Advertencia: Esta página es una traducción de esta página originalmente en inglés. Tenga en cuenta ya que las traducciones son generadas por máquinas, no que todos traducción será perfecto. Este sitio Web y sus páginas están destinadas a leerse en inglés. Cualquier traducción de este sitio Web y su páginas Web puede ser imprecisa e inexacta en su totalidad o en parte. Esta traducción se proporciona como una conveniencia.

¿Cuáles son Proteoforms (variación de la proteína)?

La variación de la proteína, que explica una gran cantidad de la complejidad en sistemas biológicos y nuestras carrocerías, puede venir en muchas diversas formas. Los diversos tipos de variación, a saber variaciones en la forma molecular de los productos de la proteína, son unidos por el proteoform del término (previamente también conocido como formas de la proteína, isoforms de la proteína, especie de la proteína, y variantes de la proteína).

proteoformHaber de imagen: StudioMolekuul/Shutterstock.com

Proteoforms

Esfuerzos en la comprensión de la variación genética llevada al descubrimiento que mucha de la variación y de la complejidad en biología es debido a las proteínas, bastante que solamente genes. Diversos proteoforms pueden presentarse debido a la variación, a la manipulación o a empalmar genética de las transcripciones del ARN, y de las modificaciones que ocurren después de la traslación.

Hay algunas anomalías a las variaciones de la proteína que no son revestidas por los proteoforms del término. Éstos incluyen las modificaciones poste-de translación que se conocen como residuos reactivo-derivatizados o isótopo-etiqueta. Si no, los proteoforms se utilizan para entender la complejidad completa de proteínas y cómo las diferentes fuentes de variación pueden obrar recíprocamente para dar lugar a diferencias.

Fuentes de la variación de la proteína

La variación genética que da lugar a proteoforms se puede atribuir en gran parte a cifrar únicos polimorfismos y (cSNPs) mutaciones del nucleótido. La variación en el nivel del ARN se puede atribuir principal a empalmar alternativo.

Por ejemplo, se estima que los alrededor 93% de genes humanos están conforme a empalmar alternativo. Éstos pueden tener implicaciones para la función y la localización. La variación en el nivel del ARN puede también ser debido al ARN que corrige, con corregir más común siendo donde la adenosina se corrige a la inosina.

La traslación no es un proceso perfecto, y los desvíos en la traslación son otra fuente por la cual los proteoforms únicos pueden presentarse. Las frecuencias de desvío estimadas están aproximadamente 0.01-0.1% por el aminoácido, que puede aumentar del envejecimiento o de células esfuerzo, los desvíos de significado pueden componer una porción importante de variación en células con muchas proteínas.

las modificaciones Poste-de translación son también una fuente importante de proteoforms, pues pueden aumentar números del proteoform exponencial. las modificaciones Poste-de translación se pueden dividir en las categorías basadas en la estructura o la función.

Por ejemplo, las categorías estructurales pueden observar si las modificaciones son simples (e.g fósforo o acetilo) o complejo (e.g glycosylation) y cómo esto aumenta números del proteoform. Las categorías funcionales se centran en los efectos de modificaciones poste-de translación sobre fenotipos, de tal modo centrándose en cómo los proteoforms pueden dar lugar a diversas formas.  

Proteoforms humanos

La talla del proteome está conforme a mucho discusión, con los valores colocando a partir del 20.000 a varios millones. Mientras que el genoma humano se puede estimar para ser alrededor 20.000 genes de la proteína-codificación, la talla del proteome puede ser vario más grande de las magnitudes debido a la gran variación de proteoforms.

La presencia y la función de proteoforms pueden ser críticas para el funcionamiento normal de la carrocería. En seres humanos, hay 23 proteoforms sabidos en el sistema del amiloide-β en enfermedad de Alzheimer, donde no están análisis los diversos proteoforms tradicionales directos perceptibles de ELISA. Hay también alrededor 75 proteoforms sabidos para el sistema de la histona H4, que se asocia a la represión y a la activación del gen.

