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Disposição da Cromatina uma nova tecnologia para examinar o ADN

Uma técnica nova para examinar o ADN está dando a cientistas uma imagem mais detalhada de que os genes têm a propensão para a activação, oferecendo uma nova ferramenta para compreender como os genes funcionam e possivelmente diagnosticando a doença.

A tecnologia, chamada uma disposição da cromatina, foi desenvolvida por pesquisadores no Centro Médico Do Sudoeste de UT em Dallas e é descrita na introdução de Julho da Pesquisa do Genoma do jornal.

O ADN, que contem as instruções genéticas necessários para fazer um ser humano ou todo o outro formulário de vida, é uma molécula longa que seja comprimida firmemente em um núcleo de pilha. As Várias partes de ADN estão sendo constantemente comprimidas e expandidas como as dobras de um acordeão porque uma pilha responde a suas necessidades em mudança.

Quando o ADN relaxa, ou expande, as proteínas chamadas factores da transcrição acedem ao código genético “lido” suas instruções para fazer uma molécula chamada RNA, que faz por sua vez outras proteínas que realizam as funções essenciais da vida, da contracção da resposta imune e do músculo ao regulamento do colesterol e da hormona.

Quando o ADN é comprimido altamente, como um acordeão fechado, não é como acessível às proteínas da transcrição, e não pode fazer o RNA, não disse a Barraca da “Faixa Clara” do Dr. Harold, professor da bioquímica e da medicina interna no autor Do Sudoeste e superior de UT do estudo.

Usando a disposição da cromatina, os pesquisadores Do Sudoeste de UT podem detectar a densidade relativa de diversos estiramentos do ADN em um momento com muito de alta resolução, permitindo que determine que genes têm a propensão para fazer o RNA. Encontraram aquele para muitos genes, mas não tudo, mais aberto o ADN está, mais o RNA está produzido.

“Os genes interessantes são esses que não se comportam que esta maneira,” Dr. Barraca disse.

Exactamente que consolidação dos controles e expansão do ADN está ainda sob o debate científico. Em seu grupo de experiências seguinte, o Dr. Barraca e sua equipe aplicarão várias drogas - tais como aqueles usados na terapia do cancro - às pilhas a fim compreender se e como estas drogas afectam a consolidação do ADN. Tais estudos puderam conduzir às terapias visadas ativando genes benéficos, ou desligando o defeituosos.

Os pesquisadores igualmente investigarão se determinados estados da consolidação e da expansão puderam ser indicativos do cancro ou das outras doenças.

“Nosso estudo actual descreve a tecnologia da plataforma necessária tentar compreender perguntas maiores,” o Dr. Barraca disse. “O passo seguinte envolverá usar a técnica para olhar tipos diferentes de células cancerosas para considerar se este tipo de ensaio poderia ser uma ferramenta diagnóstica.”

Outras técnicas têm ser usadas para examinar a densidade do ADN, mas somente uma parte pequena de ADN em um momento, disse Ryan Weil, um aluno diplomado Do Sudoeste da biofísica de UT e autor principal do estudo. “Uma das vantagens de nossa disposição é que classifica através dos lotes das partes de ADN e nos dá a informação sobre cada segmento de uma vez.”

Actualmente, os cientistas determinam que genes são girados sobre, ou expressado, em uma pilha extraindo o RNA e medindo quanto dele está sendo produzido para cada gene. Um microarray do RNA, ou do “a microplaqueta gene,” são o equipamento padrão usado para medir níveis da expressão do RNA.

“Somente uma fracção pequena dos genes está fazendo o suficiente RNA a ser detectado com microarrays do RNA,” disse o Dr. Barraca. “Muitos dos genes que fazem quantidades muito pequenas do RNA são todavia muito importantes, mas eles caem abaixo do ponto inicial da detecção para técnicas actuais.”

A técnica Do Sudoeste de UT permite que os pesquisadores estudem os genes que não eram previamente acessíveis porque não havia bastante RNA para fazer uma medida de sua actividade.

“Nós podemos obter a informação em um número muito maior de genes, e mesmo se estão em um estado em que podem fazer o RNA, usando esta técnica do que usando microarrays tradicionais do RNA,” o Dr. Barraca disse. “Esta tecnologia pode dizer-nos não somente se o ADN para um gene dado esta presente ou não, mas igualmente se está comprimido ou expandido e apronte conseqüentemente para fazer o RNA.”

O Sr. Weil disse, “Nós podemos dizer não apenas que pilhas estão fazendo agora, mas o que poderiam fazer no futuro.”

http://www.swmed.edu/