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Outil moléculaire neuf pour indiquer exactement des mutations d'ADN parmi des milliers de cellules

Les scientifiques ont conçu un outil moléculaire neuf, « LigAmp aboubé, » pour indiquer exactement les mutations d'ADN parmi des milliers de cellules, l'équivalent de rechercher un typo unique dans une bibliothèque entière des livres. Études de préliminaire dans un nombre restreint de lignées cellulaires et d'exposition de liquide organiques que le test ultra-sensible peut aider pour trouver le cancer et la résistance au médicament microscopiques de VIH.

De « autres tests moléculaires le rendent très difficile de localiser une mutation dans une cellule particulière entourée par des milliers d'autres cellules qui n'ont pas la mutation, » dit James Eshleman, M.D., le Ph.D., qui a abouti l'étude avec des collègues à partir du Service de Pathologie de Johns Hopkins et du centre de lutte contre le cancer de Kimmel. « LigAmp essentiellement « bruit » filtre mouvement propre provoqué par les cellules normales et indique des mutations spécifiques. »

Les chercheurs disent que les tests sensibles pour localiser des mutations pourraient recenser le cancer dans les patients au haut risque pour la maladie. De tels tests pourraient même aider à trouver une récidive de cancer par la surveillance si le nombre de mutations monte au-dessus d'une valeur de seuil prédéterminée.

En plus du dépistage du cancer, le mutation-détecteur de Hopkins semble capable trouver le VIH résistant à la drogue. L'équipe l'a vérifié sur des prises de sang d'une poignée de patients avec le VIH et a localisé les erreurs d'ADN dans le virus elle-même qui le rendent résistant à certains antirétroviraux. Les résultats des analyses du test neuf sont publiés dans la question de novembre des méthodes de nature.

« Nous avons conçu LigAmp pour nous améliorer comment nous recherchons des variations extrêmement subtiles de viral et d'ADN cellulaire, » dit Eshleman, un professeur agrégé de pathologie et d'oncologie et le directeur associé pour le laboratoire de diagnose d'ADN chez Johns Hopkins. « L'indicatif moléculaire des cellules normales peut sembler identique à cancéreux excepté un échelon unique dans l'échelle-structure d'ADN. »

Les travaux de test à côté de produire un « aimant » moléculaire avec une affinité pour l'erreur d'ADN, également connue sous le nom de mutation ponctuelle. Si la mutation est trouvée, l'aimant grippe à lui et insère un gène bactérien. Le gène bactérien sert d'alerte et produit une couleur fluorescente visible aux programmes informatiques puissants.

Dans leurs études, les chercheurs de Hopkins ont vérifié LigAmp sur des lignées cellulaires de cancer du côlon, le sang des patients de VIH, et le liquide des conduits pancréatiques des malades du cancer. Des mutations uniques dans des cellules de cancer du côlon et des virus VIH résistant à la drogue ont été trouvées aux dilutions jusqu'à de 1 en 10.000 molécules. Des mutations du gène KRAS2 ont été trouvées dans les échantillons liquides de conduit provenant de trois malades du cancer pancréatiques, qui ont également correspondu aux mutations trouvées dans leurs tumeurs. LigAmp a également localisé une mutation de résistance au médicament, K103N appelé, dans les prises de sang de trois patients de VIH.

L'analyse approfondie de LigAmp avec de plus grandes tailles de l'échantillon et de Commissions aveuglées des échantillons cliniques est actuel en cours.

« Quelques études initiales prouvent que nous pouvons simultanément rechercher différentes mutations et mesurer le nombre de molécules mutées actuelles. Ceci peut nous aider à établir des Commissions des bornes de cancer pour examiner et à déterminer le bas ou des hauts niveaux de mutation. »

Le financement pour cette recherche a été fourni par les fonds de restitution de cigarette du Maryland, l'Institut national du cancer, et l'institut national de l'allergie et des maladies infectieuses.

Les collègues de Johns Hopkins travaillant avec Eshleman sont Chanjuan Shi, Susan Eshleman, Dana Jones, Noriyoshi Fukushima, Li Hua, Antony Parker, Charles Yeo, Ralph Hruban, et Michael Goggins.