La comprensión del fragmento completo del proteoform humano será desafiadora. No sólo es necesario entender existen cuántos proteoforms, pero la diversidad del proteoform de la manera varía entre los tipos de la célula, su papel en enfermedad, y su papel en diversidad humana será complejo y difícil de descifrar. Los proyectos tales como el atlas humano de la proteína y el atlas de la célula humana se han puesto en marcha en los últimos 10 años para ayudar a entender diversidad humana, e incluirán probablemente proteoforms.

Entregas en la detección y la comprensión del proteoform

Mientras que las plataformas del proteomics se han perfeccionado masivo en las últimas décadas, todavía hay discrepancias en la detección del proteoform. Por ejemplo, las transcripciones alternativas que se descubren vía la secuencia del ARN no se encuentran siempre usando métodos del proteomics.

La detección inferior de proteoforms de este tipo es debido a la sensibilidad y al abrigo limitados de las plataformas actualmente usadas del proteomics. Incluso los métodos donde la mayoría de la expresión génica puede ser descubierta, llamados los análisis proteomic profundos, el abrigo de la serie para muchas proteínas son inferiores. Esto es especialmente verdad para los genes inferiores de la abundancia.

Otra complicación a descubrir proteoforms es que no pueden ser descubiertos por la estrategia actualmente dominante. Aproximación ascendente del ` la' la mayoría del ampliamente utilizado implica la digestión de proteínas para descubrir los péptidos con LC-MS/MS, pero la mayoría de los proteoforms comparten los péptidos con uno a y este método es así a menudo inadecuado. Aproximación de arriba hacia abajo del ` la' se considera a menudo como mejor, donde las proteínas no se digieren y en lugar de otro el proteoform entero es analizado por LC-MS/MS.

Fuentes

  1. Smith, L.M. y otros (2013). Proteoform: un único término que describe complejidad de la proteína. Métodos de la naturaleza. https://doi.org/10.1038/nmeth.2369
  2. Aebersold, R. y otros (2019). ¿Cuántos proteoforms humanos hay? Biología de la substancia química de la naturaleza. https://doi.org/10.1038/nchembio.2576
  3. Toby, T.K. y otros (2016). Progrese en proteomics de arriba hacia abajo y el análisis de proteoforms. Revista anual de la química analítica. https://doi.org/10.1146/annurev-anchem-071015-041550

Further Reading

Last Updated: Jun 3, 2020

Sara Ryding

Written by

Sara Ryding

Sara is a passionate life sciences writer who specializes in zoology and ornithology. She is currently completing a Ph.D. at Deakin University in Australia which focuses on how the beaks of birds change with global warming.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Ryding, Sara. (2020, June 03). ¿Cuáles son Proteoforms (variación de la proteína)?. News-Medical. Retrieved on March 06, 2021 from https://www.news-medical.net/life-sciences/What-are-Proteoforms-(Protein-Variation).aspx.

  • MLA

    Ryding, Sara. "¿Cuáles son Proteoforms (variación de la proteína)?". News-Medical. 06 March 2021. <https://www.news-medical.net/life-sciences/What-are-Proteoforms-(Protein-Variation).aspx>.

  • Chicago

    Ryding, Sara. "¿Cuáles son Proteoforms (variación de la proteína)?". News-Medical. https://www.news-medical.net/life-sciences/What-are-Proteoforms-(Protein-Variation).aspx. (accessed March 06, 2021).

  • Harvard

    Ryding, Sara. 2020. ¿Cuáles son Proteoforms (variación de la proteína)?. News-Medical, viewed 06 March 2021, https://www.news-medical.net/life-sciences/What-are-Proteoforms-(Protein-Variation).aspx.

Comments

The opinions expressed here are the views of the writer and do not necessarily reflect the views and opinions of News Medical.