Aviso: Esta página é uma tradução automática da página original em inglês. Por favor note uma vez que as traduções são geradas por máquinas, não tradução tudo será perfeita. Este site e suas páginas da Web destinam-se a ler em inglês. Qualquer tradução deste site e suas páginas da Web pode ser imprecisas e imprecisos no todo ou em parte. Esta tradução é fornecida como uma conveniência.

Que é genómica comparativa?

A genómica comparativa é um campo da biologia onde o genoma da espécie diferente é comparado entre si para compreender diferenças evolucionárias e moleculars entre espécies. A revelação do baixo custo, arranjar em seqüência da próxima geração permitiu a análise de uma pletora de genomas relacionados usando a genómica comparativa. Este artigo aponta descrever as técnicas usadas na genómica comparativa e as suas vantagens/desvantagens.

Faixa clara a:

A genómica comparativa é um campo da biologia onde o genoma da espécie diferente é comparado entre si para compreender diferenças evolucionárias e moleculars entre espécies.vrx | Shutterstock

Arranjar em seqüência do genoma e comparação do genoma

A informação genética é codificada por quatro nucleosides: adenina, cytosine, guanina, e thymine. Determinar o pedido destes nucleosides no ADN linear forma a base de arranjar em seqüência. Junto com o genoma humano, os genomas de diversos organismos modelo têm sido arranjados em seqüência agora - incluir chimpanzés, ratos, moscas de fruto, peixes do soprador, lombrigas, fermento do padeiro, e bactérias. No total, os genomas de mais de 1000 organismos prokaryotic e 1300 espécies foram arranjados em seqüência até agora.

A primeira etapa na genómica comparativa é comparar características gerais como: tamanho do genoma, número de genes e número de cromossoma. Por exemplo, Arabidopsis (uma planta) tem um genoma menor comparado à drosófila, a mosca de fruto que tem duas vezes tantos como genes. Interessante, o tamanho do genoma de Arabidopsis é similar aos seres humanos, sugerindo que o tamanho do genoma não seja um indicador da complexidade ou do estado evolucionário.

ADN que arranja em seqüência e synteny

Synteny é um método por que os genes são arranjados em blocos similares através das espécies para identificar regiões similares e dissimilares. A extensão da similaridade e da dissimilitude pode variar através dos cromossomas. Por exemplo, o cromossoma 20 dos seres humanos corresponde quase completamente ao segundo cromossoma do rato.

Similarmente, o décimo sétimo cromossoma dos seres humanos corresponde com o cromossoma 11 do rato. Assim, a análise pode mostrar como as mudanças cromossomáticas que aconteceram no rato e em cromossomas humanos desde que divergiram de um antepassado comum quase 75-80 milhão anos há.

Análise homólogo do ADN

Um outro método usado na genómica comparativa é a análise da homologia, onde os cromossomas homólogos de espécies diferentes são alinhados. Por exemplo, em um estudo, o gene para a quinase do piruvato da enzima nos seres humanos foi alinhado com o cão, o rato, a galinha, e os zebrafish homólogos do formulário da seqüência da enzima (entre outros), e subseqüentemente, as regiões de similaridade alta da seqüência foram traçadas.

Como a análise similaridade alta mostrada nas seqüências da enzima do ser humano e do macaque (um primata), visto que a galinha e os zebrafish mostraram a similaridade somente nas regiões da codificação. Tal análise pode ser usada para encontrar que características genomic foram preservadas durante a evolução e, inversamente, que as características diversificaram.

Distância filogenética

A distância filogenética é uma característica não-paramétrica usada para medir o grau de separação entre dois organismos. Este parâmetro é baseado no número de mudanças da seqüência que acumularam durante anos ou gerações. Esta distância é inversamente proporcional à similaridade da seqüência entre os organismos - isto é menos a similaridade da seqüência, mais está a uma distância filogenética entre eles.

Sobre distâncias filogenéticas mais longas (tais como um bilhão anos) desde que os organismos separados, somente inferências gerais podem ser recolhidos. Contudo, para umas distâncias filogenéticas mais próximas, tais como 50-200 milhão anos desde a separação, o ADN funcional e não-funcional pode ser discriminado, que pode subseqüentemente conduzir à identificação de regiões da codificação, de não-codificação RNAs, de regiões reguladoras, etc.

Para distâncias filogenéticas menos de 5 milhão anos, diferenças da seqüência pode ser usado para pressupr diferenças menores e subtis na forma e no formulário. Conseqüentemente, as diferenças genomic comparativas podem fornecer muita informação poderosa.

Vantagens da genómica comparativa

Os genomas comparativos conduziram às introspecções interessantes, tais como essa parte 60% da mosca de genoma humano e de fruto de seus genes. Também, quase dois terços dos genes do cancro têm genes homólogos na mosca de fruto. Tais resultados têm um impacto profundo na pesquisa da saúde humana. Independentemente da saúde, igualmente tem implicações em vários campos como a agricultura, a biotecnologia, o zoologia, a biologia da conservação, etc.

Fontes

Further Reading

Last Updated: May 22, 2019

Dr. Surat P

Written by

Dr. Surat P

Dr. Surat graduated with a Ph.D. in Cell Biology and Mechanobiology from the Tata Institute of Fundamental Research (Mumbai, India) in 2016. Prior to her Ph.D., Surat studied for a Bachelor of Science (B.Sc.) degree in Zoology, during which she was the recipient of an Indian Academy of Sciences Summer Fellowship to study the proteins involved in AIDs. She produces feature articles on a wide range of topics, such as medical ethics, data manipulation, pseudoscience and superstition, education, and human evolution. She is passionate about science communication and writes articles covering all areas of the life sciences.  

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    P, Surat. (2019, May 22). Que é genómica comparativa?. News-Medical. Retrieved on January 28, 2021 from https://www.news-medical.net/life-sciences/What-is-Comparative-Genomics.aspx.

  • MLA

    P, Surat. "Que é genómica comparativa?". News-Medical. 28 January 2021. <https://www.news-medical.net/life-sciences/What-is-Comparative-Genomics.aspx>.

  • Chicago

    P, Surat. "Que é genómica comparativa?". News-Medical. https://www.news-medical.net/life-sciences/What-is-Comparative-Genomics.aspx. (accessed January 28, 2021).

  • Harvard

    P, Surat. 2019. Que é genómica comparativa?. News-Medical, viewed 28 January 2021, https://www.news-medical.net/life-sciences/What-is-Comparative-Genomics.aspx.

Comments

The opinions expressed here are the views of the writer and do not necessarily reflect the views and opinions of News Medical.