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As análises experimentais genoma-largas as mais detalhadas de transcritos sentido-antisentido até agora

Uma equipe dos cientistas conduzidos pelo Dr. Kuniya Abe do centro de RIKEN BioResource em Japão executou uma das análises experimentais genoma-largas as mais detalhadas de transcritos sentido-antisentido até agora. Seus resultados são publicados na introdução de abril da pesquisa do genoma do jornal.

os transcritos Sentido-antisentido, ou SATs, são pares de moléculas do RNA geradas das costas opostas do ADN no mesmo locus. O número de SATs identificou nos os últimos anos cresceu substancialmente, e são acreditados agora para compreender pelo menos 8% de genes humanos. Muitos pares do SAT foram implicados nas várias fases do regulamento do gene, incluindo a transcrição, o processamento do mRNA, a emenda, a estabilidade, o transporte, e a tradução. Os vários exemplos de tais genes de sobreposição foram documentados em todos os formulários de vida - dos vírus e dos prokaryotes aos vegetais e animal.

Até agora, a maioria de estudos em pares do SAT utilizaram puramente in silico aproximações; muito poucos validaram experimental a existência de moléculas de sobreposição do RNA in vivo. Com isto em mente, Dr. Hidenori Kiyosawa, autor principal no papel, expor para confirmar a presença de SATs em uma variedade de tipos e culturas celulares do tecido do rato, assim como para identificar características comuns destes transcritos originais.

Empregando uma microplaqueta feito-à-medida do microarray projectou detectar uma expressão costa-específica dos pares 1947 do SAT, os pesquisadores descobriram que a maioria do SATs estiveram expressados extensamente no cérebro, no coração, e no testículo do rato, assim como em células estaminais e em fibroblasto embrionários do rato. Quando algum SATs foi expressado a nível consistente em todas as pilhas e tecidos testados, outro testes padrões tecido-específicos marcados exibidos da expressão.

Em cima do exame próximo de diversos pares do SAT, o grupo de Abe encontrou que os transcritos compartilharam de diversas características impressionantes. As análises do norte da hibridação da mancha de seis pares aleatòria escolhidos do SAT revelaram que os locus do SAT geraram transcritos múltiplos de vários tamanhos, em contraste com um único transcrito que fosse esperado sob o um modelo tradicional do transcrito do gene-um. Além disso, o SATs tendeu a ser poli (A) - negativo e enriquecido no núcleo, que sugere fortemente um papel funcional para estes transcritos no regulamento do gene.

Abe e Kiyosawa igualmente avaliaram quatro pares de Arabidopsis SAT e demonstraram que estas características moleculars estiveram conservadas pela maior parte nas plantas.

“A opinião convencional na biologia molecular sugere que poli (os mRNAs de A)+ são mediadores principais nos fluxos da informação genética,” Abe explica. “Contudo, a informação obtida deste estudo implica que algumas classes de poli (A) - o RNA nuclear negativo podem ter funções biológicas importantes.”

Entre estas funções pode ser o regulamento da expressão genética em um nível do domínio, tal como aquele que foi documentado para diversos locus imprimidos. Os transcritos antisentido foram mostrados para alterar o estado do methylation do gene de sobreposição do sócio. SATs pôde igualmente provocar o regulamento do gene do posttranscriptional através da interferência do RNA (RNAi) em virtude de sua capacidade para formar moléculas dobro-encalhadas do RNA (dsRNA).

Uma grande proporção destes RNAs antisentido representa a não-codificação RNAs. Assim, os pesquisadores esperam que estes resultados conduzirão a uma compreensão melhor dos papéis da não-codificação RNAs no regulamento do gene.