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Types de puce ADN

La puce ADN ou la biopuce est un guide orienté laboratoire de microscope qui est habituellement fait de glace, puce de silicium, ou membrane en nylon. C'est un 2D choix (parfois 3D) dont la surface est équipée de milliers de pores minuscules en positions définies.

La puce ADN est une technologie développée récemment et a été découverte il y a seulement pendant deux décennies. Elle est en grande partie employée dans la cancérologie et dans la demande de règlement pharmacologique d'autres maladies comme les lésions orales. Elle permet à des chercheurs de vérifier et analyser l'expression des milliers de gènes dans une réaction unique et d'aborder les éditions variées.

Un guide de puce ADN de tissu.

Source : droit d'auteur de http://tmalab.jhmi.edu : Laboratoire de puce ADN de tissu de Johns Hopkins

Cette technologie fonctionne sous le principe (aussi des boucles grippantes d'hybridation appelée) des séquences complémentaires d'ADN (ADNc) les uns avec les autres. La puce ADN a deux catégories grandes, basées sur son mode de préparation et sur les types de sondes utilisées.

Catégorie de puce ADN basée sur le mode de la préparation

Basé sur le mode de la préparation du choix, des puces ADN sont divisées en trois types :

  1. Le choix repéré sur la glace : les choix repérés sont des choix effectués sur les guides en verre de microscope vêtus parlysine. Ceci fournit le grippement de la haute densité ADN à l'aide des chevilles encochées. Il permet le marquage fluorescent de l'échantillon.
  2. choix Auto-montés : ce sont des choix de fibre optique effectués par le dépôt de l'ADN synthétisé sur de petits talons de polystyrène. Les talons sont déposés sur les fins repérées du choix. L'ADN différent peut être synthétisé sur différents talons et appliquer un mélange des talons au câble fibre optique effectuera un choix fait au hasard assemblé.
  3. Choix synthétisés in-situ : ces choix sont effectués par synthèse chimique sur un substrat solide. Dans la synthèse chimique, des groupes protecteurs photolabiles sont combinés avec la photolithographie pour exécuter l'action. Ces choix sont employés dans l'analyse de l'expression, le génotypage, et l'ordonnancement.

Catégorie de puce ADN basée sur les types de sondes utilisées

Basé sur les types de sondes utilisées, les puces ADN sont de douze types différents :

  1. Puces ADN d'ADN : La puce ADN d'ADN est également connue comme frite de gène, frite d'ADN, ou biopuce. Elle mesure l'ADN ou emploie l'ADN comme partie de son système de dépistage. Il y a quatre types différents de puces ADN d'ADN : puces ADN d'ADNc, puces ADN oligo d'ADN, puces ADN de BAC et puces ADN de SNP.
  2. MMChips : MMchip permet l'analyse intégratrice des caractéristiques de multiplateforme et d'entre-laboratoire. Il étudie des interactions entre l'ADN et la protéine. la Frite-frite (immunoprécipitation de chromatine (ChIP) suivie de l'hybridation de choix) et Frite-seq (frite suivie massivement du parallèle ordonnançant) sont les deux techniques utilisées.
  3. Puces ADN de protéine : elle agit en tant que plate-forme pour la caractérisation des centaines de milliers de protéines d'une voie hautement parallèle. La puce ADN de protéine est de trois types, et ce sont des puces ADN analytiques de protéine, des puces ADN fonctionnelles de protéine et des puces ADN de protéine d'inverse-phase.
  4. Puces ADN de peptide : ces types de choix sont employés pour les analyses détaillées ou l'optimisation des interactions protéine-protéine. Il aide en la reconnaissance d'anticorps en examinant des protéomes.
  5. Puces ADN de tissu : les cases de paraffine de puce ADN de tissu qui sont constituées en séparant le tissu cylindrique creuse des donneurs variés et de l'encastrer dans une puce ADN unique. Ceci est principalement employé en pathologie.
  6. Puces ADN cellulaires : elles sont également des puces ADN appelées ou des vivre-cellule-puces ADN de transfection, et sont employées pour protéger le produit chimique de grande puissance et les bibliothèques génomiques et vérifier systématiquement le micro-environnement cellulaire local.
  7. Puces ADN de composé chimique : ceci est employé pour le dépistage des drogues et la découverte de médicaments. Cette puce ADN a la capacité de recenser et évaluer des petites molécules et ainsi il est plus utile que les autres technologies utilisées dans l'industrie pharmaceutique.
  8. Puces ADN d'anticorps : elles désigné également sous le nom du choix d'anticorps ou de la frite d'anticorps. Ce sont des puces ADN de protéine-détail qui contiennent une collection d'anticorps de saisie mis à l'intérieur d'un guide de microscope. Elles sont employées pour trouver des antigènes.
  9. Choix d'hydrate de carbone : ils sont également les glycoarrays appelés. Des choix d'hydrate de carbone sont employés dans les protéomes d'examen critique qui sont grippement d'hydrate de carbone. Ils peuvent également être utilisés dans des affinités obligatoires de protéine calculatrice et l'automization de la synthèse de solide-support pour des glycans.
  10. Puces ADN de phénotype : des puces ADN ou le PMs de phénotype sont principalement employés dans le développement de médicament. Elles mesurent quantitativement des milliers de phénotypes cellulaires d'un seul trait. Il est également employé dans la génomique fonctionnelle et le contrôle toxicologique.
  11. Puces ADN inverses de protéine de phase : elles sont des puces ADN des lysates ou du sérum. En grande partie utilisé dans les tests cliniques, particulièrement dans le domaine du cancer, elles ont également des utilisations pharmaceutiques. Dans certains cas, elles peuvent également être employées dans l'étude des biomarqueurs.
  12. Détecteur ou IRIS interférométrique de représentation de réflectivité : L'IRIS est un biocapteur qui est employé pour analyser la protéine-protéine, l'ADN-protéine, et les interactions de DNA-DNA. Il ne se sert pas des marques fluorescentes.  Il est fait de substrats2 de Si/SiO préparés par la tache robotisée.

SOURCES :

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Last Updated: Feb 26, 2019

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