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As ajudas da simulação computorizada compreendem o processo da transcrição do ADN

Os químicos da universidade de New York empregaram uma simulação computorizada cujos os resultados aumentassem a compreensão científica do processo da transcrição do ADN. O estudo, financiado pelos institutos de saúde nacionais, aparece na introdução do 7 de junho das continuações da Academia Nacional das Ciências.

A pesquisa precedente indicou essa cromatina--a substância de um cromossoma que consiste em proteínas do histone e em ADN--exibe conformações sal-dependentes. Especificamente, as correntes dos nucleosomes, os blocos de apartamentos de cromatina que aparecem como grânulo-como estruturas ao longo do ADN, dobram-se em uma fibra condensada enquanto o sal aumenta. Esta dobradura e a interacção entre estruturas da cromatina regulam a expressão genética fundamental. Contudo, o mecanismo molecular que é a base deste processo permanece obscuro.

A equipa de investigação, que os químicos incluídos Tamar Schlick, Jian Sun (agora na Faculdade de Medicina de Cornell), e Qing Zhang de NYU, analisaram uma disposição 12 nucleosome. Usando uma variedade de condições de sal, os pesquisadores encontraram que a disposição nucleosomal formou estruturas tridimensionais irregulares do ziguezague em concentrações altas de sal e estruturas da “grânulo-em-um-corda” no baixo sal, demonstrando que a estrutura da cromatina depende fortemente de seu ambiente de sal.

A Schlick e a seus colegas, estes resultados revelaram que em um ambiente de baixo-sal, o linker DNAs na disposição estêve repelido, impedindo a dobradura da disposição e tendo por resultado a grânulo-como a estrutura. Contudo, sob condições de alto-sal, o exame da repulsa do ADN do linker permite perto contactos e atracção entre nucleosomes, permitindo que a disposição dobre-se. Porque a dobradura ou a revelação da cromatina impedem ou permitem o acesso transcricional da maquinaria ao ADN em um cromossoma, este estudo da simulação computorizada ajuda a compreender o mecanismo da expressão genética e do silêncio.