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¿Cuáles son péptido Aptamers?

Los aptamers del péptido son los polipéptidos pequeños, artificiales, que atan para apuntar las proteínas de una manera altamente específica, similares a los anticuerpos. Estas proteínas pueden ocurrir naturalmente o pueden ser creadas artificial.

¿Cuáles son Aptamers?

Aptamers primero fue utilizado en la investigación que seguía su descubrimiento en los años 90 en que Tuerk y el oro desarrollaron una metodología para seleccionar para los ligands del ARN, que atan muy específicamente a la polimerasa de DNA T4. Los primeros aptamers diseñados eran los ácidos nucléicos ARN y DNA.

Sin embargo, en 1996 los aptamers del péptido fueron desarrollados. Estos péptidos contienen un andamio del péptido limitado a una región variable del rizo (5-20 residuos de largo), que contiene diversas series de aminoácido. Esta región variable del rizo tiene el abilitiy a reconocer y a atar a las series, mientras que el andamio de la proteína ofrece adaptabilidad y previene el atascamiento anormal estabilizando la conformación del rizo.

El primer andamio de la proteína era el thioredoxin de Escherichia Coli. Esta proteína todavía se utiliza en tecnología del aptamer de la proteína mientras que contiene un sitio activo del rizo, que se puede reemplazar por una serie variable.

Modelo de la molécula de la DNA. Haber de imagen: UGREEN 3S/Shutterstock
Modelo de la molécula de la DNA. Haber de imagen: UGREEN 3S/Shutterstock

Aislamiento de la proteína Aptamers

Una vez que están creados, los aptamers de la proteína se aíslan generalmente de bibliotecas combinatorias con una técnica de la selección. Entonces se perfeccionan con cambios numerosos, principal con punto-mutaciones.

La selección es hecha generalmente por el sistema del dos-híbrido de la levadura, pero se puede también realizar usando despliegue bacteriófago y un alcance de otros procesos sin células.

En el sistema del dos-híbrido de la levadura, los aptamers de la proteína se preparan y están limitados a los dominios de la activación Gal4 (presa), mientras que las series del objetivo están limitadas a los dominios obligatorios Gal4 (cebo).

El atascamiento y el dominio de la activación se requieren para la transcripción de una proteína, pero un gen rio abajo del reportero se puede activar con un factor de la transcripción que ata a una serie que activa por aguas arriba. Por lo tanto, si una proteína del cebo y la proteína de la presa atan, después estos dos dominios venga cerca bastante obrar recíprocamente, y el gen del reportero puede transcripted.

Sin embargo, si entonces no obran recíprocamente estas proteínas ninguna transcripción ocurre. Por lo tanto, los aptamers de la proteína que llevan a la transcripción del gen del reportero son las proteínas que son complementarias a la serie deseada.

Alternativamente, en el método bacteriófago sin células del despliegue, los polipéptidos se presentan en la superficie de bacteriófagos. Estas series pueden después seleccionar para y atar a los polipéptidos, que son compatibles con la serie pre-seleccionada.

Papeles de la proteína Aptamers

In vivo, los aptamers atan naturalmente a su objetivo de la proteína y rompen su función a través de una variedad de mecanismos, por ejemplo, previniendo acciones recíprocas con otras proteínas. Esta propiedad por lo tanto ha hecho estos aptamers de la proteína útiles en la caracterización de proteínas. Por ejemplo, pueden ser utilizadas como mutágenos, el atascamiento e inhibición de la función del gen del objetivo.

Un fenotipo específico puede entonces ser seleccionado para y éste permite la identificación de los aptamers de la proteína que crean este fenotipo con la inhibición de la función de la proteína. Esto se puede, por lo tanto, utilizar para determinar la proteína del objetivo, su papel biológico y otras proteínas que obran recíprocamente.

Los aptamers de la proteína por lo tanto se han utilizado en muchos campos de la investigación, por ejemplo para la identificación de los genes, que están implicados en el ciclo celular.

Otros progresos también han mostrado que estos aptamers pueden alterar la localización de proteínas o llevar a las modificaciones anormales del posttranslational, haciéndolas aún más valiosas en la investigación.

Estas proteínas pueden también ser aplicadas para la investigación in vitro. Atan a las proteínas del interés, permitiendo la identificación de una amplia variedad de polipéptidos, tales como isoforms y objetivos activos del anticuerpo.

Fuentes

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Last Updated: Nov 1, 2018

Hannah Simmons

Written by

Hannah Simmons

Hannah is a medical and life sciences writer with a Master of Science (M.Sc.) degree from Lancaster University, UK. Before becoming a writer, Hannah's research focussed on the discovery of biomarkers for Alzheimer's and Parkinson's disease. She also worked to further elucidate the biological pathways involved in these diseases. Outside of her work, Hannah enjoys swimming, taking her dog for a walk and travelling the world.

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