¿Cuál es genómica funcional?

Empleando una aproximación genoma-ancha, la genómica funcional apunta revelar respuestas a las preguntas fundamentales con respecto los papeles y a las acciones recíprocas de genes y de sus productos.

Genómica funcional - por ZitaHaber de imagen: Zita/Shutterstock

Proyecto del genoma humano

Lanzado en 1990, la biología revolucionada proyecto del genoma humano, permitiendo a la serie del genoma humano ser correlacionado. Era un ejemplo típico de la ciencia grande del `' - el gran escala, aproximación cruz-disciplinaria. La disponibilidad de estos datos innovadores ha habilitado la investigación adicional en procesos moleculares y las acciones recíprocas que ocurren en células en un nivel genoma-ancho.

Alto-producción que ordena tecnologías

El uso de la alto-producción que ordenaba (HTS) tecnologías se ha convertido en una parte crucial de análisis genomic. Potente y de poco costo, HTSs ha eclipsado la inferior-producción que ordenaba tecnologías como la secuencia de Sanger.

La secuencia de Sanger es una técnica costosa que permite solamente para que las series individuales sean amplificadas y lean. El HTS almacena discernimientos en grande de los conjuntos de datos y de las ofertas mayores en las firmas genomic y transcriptomic celulares en diversos estados de la enfermedad.

Secuencia de la generación siguiente (NGS)

Las herramientas de NGS que son DNA lo más común posible aplicada del fragmento y la atan a los adaptadores para su amplificación subsiguiente usando la polimerización en cadena. La DNA amplificada se inmoviliza en molduras o en un arsenal permitiendo fragmentos idénticos de la DNA a la forma.

Más nuevas tecnologías de secuencia como torrente del ión hacen uso de los iones hidrogenados emitidos de cabos de la DNA cuando los nucleótidos son integrados en ellos. Usando un secuenciador, esta información se puede utilizar para crear análisis digital.

Transcriptomics

Transcriptomics se puede describir como el estudio de transcriptomes y de sus funciones que genera un mejor retrato en lo que respecta a funciones del gen y a caminos reguladores. El uso de NGSs ha perfeccionado el análisis de los perfiles y de la expresión génica de la transcripción. Pueden también determinar límites de la transcripción y uniones del intrón-exón.

NGSs ha reducido el ordenar de los costos debido al patrón del funcionamiento general de estas herramientas de secuencia con respecto a más viejos métodos de HTS y de inferior-producción que ordenaban análisis. A pesar de esto, una necesidad de la infraestructura y el personal en fijaciones clínicas hace NGSs accesible a alguno.

CRISPR-Cas9

El uso de los sistemas modelo tales como CRISPR-Cas9 y la mutagénesis química se han utilizado para comprobar la función del gen y de la proteína así como el lazo entre el genotipo y el fenotipo. CRISPR permite cortar y pegar en un nivel genomic cortando genes en los lugares geométricos de la DNA del deseo con su capacidad de apuntar Cas9.  

Microarrays de la DNA

Los Microarrays se utilizan para fijar configuraciones de la expresión génica. Se hacen de los fragmentos altos de la DNA del individuo que se han inmovilizado en un apoyo como el cristal.

Con un proceso del hibridación, los fragmentos de la DNA o del ARN de una muestra se sujetan a la DNA encuadernada y después se sondan para determinar la cantidad de ácido nucléico en cada situación genomic dentro de la muestra. Sin embargo, es difícil diseñar las matrices (determinado con respecto a los genomas mamíferos complejos) que no atan fragmentos estrechamente vinculados de la DNA y del ARN.

Esto previene los genes específicos que son descubiertos cuando tienen homología de la serie con varios otras. El otro tema es que no pueden descubrir las series que no tienen una serie complementaria. Esto da lugar a una falta de representación de los genes que no se han reconocido previamente en un genoma.

Las limitaciones de los microarrays, por lo tanto del permiso NGSs como la opción más práctica para el análisis en genómica funcional.

Perspectivas futuras para la genómica funcional

El campo de la genómica funcional es relativamente nuevo. Aunque algunas tecnologías requieren la mejoría, el movimiento rápido de la investigación en esta área sugiere que el análisis exacto y completo pueda ser hecho.

Fuentes

[Lectura adicional: genómica]

Last Updated: Oct 11, 2018

Maryam Mahdi

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Maryam Mahdi

Maryam is a science writer with a passion for travel. She graduated in 2012 with a degree in Biomedical Sciences (B.Sc.) from the University of Manchester. Maryam previously worked in scientific education and has produced articles, videos, and presentations to highlight the association between dietary choices and cancer. She produces a range of articles for News-Medical, with a focus on microbiology and microscopy.

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