 96,6 kJ/mol.

La structure du je-motif a été trouvée utilisant RMN, où on l'a constaté que la longueur des séquences de cytosine s'est échelonnée de 3 à 12 bases, et elle peut également avoir des résidus de thymines entre les séquences de cytosine. L'intercalation dans les je-motifs peut se produire dans différentes voies menant à la formation de la forme deux ; r de s et S-formes.

Le je-motif de ` de nom' chosed car c'est la seule structure d'acide nucléique avec les paires de bases intercalées. Bien qu'il y ait un manque d'empiler des interactions entre les paires de bases consécutives, le ch intermoléculaire··Le réseau d'adhérence d'hydrogène d'O entre le sucre de deoxyribose du réseau général antiparallèle stabilise la structure.

Le protonation de la cytosine réduit la charge négative du réseau général et facilite la formation de la structure fourrure-échouée. La distance de paire de bases est 3,1 Å qui est assimilée à A-DNA (2,1 Å). La torsion hélicoïdale entre la paire de bases de cc est plus petite que B-DNA (motif d'I : 12−16°, B-DNA : 36°).

Stabilité du je-motif

La stabilité d'une structure est habituellement déterminée par son point de fusion, ou le TM, qui est la température à laquelle des passages pliés d'une structure à une condition dévoilée. Ceci peut être induit en chauffant l'échantillon d'ADN. Ce passage est mesuré utilisant l'absorption moléculaire ou les techniques circulaires de dichroïsme et est connu comme température de la fonte (le TM).

Le TM d'un ADN échantillonnent est dicté par sa séquence de nucléotides et concentration ionique. Pendant qu'une des bases de c protonated, le pH du support joue un rôle critique dans la stabilité de je-ADN. À pH 4-7, les bases protonated partiellement et les je-structures forment.

Si le pH augmente, les bases de C subissent le deprotonation et la structure se démêle. Si le pH est si bas, toutes les C-bases protonated et ainsi ne forment pas la structure échouée par quatre. Ce contraste avec les paires de bases de Watson et de torticolis, dont la stabilité ne dépend pas du pH du support.

Le nombre de paires de bases de cc détermine également la stabilité des je-motifs. La présence de six ou moins de bases de C mènent au pliage intermoléculaire des je-motifs, alors que plus longtemps que six résidus de C introduisent la formation du pliage intramoléculaire des je-motifs.

Je-ADN contre des structures de torticolis de Watson

Les études ont vérifié la présence relative des structures de tetraplex (des je-motifs et G-quadraplex) et des duplex de Watson-Torticolis. On l'a constaté qu'à pH physiologique, les structures duplex dominées, alors qu'au pH inférieur que 5, les structures de tetraplex étaient prédominants.

La concentration des structures de tetraplex à pH 7 et à 25°C était moins de 10% proposant la dominance des structures duplex in vivo en conditions physiologiques.  

In vivo présence de je-ADN

Bien que les paires de bases de torticolis de Watson soient plus stables en conditions physiologiques, les études ont vérifié la présence de je-ADN in vivo. Une des possibilités est celle pendant la transcription et la réplication, ADN subit supercoiling négatif qui pourrait introduire la formation des je-motifs.

Dans différentes conditions, le pH physiologique d'une cellule est modifié, introduisant potentiellement la formation des je-motifs. Par exemple, des cancers sont associés à pH intracellulaire inférieur (6.7-7.1). En outre, certains processus cellulaires peuvent mener à l'acidification temporaire de la cellule qui peut également introduire la formation passagère de ces structures. Récent utilisant les anticorps qui identifient particulièrement des je-motifs dans l'ADN, les chercheurs ont recensé des je-motifs dans les noyaux et les régions de réglementation, y compris des promoteurs et des télomères.

Last Updated: Feb 26, 2019

Dr. Surat P

Written by

Dr. Surat P

Dr. Surat graduated with a Ph.D. in Cell Biology and Mechanobiology from the Tata Institute of Fundamental Research (Mumbai, India) in 2016. Prior to her Ph.D., Surat studied for a Bachelor of Science (B.Sc.) degree in Zoology, during which she was the recipient of an Indian Academy of Sciences Summer Fellowship to study the proteins involved in AIDs. She produces feature articles on a wide range of topics, such as medical ethics, data manipulation, pseudoscience and superstition, education, and human evolution. She is passionate about science communication and writes articles covering all areas of the life sciences.  

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    P, Surat. (2019, February 26). Le je-motif dans l'ADN. News-Medical. Retrieved on June 26, 2019 from https://www.news-medical.net/life-sciences/The-i-motif-in-DNA.aspx.

  • MLA

    P, Surat. "Le je-motif dans l'ADN". News-Medical. 26 June 2019. <https://www.news-medical.net/life-sciences/The-i-motif-in-DNA.aspx>.

  • Chicago

    P, Surat. "Le je-motif dans l'ADN". News-Medical. https://www.news-medical.net/life-sciences/The-i-motif-in-DNA.aspx. (accessed June 26, 2019).

  • Harvard

    P, Surat. 2019. Le je-motif dans l'ADN. News-Medical, viewed 26 June 2019, https://www.news-medical.net/life-sciences/The-i-motif-in-DNA.aspx.

Comments

The opinions expressed here are the views of the writer and do not necessarily reflect the views and opinions of News-Medical.Net.
Post a new comment
Post