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Quel est Affimers ?

Saut à :

Les anticorps ont été la méthode la plus populaire pour étudier l'expression de la protéine et fonctionnement pour les décennies passées, mais ont été poursuivis par manque de validation et la rentabilité faible de produire continuellement des anticorps neufs.

Les protéines d'Affimer représentent un groupe de protéines obligatoires alternatives qui peuvent être employées pour étudier l'expression de la protéine et le fonctionnement.

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L'image montre qu'un anticorps (objectif bleu) et l'affimer (objectif orange) expliquaient les différences de taille et de complexité. Crédit d'image : Les sciences de la vie d'Avacta

Comment Affimers vont-ils a-t-il effectué ?

Affimers proviennent de l'entraînement pour produire des approches alternatives d'étudier le grippement et le fonctionnement de protéine, qui peuvent compléter l'information fournie par des anticorps.

Comme type de réactif d'affinité, les affimers sont les échafaudages biophysically stables des protéines qui peuvent être réutilisées. Affimers peut être effectué à partir de deux échafaudages : Échafaudages d'Adhiron et échafaudages humains du stefin A.

L'échafaudage du stefin A est conçu de la protéine humaine du stefin A, alors qu'Adhiron est synthétique. La protéine de synthèse d'Adhiron a été initialement effectuée à partir de la séquence du cystatin, et est très thermiquement niche. Les échafaudages d'Adhiron et de stefin A sont structurellement associés.

Pour sélecter un affimer approprié, examinant est fait pour trouver les réactifs adaptés pour la protéine cible. Les régions codantes choisies sont alors copiées dans un vecteur d'expression dans Escherichia coli, et la protéine recombinée a été épurée au cours d'une semaine. Ceci tient compte du rétablissement des protéines de haute qualité pour de diverses applications.

Quelles sont les applications d'Affimers ?

Affimers peut être combiné avec les tests biologiques traditionnels pour augmenter notre compréhension des protéines. Par exemple, des affimers ont été employés dans des analyses d'affinité, notamment. Ils ont été également habitués dans les biocapteurs et dans les cultures cellulaires pour manipuler la signalisation de cellules. Affimers ont été avec succès appliqués in vitro et in vivo.

Certaines des applications qui ont été vérifiées utilisant des affimers développement comprennent la représentation de cellules, la microscopie superbe de définition, la modulation de fonctionnement de protéine, la formation magnétique de nanoparticle, et d'IRM réactif.

Affimers avec la spécificité améliorée pour le tubulin ont été employés dans la microscopie superbe de définition avec la réussite élevée, et peuvent viser des régions de la structure de tubulin que les anticorps sont en général restreints de.

Il est susceptible que plus d'applications seront découvertes à l'avenir comme l'utilisation des affimers devient plus répandue. Par exemple, grâce aux bibliothèques croissantes des affimers, il a été possible de produire des puces ADN d'affinité pour découvrir des biomarqueurs et des pharmaceutiques de potentiel.

En trouvant des biomarqueurs, des affimers ont été appliqués aux études de cancer, où ils ont été employés pour viser une protéine dans la formation de récipient de tumeur appelée le récepteur de VEGF.

Quels sont les avantages d'Affimers ?

Affimers sont petit dans la taille, stable à différentes plages de températures, relativement facile à se produire, et donnent des occasions attrayantes de compléter les points faibles des anticorps.

Leur petite taille est vraisemblablement l'un des attributs rendant des affimers plus sensibles que des anticorps une fois utilisée dans la souillure histochimique, car ils peuvent pénétrer des tissus mieux.

Affimers sont disponible dans le commerce et peuvent être synthétisés par différents laboratoires utilisant publiquement - les méthodes procurables, l'assurant de ce fait est accessible en communauté scientifique entière.

Un avantage clé des affimers, par opposition aux anticorps ou aux nanobodies, est la vitesse à laquelle elles peuvent être examinées et développées. Le procédé de dépistage pour des affimers comporte trois itérations d'étalage bactériophage et d'analyses d'ELISA.

Ceci peut être effectué en 12 jours, qui est de manière significative moins que le moment nécessaire pour l'anticorps et les temps animaux nanobody d'inoculation. En outre, le procédé de dépistage par lequel des réactifs obligatoires sont recensés est plus efficace parce que les protéines cibles sont examinées dans une condition pliée.

Points faibles et développement futur

Affimers en général le plus avec succès sont isolés quand des antigènes de haute qualité sont employés. Ceux-ci sont présentés par l'intermédiaire de la biotine ou du streptavidin des plaques et des talons. Cependant, l'isolement de certaines protéines recombinées peut être plus provocant. Par exemple, les protéines SH2 exprimées en cellules mammifères sont provocantes pour extraire.

La réussite du choix adapté d'affimer utilisant les antigènes commerciaux semble dépendre de la source, car seulement certaines marques semblent être viables pour des affimers.

Sources

  1. Tiede C, et autres (2017). Les protéines d'Affimer sont les réactifs polyvalents et renouvelables d'affinité. eLife. https://doi.org/10.7554/eLife.24903
  2. Roberts J.P. (2013). Les biomarqueurs prennent le centre de la scène. https://www.genengnews.com/magazine/202/biomarkers-take-center-stage/
  3. Bedford R, et autres (2017). Réactifs alternatifs aux anticorps dans des applications de représentation. Révisions de Biophyiscal. https://doi.org/10.1007/s12551-017-0278-2

Last Updated: Sep 24, 2019

Sara Ryding

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Sara Ryding

Sara is a passionate life sciences writer who specializes in zoology and ornithology. She is currently completing a Ph.D. at Deakin University in Australia which focuses on how the beaks of birds change with global warming.

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