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Les analyses expérimentales de la taille du génome les plus complètes des transcriptions sens-antisens jusqu'à présent

Une équipe des scientifiques aboutis par M. Kuniya Abe à partir du centre de RIKEN BioResource au Japon a exécuté jusqu'à présent une des analyses expérimentales de la taille du génome les plus complètes des transcriptions sens-antisens. Leurs découvertes sont publiées dans la question d'avril de la recherche de génome de tourillon.

les transcriptions Sens-antisens, ou le SATs, sont des paires de molécules d'ARN produites des brins d'ADN opposés au même lieu. Le numéro de SATs a recensé au cours des dernières années s'est développé considérablement, et elles sont censées maintenant pour comporter au moins 8% des gènes humains. Beaucoup de paires de SAT ont été impliquées dans étapes variées de règlement de gène, y compris la transcription, le traitement d'ARNm, l'épissure, la stabilité, le transport, et la traduction. Des exemples variés de tels gènes superposants ont été documentés sous toutes les formes de durée - à partir des virus et des prokaryotes aux végétaux et animaux.

Jusqu'à présent, la plupart des études sur des paires de SAT ont utilisé purement in silico des approches ; très pe'ont expérimental validé l'existence des molécules d'ARN superposantes in vivo. À cet effet, M. Hidenori Kiyosawa, l'auteur important sur le papier, présenté pour confirmer la présence de SATs dans un grand choix de types et de cultures cellulaires de tissu de souris, ainsi que pour recenser des caractéristiques courantes de ces seules transcriptions.

Utilisant une frite faite sur commande de puce ADN a conçu pour trouver l'expression de boucle-détail des paires 1947 de SAT, les chercheurs ont découvert que la majeure partie du SATs a été largement exprimée dans le cerveau, le coeur, et le testicule de souris, ainsi que dans les cellules souche embryonnaires et les fibroblastes de souris. Tandis qu'un certain SATs étaient exprimés à un niveau cohérent en tous les cellules et tissus vérifiés, d'autres ont montré les configurations marquées d'expression de tissu-détail.

Sur l'examen minutieux de plusieurs paires de SAT, le groupe d'Abe a constaté que les transcriptions ont partagé plusieurs caractéristiques saisissantes. Les analyses du nord d'hybridation de tache de six paires fait au hasard choisies de SAT ont indiqué que les lieux de SAT ont produit des transcriptions multiples des tailles variées, contrairement à une transcription unique qui est prévue sous l'un modèle traditionnel de transcription de gène-un. En outre, le SATs a tendu à être poly (A) - négatif et enrichi au noyau, qui propose fortement un rôle fonctionnel pour ces transcriptions dans le règlement de gène.

Abe et Kiyosawa ont également évalué quatre paires d'Arabidopsis SAT et ont expliqué que ces caractéristiques moléculaires ont été en grande partie économisées aux centrales.

« L'opinion conventionnelle en biologie moléculaire propose que poly (A)+ ARNm sont les médiateurs importants dans les flux d'information génétique, » Abe explique. « Cependant, l'information obtenue à partir de cette étude implique que quelques classes de poly (A) - l'ARN nucléaire négatif peuvent avoir des rôles biologiques importants. »

Parmi ces fonctionnements peut être la régulation de l'expression des gènes à un niveau de domaine, de ce type qui a été documenté pour plusieurs lieux imprimés. Des transcriptions antisens ont été montrées pour modifier l'état de méthylation du gène superposant d'associé. SATs pourrait également déclencher le règlement de gène de posttranscriptional par l'intermédiaire de l'interférence ARN (RNAi) en vertu de leur capacité de former les molécules bicaténaires d'ARN (ARN à double brin).

Une grande proportion de ces RNAs antisens représentent le non-codage RNAs. Ainsi, les chercheurs comptent que ces résultats mèneront à une meilleure compréhension des rôles du non-codage RNAs dans le règlement de gène.