Analyse fonctionnelle d'expression du gène humaine de cellule souche hématopoïétique utilisant des zebrafish

Qu'obtenez-vous quand vous mélangez des frites et des zebrafish d'ARN ? Une méthode à deux étages neuve pour étudier l'expression du gène humain diffère en cellules souche humaines et cellules d'ancêtre, selon un article neuf dans la biologie de PLoS de tourillon d'accès ouvert.

Dans le papier, Catherine Verfaillie et collègues recensent 277 gènes humains avec différents profils d'expression du gène en cellules de cheminée et d'ancêtre impliquées dans le développement de globule sanguin, ou l'hématopoïèse. Le papier propose également qu'un facteur de croissance des fibroblastes appelé de régulateur de développement puisse jouer un rôle dans l'hématopoïèse.

La méthode neuve peut également avoir la pertinence au delà de l'inducteur du développement de sang. « Ceci pourrait être fait non seulement pour des cellules souche hématopoïétiques comme est fait ici mais également pour le cerveau, pancréas, endothélium, lissez et le muscle cardiaque, à cause de l'homologie élevée entre l'homme et les poissons à l'étude de ces tissus, » explique Verfaillie.

La puce ADN de transcription de l'ARN, ou le « ARN ébrèchent, » Verfaillie permis et collègues pour comparer l'expression du gène dans les cultures cellulaires à on ou à peu de cellules souche hématopoïétiques. Précédemment, les auteurs avaient développé une méthode pour moissonner des cellules souche utilisant la moelle osseuse et le sang des cordons ombilicaux. Soixante et un des 277 gènes avérés pour avoir différents profils d'expressions en cellules de cheminée et d'ancêtre n'a eu aucun fonctionnement connu en cellules souche hématopoïétiques humaines, bien que les gènes ressemblent à des gènes trouvés dans les zebrafish. Les poissons avec des versions mutées de quatorze de ces gènes ont développé des troubles sanguins, proposant que les gènes soient nécessaires pour l'hématopoïèse normale. Trois des 14 gènes sont connus pour jouer un rôle dans la signalisation de facteur de croissance des fibroblastes. À l'avenir, les chercheurs peuvent apprendre la relation spécifique entre le facteur de croissance des fibroblastes et l'hématopoïèse.

Mais Verfaillie charge que l'étude a des implications pour des chercheurs dans inducteurs variés. « C'est l'un des premiers cas dans la littérature où l'analyse de l'expression des gènes de haut-débit utilisant des choix de gène a été fonctionellement validée par véritable analyse fonctionnelle de haut-débit dans un organisme modèle, » dit Verfaillie. Avec cette approche, les études neuves peuvent mettre à zéro dedans sur des gènes avec des rôles centraux dans d'autres genres de développement humain.