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Las ayudas de la simulación por ordenador entienden proceso de la transcripción de la DNA

Los químicos de la universidad de Nueva York han empleado una simulación por ordenador cuyos resultados han aumentado la comprensión científica del proceso de la transcripción de la DNA. El estudio, financiado por los institutos de la salud nacionales, aparece en la aplicación del 7 de junio los procedimientos de la National Academy of Sciences.

La investigación anterior ha indicado esa cromatina--la substancia de un cromosoma que consiste en las proteínas de la histona y la DNA--exhibe conformaciones sal-relacionadas. Específicamente, las cadenas de nucleosomes, los bloques huecos de la cromatina que aparecen como moldura-como las estructuras a lo largo de la DNA, doblan en una fibra condensada mientras que la sal aumenta. Este plegamiento y la interacción entre las estructuras de la cromatina regulan la expresión génica fundamental. Sin embargo, el mecanismo molecular que es la base de este proceso sigue siendo no entendible.

El equipo de investigación, que los químicos incluidos Tamar Schlick, Jian Sun (ahora en la Facultad de Medicina de Cornell), y Qing Zhang de NYU, analizaban un arsenal nucleosome 12. Usando una variedad de condiciones de la sal, los investigadores encontraron que el arsenal nucleosomal formó las estructuras tridimensionales irregulares del zigzag en las altas concentraciones de la sal y las estructuras de la “moldura-en-uno-hilera” en poco salado, demostrando que la estructura de la cromatina depende en gran medida de su ambiente de la sal.

A Schlick y a sus colegas, estos resultados revelaron que en un ambiente bajo en sal, la máquina para hacer chorizos DNAs en el arsenal fue repelida, previniendo el plegamiento del arsenal y dando por resultado a moldura-como la estructura. Sin embargo, bajo condiciones de la alto-sal, el blindaje de la repulsión de la DNA de la máquina para hacer chorizos permite cerca contactos y la atracción entre los nucleosomes, permitiendo que el arsenal doble. Pues el plegamiento o el despliegue de la cromatina previene o permite el acceso de la maquinaria transcriptiva a la DNA en un cromosoma, este estudio de la simulación por ordenador ayuda a entender el mecanismo de la expresión génica y de imponer silencio.