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Nuove innovazioni significative nella comprensione come i geni in mammiferi sono controllati

Un consorzio internazionale degli istituti di ricerca e dei ricercatori del genoma, compreso il canto natalizio J. Bult degli scienziati del personale del laboratorio di Jackson, Ph.D. e Martin Ringwald, Ph.D., ha riferito le nuove innovazioni significative nella comprensione come i geni in mammiferi sono controllati.

Secondo il Dott. Bult, “gli studi forniscono le comprensioni senza precedenti sia nella natura dinamica del genoma che nell'importanza dell'organizzazione del genoma sulla sua funzione. I dati serviranno per molti anni da base per la scoperta.„

I cinque anni scorsi hanno veduto il completamento di parecchie sequenze mammifere del genoma, ma questi sono di valore limite a meno che possiamo decodificare il modo che sono tradotti in funzioni richieste per creare un animale maturo. Soltanto intorno 2% del genoma è tradotto in proteine (trascrizioni) di codifica, le particelle elementari delle celle che compongono i nostri organismi. Ma che 2% e come è gestito?

Il composto intermedio chiave è il transcriptome, che ora è stato conforme alla caratterizzazione più completa mai. Lo studio approfondito ha usato la nuova tecnologia che etichetta esattamente l'inizio e la conclusione di ciascuno oltre di 20 milione messaggi del RNA (trascrizioni) creati dai geni, con conseguente profilo potente del controllo di regolamentazione dei geni. Inoltre, egualmente ha indicato che quello il senso di sovrapposizione/paia antisenso della trascrizione (entrambi i fili) è quasi universale nel genoma ed in quei senso/paia antisenso è particolarmente abbondante nei luoghi impressi, tenenti con il ruolo presunto del RNA di non codifica nel meccanismo di fare tacere del gene.

Poiché i mammiferi hanno soltanto geni leggermente più convenzionali (intorno 22.000) che un nematode comparativamente semplice, i risultati dello studio del consorzio di FANTOM indicano chiaramente che mentre le proteine comprendono le componenti essenziali le nostre celle, lo sviluppo degli organismi multicellulari come i mammiferi è gestito dai grandi importi di non codifica regolatrice RNAs che fino ad oggi non è stata sospettata per esistere o essere pertinente alla nostra biologia. I risultati suggeriscono che la differenza fra il mouse e l'uomo possa risiedere bene nei sistemi di controllo di questi geni e non nelle strutture delle proteine alcune di loro codice per.

“Abbiamo fornito alla comunità di ricerca biomedica gli strumenti per capire i comandi che sono necessari fare un mammifero. Abbiamo decifrato la sequenza del genoma non solo per il codice per la fabbricazione delle parti (proteine) di un mammifero, ma anche il codice per la fabbricazione dei moduli di destra, nei giusti importi, nel giusto posto, al momento giusto.„ indica il direttore di progetto Yoshihide Hyashizaki.

I risultati sono stati pubblicati in due documenti nell'emissione del 2 settembre della scienza del giornale dal consorzio di FANTOM per il gruppo di ricerca di prospezione del genoma, scienze genomiche di RIKEN concentrano (GSC), laboratorio di scienza dell'istituto di RIKEN Yokohama e del genoma, istituto di ricerca e di scoperta ed istituto di RIKEN Wako (gruppo centrale della rete del genoma). Il Dott. Bult è un membro da sempre del consorzio di FANTOM. Lei ed il suo gruppo a Jackson hanno contribuito pubblicamente all'analisi dei dati di RIKEN ed alla sua integrazione con conoscenza biologica attuale circa il mouse del laboratorio - nel database disponibile dell'informatica del genoma del mouse (http://www.informatics.jax.org).

Questi studi sono stati effettuati pricipalmente sui mouse, le speci di mammiferi sperimentali più ampiamente usate. I dati umani equivalenti non sono indietro lontano e RIKEN e molti membri di FANTOM attivamente sono interessati nella fase prossima, il consorzio della rete del genoma (http://www.mext-life.jp/genome/english/index.html), che mira ad utilizzare questi nuovi strumenti per capire lo sviluppo e la malattia umani. Connesso con la pubblicazione dei documenti di scienza, tutte informazioni saranno pubblicate pubblicamente su Internet: http://www.ddbj.nig.ac.jp/, http://fantom3.gsc.riken.jp/db/.