Análise funcional da expressão genética hematopoietic humana da célula estaminal usando zebrafish

Que você obtem quando você mistura microplaquetas e zebrafish do RNA? Um método de duas fases novo para estudar a expressão genética humana difere em células estaminais humanas e em pilhas do ancestral, de acordo com um artigo novo na biologia de PLoS do jornal do acesso aberto.

No papel, Catherine Verfaillie e os colegas identificam 277 genes humanos com perfis diferentes da expressão genética nas pilhas da haste e do ancestral envolvidas na revelação do glóbulo, ou no hematopoiesis. O papel igualmente sugere que um regulador desenvolvente chamado factor de crescimento do fibroblasto possa jogar um papel no hematopoiesis.

O método novo pode igualmente ter a importância além do campo da revelação do sangue. “Isto poderia ser feito não somente para células estaminais hematopoietic como é feito aqui mas igualmente para o músculo do cérebro, do pâncreas, do endothelium, o liso e o cardíaco, devido à homologia alta entre o homem e os peixes durante o processo de desenvolvimento destes tecidos,” explica Verfaillie.

O microarray do transcrito do RNA, ou do “a microplaqueta RNA,” permitiram que Verfaillie e os colegas comparassem a expressão genética nas culturas celulares com o muitos ou poucas células estaminais hematopoietic. Previamente, os autores tinham desenvolvido um método para colher as células estaminais que usam a medula e o sangue dos cabos de cordão umbilical. Sessenta e um dos 277 genes encontrados para ter perfis diferentes das expressões em pilhas da haste e do ancestral não teve nenhuma função conhecida em células estaminais hematopoietic humanas, embora os genes se assemelham aos genes encontrados nos zebrafish. Os peixes com versões transformadas de quatorze destes genes desenvolveram as desordens de sangue, sugerindo que os genes fossem necessários para o hematopoiesis normal. Três dos 14 genes são sabidos para jogar um papel na sinalização do factor de crescimento do fibroblasto. No futuro, os pesquisadores podem aprender o relacionamento específico entre o factor de crescimento do fibroblasto e o hematopoiesis.

Mas Verfaillie força que o estudo tem implicações para pesquisadores em vários campos. “Este é um dos primeiros exemplos na literatura onde a análise da expressão genética da alto-produção que usa disposições do gene foi validada funcional pela análise funcional verdadeira da alto-produção em um organismo modelo,” diz Verfaillie. Com esta aproximação, os estudos novos podem zerar dentro em genes com papéis fundamentais em outros tipos da revelação humana.