Avertissement : Cette page est une traduction automatique de cette page à l'origine en anglais. Veuillez noter puisque les traductions sont générées par des machines, pas tous les traduction sera parfaite. Ce site Web et ses pages Web sont destinés à être lus en anglais. Toute traduction de ce site et de ses pages Web peut être imprécis et inexacte, en tout ou en partie. Cette traduction est fournie dans une pratique.

Génomique comparative pour jeter la lumière neuve sur d'autres microbes de spirochète

Pendant Trois siècles après qu'un microbiologiste Néerlandais pilote a observé la première fois le denticola oral spirale spirale de Tréponème d'agent pathogène, les scientifiques ont déchiffré la Séquence d'ADN entière et la génomique comparative utilisée de la bactérie pour jeter la lumière neuve sur d'autres microbes de spirochète.

L'étude par des scientifiques À l'Institut pour la Recherche Génomique (TIGR) et aux collaborateurs à l'Université de Baylor du Médicament et au Centre de la Science de Santé d'Université du Texas à Houston a trouvé des différences profondes entre la teneur en gène du denticola de T., qui est associé avec la maladie périodontique (de gomme), et d'autres spirochètes qui entraînent le syphilis et la maladie de Lyme.

« Ceci met en valeur l'alimentation électrique de la génomique comparative de nous aider à comprendre comment les agents pathogènes relatifs peuvent entraîner les maladies complet différentes, » dit Ian Paulsen, qui a abouti l'ordonnancement avec le chercheur semblable Rekha Seshadri de TIGR. Paulsen dit que le génome de denticola de T. « fournit un excellent point de référence pour étudier la biologie des spirochètes. »

Les chercheurs ont constaté que le denticola de T. a davantage de deux fois autant de gènes comme spirochète qui entraîne le syphilis, T. pallidum, et ce là n'est pratiquement aucune économie de commande de gène (synténie) entre les génomes des deux microbes associés. Les auteurs disent qui indique que des deux la divergence spirochètes d'un ancêtre commun « contrastait un événement antique » avec la divergence plus récente de beaucoup d'autres groupes de bactéries de leurs parents héréditaires.

On s'attend à ce que l'étude de génome aide des scientifiques à découvrir plus au sujet de la façon dont les agents pathogènes oraux agissent l'un sur l'autre dans la plaque dentaire pour entraîner la maladie des gencives. Le denticola de T. tend à totaliser dans une telle plaque subgingival avec des gingivalis de Porphyromonas, une bactérie qui est associée avec le periodontitis, une maladie des gencives qui affecte 200 millions d'Américains environ. Avoir les génomes complets des deux microbes aidera recherche l'étude leurs interactions et fournit probablement des indices moléculaires pour trouver des objectifs pour que les médicaments traitent la maladie des gencives.

Les scientifiques et les collaborateurs de TIGR ont ordonnancé l'année dernière le génome des gingivalis de P. et maintenant déchiffrent les génomes de six autres bactéries d'oral-cavité et conduisent une analyse « méta-génomique » des microbes de bouche. Des 500 substances microbiennes prévues dans la bouche humaine, seulement environ 150 substances ont été cultivées dans les laboratoires.

« La séquence de génome indique des mécanismes employés par denticola de T. pour coloniser et survivre dans l'environnement complexe des films biologiques oraux, » dit Seshadri, le premier auteur de l'étude. Les collaborateurs de TIGR dans l'étude de PNAS ont inclus Steven J. Norris chez le Centre de la Science de Santé d'UT à Houston et George M. Weinstock à l'Université de Baylor du Service du Médicament de Moléculaire et de la Génétique Humaine.

Dans le papier de PNAS, les chercheurs ont enregistré que le génome du denticola de T. « réfléchit ses adaptations pour la colonisation et la survie » avec d'autres bactéries dans la plaque. Comparé à d'autres spirochètes (60 autres substances treponomal environ y compris ou des phylotypes trouvés dans la plaque dentaire), denticola de T. est relativement facile de cultiver et manipuler génétiquement, lui effectuant un excellent modèle pour la recherche de spirochète.

Des Spirochètes sont discernés par leurs formes spiralées et leur capacité de vriller leur voie par les tissus colloïdaux, entraînant un certain nombre de différentes maladies. Le père de la microbiologie, Antonie van Leeuwenhoek, avait esquissé la première fois un spirochète oral - denticola nommé postérieur de T. - après visionnement de lui par son microscope primitif pendant les 1670s. Même après trois siècles, cependant, les spirochètes sont mal compris contrairement à beaucoup d'autres types importants de bactéries.

Jusqu'ici, TIGR a ordonnancé les génomes complets de trois spirochètes : Denticola de T. ; T. pallidum, qui entraîne le syphilis ; et burgdorferei de Borellia, qui entraîne la maladie de Lyme. Le génome d'un quatrième spirochète, interrogans de Leptospira, qui entraîne la maladie Leptosporisis, a été ordonnancé au Centre National Chinois de Génome Humain.

L'analyse comparative de TIGR a constaté qu'environ la moitié des denticola de T. 2.786 gènes ne sont pas présents dans les trois autres spirochètes ordonnancés. Les 618 gènes que chacun des quatre spirochètes a en commun comprennent quelques gènes qui ne sont pas trouvés dans d'autres types de microbes dont les génomes ont été ordonnancés.

« Avoir les séquences de génome de plusieurs spirochètes fournit une opportunité remarquable d'étudier l'évolution, » dit Norris, qui dit que tous les spirochètes sont des cousins quoiqu'ils vivent dans une grande variété d'environnements, y compris la boue, des palourdes, termite étripe, des tiques, et des êtres humains. En comparant les Séquences d'ADN de plus de spirochètes, il dit, « nous pouvons pouvoir atteindre la racine de ce qui effectue une maladie de cause de bactérie, sous tension librement dans l'environnement, ou même soit avantageux à son hôte. »

Claire M. Fraser, président de TIGR, indique que les données de séquence « fournissent un point de départ neuf » pour explorer les différences moléculaires qui peuvent expliquer pourquoi et comment denticola de T. et cause pallidum de T. de telles différentes maladies : « Cette étude a indiqué des analyses neuves dans la biologie spirochète-particulière ainsi que les forces évolutionnaires qui ont formé ces génomes. »

L'Institut pour la Recherche Génomique (TIGR) est un institut de recherches de non-pour-bénéfice basé à Rockville, le Maryland. TIGR, qui a ordonnancé le premier génome complet d'un organisme dissipé en 1995, a été au premier rang de la révolution génomique depuis que l'institut a été fondé en 1992. TIGR conduit la recherche concernant le structurel, fonctionnel, et l'analyse comparative des génomes et des produits de gène dans les virus, les bactéries, les archéobactéries, et les eucaryotes.