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Che cosa sono rinforzatore RNAs (eRNAs)?

Il rinforzatore RNAs, o i eRNAs, è brevi molecole del RNA di non codifica che sono trascritte dai luoghi dei rinforzatori. È compreso nel regolamento della trascrizione del gene e può essere un obiettivo terapeutico per le malattie.

Il rinforzatore RNAs, o i eRNAs, è brevi molecole del RNA di non codifica che sono trascritte dai luoghi dei rinforzatori.Juan Gaertner | Shutterstock

Il rinforzatore RNAs è stato scoperto nel 2010 con alto-capacità di lavorazione che ordina per individuare i rinforzatori stimolo-dipendenti. Ciò ha rivelato la trascrizione Ii-dipendente del RNA polimerasi del rinforzatore RNAs. Questi sono generalmente di 0.5-2 KB di lunghezza.

Inoltre, il livello di espressione di rinforzatore RNAs si trova tipicamente nello stesso intervallo dell'espressione dei loro rinforzatori del genitore, così indicando che la funzione del rinforzatore e l'espressione del RNA del rinforzatore sono correlate.

Come è il rinforzatore RNAs ha individuato?

L'alto ordinamento di Next Generation di copertura (NGS) è richiesto per individuare il rinforzatore RNAs. Ciò è perché il livello di espressione di RNA del rinforzatore è volta 19-34 più bassa dell'espressione delle trascrizioni del gene. La stabilità del rinforzatore RNAs è egualmente molto più bassa del mRNA. Quindi, i metodi come nucleare globale esecuzione-sull'ordinamento (GRO-seguente) e sulla precisione nucleare esecuzione-sull'ordinamento (Pro-seguente), o sui metodi sensibili quale l'analisi del cappuccio di ordinamento di espressione genica sono richiesti.

Altri metodi per migliorare la presenza e la rilevazione di RNAs selezionato comprendono l'immunoprecipitazione della cromatina, l'ibridazione in situ ed il metodo BruUV-seguente dove la luce UV è usata per in profondità l'ordinamento di RNAs nascente. Tuttavia, poichè i rinforzatori sono soltanto attivi ai momenti specifici ed alle posizioni, questi metodi possono essere più efficaci soltanto durante i periodi che i rinforzatori sono dal punto di vista funzionale attivi.

Che ruoli il rinforzatore RNAs effettua?

Indicatori dei rinforzatori attivi

Gli studi indicano che il rinforzatore RNAs può essere usato per determinare se un rinforzatore è silenzioso o attivo. Uno studio ha indicato che l'espressione tessuto-specifica dei rinforzatori può essere determinata dalla presenza di rinforzatore RNAs più della presenza di indicatori epigenetici.

Regolamento trascrizionale dei geni dell'obiettivo

Le funzioni del rinforzatore RNAs sono state discutibili dove inizialmente è stato pensato che il rinforzatore RNAs fosse sottoprodotti di trascrizione. Tuttavia, gli studi successivi hanno indicato che il rinforzatore RNAs può regolamentare l'espressione dei geni multipli legando a loro.

Gli studi svolti su vasta scala indicano che l'espressione del rinforzatore RNAs e l'espressione genica dell'obiettivo sono correlate positivamente. Uno dei modi che questo può accadere è via il suo atto sui rinforzatori del RNA polimerasi II. egualmente fisicamente interagisce con i promotori che formano i cicli del PE. La ricerca egualmente ha indicato che il RNA del rinforzatore può rinforzare il ciclaggio e il upregulate del PE l'espressione dei geni specifici.

Rinforzatore RNAs nella malattia

RNA ed infiammazione del rinforzatore

Gli studi indicano che IL1β, un RNA del rinforzatore, è compreso nella via di segnalazione di NF-KB e gestisce la risposta proinflammatory. Il colpo di questo RNA del rinforzatore ha potuto diminuire la risposta infiammatoria.

RNA del rinforzatore e disordini neurodegenerative

I rinforzatori possono portare le mutazioni che possono avere un ruolo nei disordini neurodevelopmental e neuropsichiatrici. Gli studi hanno trovato più di cento rinforzatori nel cervello e la maggior parte dei rinforzatori nello striatum dei cervelli del mouse, sono stati trovati per essere trascritti nel rinforzatore RNAs. Il rinforzatore RNAs egualmente contiene le varianti genetiche che hanno trovato per essere associate con i disordini autistici di spettro.

RNA e cancro del rinforzatore

Diverse centinaia il rinforzatore RNAs è stato trovato differenziale per essere espresso nel carcinoma della prostata. In MCF-7, una cella di cancro al seno, da trascrizione indotta da estrogeno di Erna è stata trovata per essere upregulated. Un altro studio ha indicato che il rinforzatore RNAs è diminuito significativamente nel cancro di gola.

RNA del rinforzatore in diabete

La rosiglitazione, una droga antidiabetica, è stata indicata per migliorare la sensibilità dell'insulina gestendo il glucosio di sangue. Questa droga egualmente upregulated i livelli di rinforzatore RNAs ai siti specifici che suggeriscono il ruolo del RNA del rinforzatore in livelli e diabete di regolamentazione del glucosio.

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Last Updated: Apr 24, 2019

Dr. Surat P

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Dr. Surat P

Dr. Surat graduated with a Ph.D. in Cell Biology and Mechanobiology from the Tata Institute of Fundamental Research (Mumbai, India) in 2016. Prior to her Ph.D., Surat studied for a Bachelor of Science (B.Sc.) degree in Zoology, during which she was the recipient of an Indian Academy of Sciences Summer Fellowship to study the proteins involved in AIDs. She produces feature articles on a wide range of topics, such as medical ethics, data manipulation, pseudoscience and superstition, education, and human evolution. She is passionate about science communication and writes articles covering all areas of the life sciences.  

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