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Los análisis experimentales genoma-anchos más completos de transcripciones sentido-antisentido hasta la fecha

Las personas de los científicos llevados por el Dr. Kuniya Abe del centro de RIKEN BioResource en Japón han realizado uno de los análisis experimentales genoma-anchos más completos de transcripciones sentido-antisentido hasta la fecha. Sus conclusión se publican en la aplicación de abril la investigación del genoma del gorrón.

las transcripciones Sentido-antisentido, o SATs, son pares de moléculas del ARN generadas de cabos opuestos de la DNA en el mismo lugar geométrico. El número de SATs determinó en los últimos años ha crecido substancialmente, y ahora se creen para comprender por lo menos el 8% de genes humanos. Muchos pares del SAT se han implicado en diversos escenarios de la regla del gen, incluyendo la transcripción, el tramitación del mRNA, empalmar, estabilidad, transporte, y la traslación. Los diversos ejemplos de tales genes que recubrían se han documentado en todas las formas de vida - de virus y de prokaryotes a las instalaciones y a los animales.

Hasta la fecha, la mayoría de los estudios en pares del SAT han utilizado puramente in silico aproximaciones; muy pocos han validado experimental la existencia de las moléculas del ARN que recubrían in vivo. Con esto en la mente, el Dr. Hidenori Kiyosawa, el autor importante en el papel, establecido para confirmar la presencia de SATs en una variedad de tipos del tejido del ratón y de cultivos celulares, así como para determinar características comunes de estas transcripciones únicas.

Empleando una viruta por encargo del microarray diseñó descubrir la expresión cabo-específica de los pares 1947 del SAT, los investigadores descubrieron que la mayor parte del SATs fue expresado extensamente en cerebro, corazón, y testículo del ratón, así como en células madres y fibroblastos embrionarios del ratón. Mientras que algún SATs fue expresado en un nivel constante en todas las células y tejidos probados, otros las configuraciones tejido-específicas marcadas exhibidas de la expresión.

Sobre el examen cercano de varios pares del SAT, el grupo de Abe encontró que las transcripciones compartieron varias características llamativas. Los análisis septentrionales del hibridación de la mancha blanca /negra de seis pares aleatoriamente elegidos del SAT revelaron que los lugares geométricos del SAT generaron las transcripciones múltiples de diversas tallas, en contraste con una única transcripción que se prevee bajo un modelo tradicional de la transcripción del gen-uno. Además, el SATs tendió a ser polivinílico (A) - negativa y enriquecida en el núcleo, que sugiere fuertemente un papel funcional de estas transcripciones en la regla del gen.

Abe y Kiyosawa también evaluaron cuatro pares de Arabidopsis SAT y demostraron que estas características moleculares fueron conservadas en gran parte en instalaciones.

La “creencia convencional en biología molecular sugiere que polivinílico (los mRNAs de A)+ son mediadores importantes en flujos de la información genética,” Abe explica. “Sin embargo, la información obtenida de este estudio implica que algunas clases de polivinílico (A) - el ARN nuclear negativo pueden tener funciones biológicas importantes.”

Entre estas funciones puede ser la regla de la expresión génica en un nivel del dominio, tal como el que se ha documentado para varios lugares geométricos impresos. Las transcripciones antisentido se han mostrado para alterar el estado de la metilación del gen del socio que recubría. SATs pudo también accionar la regla del gen del posttranscriptional vía la interferencia del ARN (RNAi) en virtud de su capacidad de formar las moléculas doble-trenzadas del ARN (dsRNA).

Una proporción grande de estos RNAs antisentido representa la no-codificación RNAs. Así, los investigadores cuentan con que estos resultados lleven a una mejor comprensión de papeles de la no-codificación RNAs en la regla del gen.