Avertissement : Cette page est une traduction automatique de cette page à l'origine en anglais. Veuillez noter puisque les traductions sont générées par des machines, pas tous les traduction sera parfaite. Ce site Web et ses pages Web sont destinés à être lus en anglais. Toute traduction de ce site et de ses pages Web peut être imprécis et inexacte, en tout ou en partie. Cette traduction est fournie dans une pratique.

Analyse de transcriptome de Tissu-Détail

Le transcriptome est l'ensemble complet de l'ARN messager (ARNm) qu'une cellule a transcrit. Analyser le transcriptome montre aux gènes ce qui sont activement exprimés et peuvent pour cette raison donner des résultats hautement instructifs pour des biologistes.

Lié aux protéines à l
Crédit d'image : Juan Gaertner/Shutterstock

Ordonnancement de la deuxième génération pour l'analyse de transcriptome

Limitations des méthodes précédentes

Les puces ADN étaient la méthode habituelle pour l'analyse de transcription, mais elle a fait face à plusieurs inconvénients, tels que des éditions d'hybridation, des éditions de dépistage, et des contraintes sur tracer les gènes précédemment unmapped. Ces limitations ont limité l'analyse de tous les gènes dans un grands génome et dépistage des gènes rares mais physiologique appropriés dans le transcriptome.

Fonctionnement de prévision de cellules

Le transcriptome peut nous fournir des informations sur ce que la cellule activement fait ou fera à l'avenir. Il spécifie également l'identité d'une cellule.

La conclusion et annotation du transcriptome en tissus élucide quels gènes sont exprimés, et leur fonctionnement expérimental.

Ceci a été au commencement essayé dans des organismes plus simples, tels que la levure, mais a été appliqué à différents tissus actuels dans les centrales et les mammifères.

ordonnancement d'ADNc

Une technique de NGS employée pour caractériser le transcriptome est ordonnancement d'ADNc. Cette méthode tient compte de l'ARN, ou de la simple présence, pour être enregistrée et employée pour la comparaison avec d'autres échantillons ou échantillons de contrat à terme.

L'ordonnancement peut être fait sur les tissus différents d'un organisme pour comparer et découvrir des configurations d'expression de tissu-détail.

Applications des analyses de transcriptome

Étude du règlement de gène

l'analyse de transcriptome de Tissu-détail par l'intermédiaire de la technologie de NGS a été essayée sur un certain nombre d'organismes de complexité variable.

Un des projets plus ambitieux a été fait sur des souris, où le tissu de foie, le tissu de muscle squelettique, et le tissu cérébral entier se sont analysés.

Ceci a étendu notre courant comprenant en fournissant des informations pour un meilleur modèle des gènes dans le génome de souris, ainsi que comment ceux-ci diffèrent par le type de tissu.

Parmi ces découvertes étaient 5' neuf ou oblong les exons, qui sont les bornes principales des promoteurs. C'est utile pour vérifier le règlement et les interactions de gènes entre les facteurs de réglementation.

Trouver des événements de épissure

La clavette avec employer l'ARN de NGS ordonnançant la méthode plutôt que des puces ADN était le dépistage des événements de épissure. Les événements de épissure se produisent pendant que l'ARNm neuf transcrit mûrit dans l'ARNm mature.

Les puces ADN peuvent seulement trouver des événements de épissure pendant des états personnalisés, et pas pendant l'utilisation courante. Cependant, NGS peut trouver dans l'abondance élevée RNAs.

Les scientifiques examinent maintenant pour caractériser davantage ces événements de épissure et leurs formes à l'aide d'autres formes de l'ARN ordonnançant la technologie.

Recherche vieillissante

Une théorie dans le domaine de est au sujet de la restriction diététique, où l'utilisation de moins de nourriture sans être sous-alimentée peut étendre la durée de vie tout en réduisant la forme physique dans la jeunesse.

Les réactions par le transcriptome à la restriction diététique ont été étudiées tout récemment au niveau cellulaire et organismal, mais à un niveau du tissu.

La restriction diététique est censée pour fonctionner par l'objectif de la signalisation (TOR) de Rapamycin, par les acides aminés essentiels qui peuvent -régler le MASSIF DE ROCHE.

Analyser des transcriptomes de tissu-détail dans la drosophile a confirmé qu'un des effets de la restriction diététique est signalisation réduite de MASSIF DE ROCHE, en plus de confirmer un rôle pour la famille de GATA factorise comme régulateurs.

Les tissus ont répondu séparé à la restriction diététique, particulièrement par l'intermédiaire des facteurs de GATA.

La constatation que les tissus répondent indépendamment à la restriction diététique implique que la manipulation génétique de tissu-détail peut permettre à la longueur de durée d'être étendue tout en évitant les réductions de forme physique.

Recherche de centrale

La science des plantes emploie également les développements dans NGS et l'ARN ordonnançant pour comprendre davantage la croissance et la réaction de plantes à l'environnement.

Les centrales se fondent fortement sur leur capacité de répondre et s'adapter à leur environnement, puisqu'elles ne peuvent pas le changer ou s'éloigner de lui. La tension de sel est un tel stress environnemental avec des effets sévères sur l'accroissement et la reproduction.

l'analyse de transcriptome de Tissu-détail a été appliquée aux jeunes plantes d'euphratica de Populus, un type de saule. Ils ont trouvé 2000-6000 différentiel gènes exprimés dans les tissus de lame, de phloème, de xylème et de fond.

Différentiel les gènes exprimés pendant la tension de sel ont différé entre les tissus, concernant l'activité de transport de membrane dans la lame et les procédés d'oxydation/réduction dans le tissu de fond.

On lui a également proposé que la divergence des configurations d'expression différentiel des gènes exprimés puisse améliorer la tolérance pour saler la tension en mettant à jour l'homéostasie des ions et des espèces réactives de l'oxygène.

Further Reading

Last Updated: Aug 28, 2018

Sara Ryding

Written by

Sara Ryding

Sara is a passionate life sciences writer who specializes in zoology and ornithology. She is currently completing a Ph.D. at Deakin University in Australia which focuses on how the beaks of birds change with global warming.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Ryding, Sara. (2018, August 28). Analyse de transcriptome de Tissu-Détail. News-Medical. Retrieved on September 22, 2021 from https://www.news-medical.net/life-sciences/Tissue-Specific-Transcriptome-Analysis.aspx.

  • MLA

    Ryding, Sara. "Analyse de transcriptome de Tissu-Détail". News-Medical. 22 September 2021. <https://www.news-medical.net/life-sciences/Tissue-Specific-Transcriptome-Analysis.aspx>.

  • Chicago

    Ryding, Sara. "Analyse de transcriptome de Tissu-Détail". News-Medical. https://www.news-medical.net/life-sciences/Tissue-Specific-Transcriptome-Analysis.aspx. (accessed September 22, 2021).

  • Harvard

    Ryding, Sara. 2018. Analyse de transcriptome de Tissu-Détail. News-Medical, viewed 22 September 2021, https://www.news-medical.net/life-sciences/Tissue-Specific-Transcriptome-Analysis.aspx.

Comments

The opinions expressed here are the views of the writer and do not necessarily reflect the views and opinions of News Medical.