Attenzione: questa pagina è una traduzione automatica di questa pagina originariamente in lingua inglese. Si prega di notare in quanto le traduzioni sono generate da macchine, non tutte le traduzioni saranno perfetti. Questo sito web e le sue pagine web sono destinati ad essere letto in inglese. Ogni traduzione del sito e le sue pagine web possono essere imprecise e inesatte, in tutto o in parte. Questa traduzione è fornita per comodità.

Le nuove guide potenti dell'azienda di trasformazione aprono i segreti dei batteri di un ferro-cibo conosciuti come Desulfovibrio vulgaris

Gerrit Voordouw, PhD, un microbiologo all'università di Calgary, ha passare i 20 anni scorsi che provano ad aprire i segreti dei batteri di un ferro-cibo conosciuti come Desulfovibrio vulgaris.

Questo microbo potente, trovato in petrolio e serbatoi, può mangiare il suo modo attraverso una conduttura appena in alcuni mesi. “Abbiamo voluto capire perché il D. vulgaris è così corrosivo alle condutture ed alle attrezzature del giacimento di petrolio,„ diciamo Voordouw. “Ed abbiamo saputo che il tasto era di ordinare i sui 3.394 geni.„

Quello è quando si è avvicinato a Christoph Sensen, PhD, circa usando la facoltà dell'azienda di trasformazione immenso potente del computer della medicina, Paracel Genematcher 2.

“Abbiamo chiesto al Dott. Sensen ed i suoi colleghi di progettare il chip del gene per noi il mercoledì ed entro giovedì, è stato fatto,„ dice Voordouw. “Che il genere di progettazione genetica della sonda richiederebbe normalmente i mesi per compire. Sono entusiasmato per avere così strumento potente della ricerca alle mie punte delle dita.„

“Quando gli scienziati stanno effettuando la ricerca genetica, il volume di informazioni è così grande, diventa rapidamente incontrollabile,„ dice Sensen, Direttore, centro di eccellenza di Sun per genomica visiva a U della facoltà della c di medicina. “Ecco perché abbiamo installato questa azienda di trasformazione altamente specializzata - un genere di über-calcolatore per gli scienziati genetici.„

Il Genematcher 2 ha 28.800 aziende di trasformazione specializzate che cercano i database multipli, compreso tutti genoma pubblici in GenBank. È il primo sistema di questa grandezza nel mondo disponibile i ricercatori via Internet. I ricercatori introducono i loro dati genomica nell'azienda di trasformazione, che cattura il loro sforzo genetico specifico e lo compara ai database genomica universalmente.

  • La ricerca genetica prova a rispondere a tre domande fondamentali:
    • dove un gene è situato all'interno di intera cianografia?
    • quali proteine sono prodotte e che cosa fanno?
    • come l'attivo è il gene?

“È come se conosciate tutti indirizzi e numeri di telefono per ognuno a Calgary e che cosa realmente dovete conoscere siete, che la gente è e che cosa fanno per vivere,„ dice Sensen. Il Genematcher 2 genera agli scienziati di un rapporto dicendo dove i geni sono e che cosa fanno. Il gruppo di Sensen poi produce un chip del gene che i ricercatori utilizzano negli esperimenti di seguito.

“Ora ho un materiale genetico dettagliato del D. vulgaris. Questa mappa sta guidando il nostro nuovo progetto - come sfruttare la capacità naturale dei batteri di diminuire i metalli tossici, quali uranio o cromo alle zone minerarie abbandonate,„ dice Voordouw.

I ricercatori genomica all'università di Calgary ed attraverso il Canada stanno usando Genematcher 2 per studiare i virus, le linee cellulari del cancro, i funghi e l'intero genoma umano.