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Arsenal de la Cromatina una nueva tecnología para examinar la DNA

Una nueva técnica para examinar la DNA está dando a científicos un retrato más detallado cuyo los genes tienen la propensión para la activación, ofreciendo una nueva herramienta para entender cómo los genes funcionan y posiblemente para diagnosticar enfermedad.

La tecnología, llamada un arsenal de la cromatina, fue desarrollada por los investigadores en el Centro Médico Al Sudoeste de UT en Dallas y se describe en la aplicación de Julio la Investigación del Genoma del gorrón.

La DNA, que contiene las instrucciones genéticas necesitó hacer un ser humano o cualquier otro formulario de vida, es una molécula larga que se condensa apretado en un núcleo de célula. Los Diversos pedazos de DNA están siendo constante comprimidos y desplegados como los dobleces de un acordeón pues una célula responde a sus necesidades cambiantes.

Cuando la DNA se relaja, o se despliega, las proteínas llamadas los factores de la transcripción acceden al código genético “leído” sus instrucciones para hacer una molécula llamada RNA, que a su vez hace otras proteínas que realicen las funciones esenciales de la vida, de la contracción de la inmunorespuesta y del músculo a la regla del colesterol y de la hormona.

Cuando la DNA se condensa altamente, como un acordeón cerrado, no está como accesible a las proteínas de la transcripción, y no puede hacer el ARN, no dijo el Garner del “Salto” del Dr. Harold, profesor de la bioquímica y del remedio interno en el autor Al Sudoeste y mayor de UT del estudio.

Usando el arsenal de la cromatina, los investigadores Al Sudoeste de UT pueden detectar la compacticidad relativa de varios alargamientos de la DNA al mismo tiempo con muy de alta resolución, permitiendo que él determine qué genes tienen la propensión para hacer el ARN. Encontraron eso para muchos genes, pero no todos, cuanto más abierta la DNA está, se produce más el ARN.

“Los genes interesantes son los que no se comportan que esta manera,” el Dr. Garner dijo.

Exactamente qué compactación de los mandos y extensión de la DNA todavía está bajo discusión científico. En su conjunto de experimentos siguiente, el Dr. Garner y sus personas aplicarán las diversas drogas - tales como ésos usados en terapia del cáncer - a las células para entender si y cómo estas drogas afectan a la compactación de la DNA. Tales estudios pudieron llevar a las terapias dirigidas activando genes beneficiosos, o apagando los defectuosos.

Los investigadores también investigarán si ciertos estados de la compactación y de la extensión pudieron ser indicativos de cáncer o de otras enfermedades.

“Nuestro estudio actual describe la tecnología de la plataforma necesaria intentar entender preguntas más grandes,” el Dr. Garner dijo. “El paso de progresión siguiente implicará el usar de la técnica para observar diversos tipos de células cancerosas para considerar si este tipo de análisis podría ser una herramienta diagnóstica.”

Otras técnicas tienen ser utilizadas para examinar la compacticidad de la DNA, pero solamente un pequeño pedazo de DNA al mismo tiempo, dijo a Ryan Weil, estudiante de tercer ciclo Al Sudoeste de la biofísica de UT y el autor importante del estudio. “Una de las ventajas de nuestro arsenal es que clasificación a través de lotes de pedazos de DNA y nos da la información sobre cada segmento de una vez.”

Actualmente, los científicos determinan se giran qué genes, o expresado, en una célula extrayendo el ARN y midiendo cuánto de él se está produciendo para cada gen. Un microarray del ARN, o la “viruta del gen,” es el equipo estándar usado para medir niveles de la expresión del ARN.

“Solamente una pequeña parte de genes están haciendo el suficiente ARN que se detectará con microarrays del ARN,” dijo al Dr. Garner. “Muchos de los genes que hacen cantidades muy pequeñas del ARN son no obstante muy importantes, pero ellos bajan debajo del umbral de la detección para las técnicas actuales.”

La técnica Al Sudoeste de UT permite que los investigadores estudien los genes que no eran previamente accesibles porque no había suficiente ARN para hacer una medición de su actividad.

“Podemos conseguir la información sobre un número mucho más grande de genes, e independientemente de si estén en un estado en el cual puedan hacer el ARN, usando esta técnica que usando microarrays tradicionales del ARN,” el Dr. Garner dijo. “Esta tecnología puede informarnos no sólo si la DNA para un gen dado está presente o no, pero también si está condensado o desplegado y por lo tanto aliste para hacer el ARN.”

Sr. Weil dijo, “Podemos informar no apenas qué células ahora están haciendo, pero lo que podrían hacer en el futuro.”

http://www.swmed.edu/