Avertissement : Cette page est une traduction automatique de cette page à l'origine en anglais. Veuillez noter puisque les traductions sont générées par des machines, pas tous les traduction sera parfaite. Ce site Web et ses pages Web sont destinés à être lus en anglais. Toute traduction de ce site et de ses pages Web peut être imprécis et inexacte, en tout ou en partie. Cette traduction est fournie dans une pratique.

Synthèse d'approche hiérarchisée

L'approche hiérarchisée à la biologie de systèmes reconstruit les réseaux métaboliques par des caractéristiques telles que des protéomiques et le transcriptomics.

Crédit : VectorFrenzy/Shutterstock.com

Il diffère de l'approche ascendante, qui construit également l'information biologique de voie liée aux procédés physiologiques. L'approche hiérarchisée a été historiquement utilisée dans des méthodologies tôt de séquençage du génome et maintenant est utilisée en détaillant en outre la caractérisation structurelle des acides nucléiques.

L'inducteur de la protéomique en particulier est révolutionné par une approche hiérarchisée pour produire des plans de proteoform sans n'importe quelle perte d'information.

Approches hiérarchisées et ascendantes à la biologie de systèmes

La biologie de systèmes est l'inducteur de la modélisation numérique des systèmes biologiques et a été employée pour déterminer les interactions macromoléculaires complexes qui se produisent dans un organisme.

Le comportement métabolique de la cellule et des modèles établis pour la comprendre peut être approché dans deux directionnalités opposées. L'approche ascendante entoure la reconstruction de projet des réseaux qui peuvent être simulés dans des conditions physiologiques variées.

La collecte des informations de toute l'information d'organisme-détail est compilée dans un modèle de génome-écaille ayant été extrait par des outils logiciels de bio-informatique. En revanche, l'approche hiérarchisée reconstruit les réseaux métaboliques caractéristiques d'omics expérimental de ` des'.

Des interactions fondamentales peuvent être comprises du flux de transfert du protéome ou du transcriptome aux voies métaboliques simulées. Omics de `' eu besoin pour cette approche est produit à partir de la technologie courante telle que des puces ADN d'ADN et des spectromètres de masse.

Approche hiérarchisée au séquençage du génome

On peut observer un exemple d'une approche hiérarchisée dans l'ordonnancement hiérarchique de fusil de chasse. Avant d'être tondue dans de plus petits éclats et remontage, un plan à basse résolution du génome entier est produit.  Cette technique a été employée pendant les jours les plus tôt du séquençage du génome quand un minimum d'ordonnancement élevé de débit a été exigé.

En produisant un plan entier de génome d'abord, il est possible de former une suite d'éclats superposants, n'exigeant pour cette raison pas des algorithmes d'ensemble de séquence. On pourrait alors choisir un numéro minimal des éclats qui enjambent le chromosome entier. Historiquement, l'avènement de l'ordonnancement entier de fusil de chasse de génome a remonté le fusil de chasse hiérarchique ordonnançant comme méthode primaire pour ordonnancer des génomes, bien que le projet génome humain qui a été rempli en 2003 ait utilisé la méthode ancienne.

Approche hiérarchisée à la spectrométrie de masse

On peut observer une approche hiérarchisée à la spectrométrie de masse dans l'analyse des biomolécules intacts qui sont une partie d'un composé plus grand. La spectrométrie de masse tandem est utilisée pour l'identification de DNA/RNA.

Cette méthode a un avantage par rapport aux méthodes d'analyse biochimiques conventionnelles par sa capacité de déterminer des modifications avec une sensibilité plus grande. Les ions réduits en fragments recensés fournissent une caractérisation structurelle des acides nucléiques qui peuvent être utilisés dans le développement de la future thérapie génique.  

L'approche hiérarchisée fournit également une clarté plus grande des modifications aux acides nucléiques qui se produisent en nature. L'ajout des groupes de modification est lié aux changements de stabilité et à une modification consécutive de fonctionnement. En traçant les mécanismes de fragmentation des ions d'acide nucléique, le soutien de biomechanism a observé que des modifications de stabilité peut être comprise et utilisée dans des modifications artificielles possibles.

Approche hiérarchisée à la protéomique par la spectrométrie de masse

L'approche hiérarchisée le plus couramment utilisée est dans le domaine de la protéomique. Considérant que la spectrométrie de masse ascendante assimile conventionnel des protéines dans des peptides pour l'identification, la protéomique hiérarchisée introduit les protéines intactes au spectromètre de masse avec les masses entières et réduites en fragments d'ion mesurées.

Avec la plus grande compréhension de la complexité de protéine, le mappage de proteoform sans n'importe quelle perte d'information est essentiel. Le risque de petits groupes importants tels que des variantes de séquence étant détruits sur les peptides indépendants est évité par l'utilisation d'une approche hiérarchisée.

Avances au moyen hiérarchisé de spectrométrie de masse que le mappage de plus grands composés de protéome est maintenant possible. Ceci a des ramifications importantes pour le contrat à terme de la thérapeutique de protéine, en particulier le développement de plus grands médicaments à base de protéines qui exigeront des tests en général et en termes de ses composantes moléculaires.

Further Reading

Last Updated: Feb 26, 2019

Shelley Farrar Stoakes

Written by

Shelley Farrar Stoakes

Shelley has a Master's degree in Human Evolution from the University of Liverpool and is currently working on her Ph.D, researching comparative primate and human skeletal anatomy. She is passionate about science communication with a particular focus on reporting the latest science news and discoveries to a broad audience. Outside of her research and science writing, Shelley enjoys reading, discovering new bands in her home city and going on long dog walks.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Stoakes, Shelley Farrar. (2019, February 26). Synthèse d'approche hiérarchisée. News-Medical. Retrieved on April 11, 2021 from https://www.news-medical.net/life-sciences/Top-Down-Approach-Overview.aspx.

  • MLA

    Stoakes, Shelley Farrar. "Synthèse d'approche hiérarchisée". News-Medical. 11 April 2021. <https://www.news-medical.net/life-sciences/Top-Down-Approach-Overview.aspx>.

  • Chicago

    Stoakes, Shelley Farrar. "Synthèse d'approche hiérarchisée". News-Medical. https://www.news-medical.net/life-sciences/Top-Down-Approach-Overview.aspx. (accessed April 11, 2021).

  • Harvard

    Stoakes, Shelley Farrar. 2019. Synthèse d'approche hiérarchisée. News-Medical, viewed 11 April 2021, https://www.news-medical.net/life-sciences/Top-Down-Approach-Overview.aspx.

Comments

The opinions expressed here are the views of the writer and do not necessarily reflect the views and opinions of News Medical.