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Usando dispersar de radiografía del Pequeño-Ángulo (SAXS) al metabolismo del estudio

El dispersar de radiografía del Pequeño-Ángulo (SAXS) es un método usado para cuantificar diferencias del nanoscale en la densidad de una muestra. Este método está ganando importancia en el campo del metabolomics, para la evaluación del estado metabólico y de desordenes relacionados.

SAXS se puede utilizar para estudiar la estructura de proteínas, incluyendo apolipoproteinsmolekuul_be | Shutterstock

¿Cuál es el dispersar de radiografía del Pequeño-Ángulo?

SAXS es una técnica el dispersar de radiografía que mide dispersar de elástico de radiografías cuando está viajando a través de un material. Aunque sea fundamental similar a la difracción de radiografía, hay también algunas diferencias distintas.

Ambos métodos emplean un haz de radiografía intenso, pero en SAXS la molécula de la muestra está en la solución. Esto está en contraste con la difracción de radiografía, donde la muestra se embute en un cristal. La difracción de radiografía rinde a menudo un ratio señal/ruido más de alta resolución y mejor pero hay ciertas proteínas que son flexibles y no cristalizan fácilmente. Para tales moléculas, el dispersar de radiografía del pequeño-ángulo puede ser aplicado.

Mecanismo de dispersar de radiografía del Pequeño-Ángulo

SAXS se basa en diferencias en cambio. La señal se deriva de la diferencia en la densidad de electrón media del disolvente y el soluto o la proteína. Esta diferencia en la densidad se basa en la composición del disolvente y la concentración de la muestra. La colección de datos se basa en restar los datos obtenidos del almacenador intermedio “en blanco” y de la muestra.

Es importante medir el espacio en blanco exacto, pues incluso las pequeñas diferencias en la composición del almacenador intermedio pueden afectar a los datos el dispersar de radiografía del pequeño-ángulo. También, el ángulo inferior que dispersa datos se puede contaminar por las radiografías unscattered. Así, la estación experimental se debe fijar cuidadosamente para asegurar la contaminación mínima.

Usando dispersar de radiografía del Pequeño-Ángulo para revelar la estructura de lipoproteínas

Apolipoproteins se ha mostrado para emulsionar los lípidos y para tener papeles protectores contra enfermedades cardiovasculares y obesidad. Actúan como andamios estructurales y pueden activar el lipoproteína-modelado de factores. Pueden también obrar recíprocamente con las proteínas de la superficie de la célula para modular metabolismo de la lipoproteína.

Pues tienen gran importancia en biología del lípido, es importante conocer la estructura de apolipoproteins. Sin embargo, muchas de la transición de los apolipoproteins entre uno mismo-asociado declaran, por ejemplo los dimeros, los trímeros, los tetrámeros etc. Así, es difícil caracterizar su estructura.

Una manera es estabilizar una forma oligomérica determinada usando mutagénesis sitio-dirigida. Sin embargo, este método ha drenado críticas pues tiene el potencial de alterar la conformación de la proteína junto con el estado oligomérico.

Un estudio reciente realizó SAXS en un apolipoprotein integral, apoA-IV. Usando este método, los autores podían visualizar el integral de la proteína junto con sus variantes del truncamiento. Podían también analizar cómo los términos afectan a la conformación de la estructura en conjunto. La comprensión de la estructura también ofrece una pista a cómo la proteína funciona en diversos procesos metabólicos.

¿Cómo se puede SAXS utilizar para entender las acciones recíprocas entre la comida digerida?

Un estudio reciente utilizó SAXS para investigar cómo caseinophosphopeptides (CPP), un producto digerido importante de la leche, y kitosán interactivo en condiciones gastrointestinales simuladas. Hay un cambio en valor de pH pues la comida pasa del estómago al intestino delgado, y este cambio de pH induce la formación de un complejo entre los caseinophosphopeptides y el kitosán. Esta formación compleja es impulsada por acciones recíprocas electroestáticas entre estas dos moléculas. SAXS fue utilizado para caracterizar la estructura de estos complejos.

SAXS también fue utilizado para estudiar cómo los polifenoles, una clase de microalimentos, obran recíprocamente con CRPP y el kitosán. Usando este método, es posible analizar cómo los complejos digeridos de la comida obran recíprocamente con uno a y con otras moléculas, dando discernimientos críticos en la digestión y el metabolismo.

Fuentes

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Last Updated: Apr 1, 2019

Dr. Surat P

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Dr. Surat P

Dr. Surat graduated with a Ph.D. in Cell Biology and Mechanobiology from the Tata Institute of Fundamental Research (Mumbai, India) in 2016. Prior to her Ph.D., Surat studied for a Bachelor of Science (B.Sc.) degree in Zoology, during which she was the recipient of an Indian Academy of Sciences Summer Fellowship to study the proteins involved in AIDs. She produces feature articles on a wide range of topics, such as medical ethics, data manipulation, pseudoscience and superstition, education, and human evolution. She is passionate about science communication and writes articles covering all areas of the life sciences.  

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