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Molécules qui déclenchent un battement du coeur

Deux stagiaires de génie biomédical chez Johns Hopkins tracent l'interaction des molécules dans une cellule cardiaque, décrivant les mouvements microscopiques qui pourraient être critiques pour mettre à jour un battement du coeur sain. Les stagiaires, séniors Bhuvan Srinivasan et KOH de Carol Xiaoying, ont présenté leurs découvertes à deux conférences prestigieuses de bio-informatique et collaborent maintenant avec leur superviseur de corps enseignant sur un papier pour un tourillon scientifique.

Dans un type d'ordinateur détaillé, les deux avaient suivi l'activité des molécules dans une petite région à l'intérieur des myocytes cardiaques, les cellules musculaires qui négocient des contractions du coeur. Les stagiaires ont exécuté leur recherche dans le laboratoire d'André Levchenko (décrit à la gauche), un professeur adjoint dans le service du génie biomédical. « La contraction des myocytes est réglée par les alinéas minuscules de la cellule avec un volume que vous pourriez compter certaines des molécules actuelles là d'une part, » Levchenko tellement petit a dit. « Mais en modélisant l'interaction entre les molécules uniques dans ces endroits, nous pensons que nous pouvons prévoir ce qui va arriver au coeur entier. Ce qui se produit ici des jeux hors d'une réaction en chaîne des événements menant à la contraction de coeur. »

Levchenko est impressionné par quels Srinivasan et KOH, comme étudiants préparant une licence, a accompli dans les parties se réunissantes de ce modèle. « Le niveau du travail fait par Bhuvan et Carol est proche de celui des étudiants de troisième cycle très bons, » Levchenko a dit. « Je les ai donné un peu de conseil, mais ils en grande partie ont fait fonctionner seuls avec lui. Ils sont les stagiaires exceptionnels. Je suis parfois entré dans le laboratoire à 3h du matin et les ai trouvés travailler sur le projet. »

Srinivasan (décrit à la droite), 22, avait fonctionné dans le laboratoire de Levchenko pendant deux années. Il avait l'habitude la concession de récompense de recherches de l'étudiant préparant une licence d'un principal de l'université pour consacrer le temps complémentaire au projet l'été dernier. Le KOH, 21, avait fonctionné dans le laboratoire pour plus qu'une année, supporté par une bourse du gouvernement de Singapour. Les deux stagiaires sont allés au même lycée à Singapour mais n'étaient pas au courant avant qu'ils aient obtenu chez Johns Hopkins.

Au cours de l'année, ils ont travaillé aux aspects indépendants de la recherche, puis ont remonté leurs découvertes. Le KOH a défini et a mené le projet en recueillant des informations de la littérature et en les codant dans le logiciel de modélisation. Srinivasan a assemblé un type d'ordinateur de la voie de la protéine kinase A, une route de transmission le long de laquelle des signes déménagent entre l'extérieur et intérieur de la cellule. Le modèle peut maintenant décrire des événements moléculaires surgissant les deux du règlement de contraction de signalisation et de cellules. « Maintenant, nous pouvons demander, « ce qui si quelque chose arrive à cette voie ? «  » Levchenko a dit. « Comment elle affecterait l'interaction des molécules dans les cellules, et comment cet affect les contractions du coeur dans son ensemble ? »

 

André Levchenko, professeur adjoint de génie biomédical, dirige le KOH de Carol Xiaoying de stagiaires et le Bhuvan Srinivasan dans leur étude de l'interaction des molécules dans les cellules cardiaques.
TOUTES LES PHOTOS PAR KIRK

L'automne dernier, Srinivasan a présenté une partie du travail de l'équipe à la conférence de biologie de NIH Digitals dans Bethesda, où l'affiche a été choisie comme point culminant du contact. Le KOH s'est déplacé à l'université de Washington à St Louis pour présenter la recherche à la Conférence Internationale sur la biologie de systèmes, l'événement de première dans le domaine scientifique apparaissant. Les deux étaient étonnés pour découvrir qu'elles étaient les présentateurs rares d'étudiant préparant une licence mettant en place des questions des chercheurs à plein temps importants, y compris certains dont le travail elles avaient étudié. Srinivasan a demandé à un gagnant du prix Nobel son autographe. « Nous avons ressenti très honorés se présenter à ces conférences, » Koh a dit.

Srinivasan ne recevra pas sa licence jusqu'en mai, mais il a déjà commencé travailler vers sa maîtrise en génie biomédical chez Johns Hopkins. « C'était réellement une affaire pour que je vienne à la première université des recherches de l'Amérique, » a dit Srinivasan, un citoyen de l'Inde dont la famille a replacé à Singapour quand il était dans la sixième pente. « Il a été très facile de devenir impliqué dans la recherche ici et de faire quelque chose valable, pas simplement matériel de laboratoire de nettoyage. J'ai aimé travailler avec M. Levchenko, et j'ai voulu rester tant que je pourrais. »

Le KOH (décrit à la droite) compte également recevoir sa licence en mai et espoirs de poursuivre des études de diplômé dans un programme de génie biomédical. « Quand j'ai joint ce laboratoire, je n'ai pas eu beaucoup d'expérience de modélisation numérique, ainsi j'étais appréhensif, » il a dit. « Mais M. Levchenko était très d'une manière encourageante. C'était le premier projet de recherche sérieux que j'avais essayé, et il était en quelque sorte d'une obsession. Mais c'était une obsession saine. »

Kenny Ching, un ancien étudiant préparant une licence au laboratoire de Levchenko et actuel le stagiaire d'un maître au MIT, également contribué à la recherche. Jeudi 11 mars, Steven Knapp, principal d'université et vice-président principal pour des affaires scolaires, hébergeront du 11ème la cérémonie de récompenses de recherches de l'étudiant préparant une licence principal annuel, qui honorera les 41 lauréats qui ont conduit leurs projets pendant l'été et la chute de 2003. Depuis 1993, environ 40 stagiaires ont reçu tous les ans des concessions de PURA jusqu'à de $3.000 pour conduire la recherche originelle, quelques résultats dont ont été publiés en tourillons professionnels. Les récompenses, financées par un don de la confiance de Hodson, sont une part importante de l'engagement de l'université pour rechercher des opportunités pour des étudiants préparant une licence.

L'Université John Hopkins est identifiée comme l'université licenciée des recherches du pays d'abord, et a été ces dernières années le chef parmi les universités des recherches du pays en gagnant des concessions fédérales de recherche et développement. L'opportunité d'être impliquée dans la recherche importante est l'une des caractéristiques discernantes d'une éducation d'étudiant préparant une licence chez Johns Hopkins.

Le programme de récompenses de recherches de l'étudiant préparant une licence du principal fournit une de ces opportunités de recherches, s'ouvrent aux stagiaires dans chacune des écoles de l'université quatre avec les étudiants préparant une licence à plein temps : l'école de Krieger des arts et des sciences, l'école de merlans du bureau d'études, le conservatoire de Peabody et l'école de soins infirmiers.