Advertencia: Esta página es una traducción de esta página originalmente en inglés. Tenga en cuenta ya que las traducciones son generadas por máquinas, no que todos traducción será perfecto. Este sitio Web y sus páginas están destinadas a leerse en inglés. Cualquier traducción de este sitio Web y su páginas Web puede ser imprecisa e inexacta en su totalidad o en parte. Esta traducción se proporciona como una conveniencia.

El equipo de “reglas simples” esa naturaleza aparece utilizar para diseñar las proteínas

Examinando cómo las proteínas se han desarrollado, los investigadores al sudoeste del centro médico de UT han descubierto que un equipo de “reglas simples” esa naturaleza aparece utilizar para diseñar las proteínas, gobierna a los científicos ahora ha empleado para crear las proteínas artificiales que la mirada y la función apenas tienen gusto de sus contrapartes naturales.

En dos papeles que aparecen en la naturaleza del gorrón, el Dr. Rama Ranganathan, profesor adjunto de la farmacología, y sus colegas detalla un nuevo método para crear las proteínas artificiales basadas solamente en la información que derivaron de analizar ciertas características que las proteínas naturales individuales tienen en común con uno a.

“La meta de nuestra investigación no era encontrar otra manera de hacer las proteínas artificiales en el laboratorio, pero descubrir las reglas que la naturaleza y la evolución diseñaban las proteínas,” el Dr. Ranganathan dijo. “Las reglas que hemos extraído del archivo evolutivo de proteínas contienen una parte sustancial de la información requerida para reconstruir las proteínas del moderno-día. Estamos construyendo soluciones nos cerramos tan que, por lo menos en un tubo de ensayo, no podemos informarles aparte de las proteínas naturales.”

El Dr. Ranganathan dijo que podría todavía haber muchas pequeñas diferencias entre las proteínas artificiales y las naturales, y la prueba adicional necesitaría ser hecha para determinar si trabajan dentro de un organismo real.

“Nuestro trabajo sugiere que las proteínas del moderno-día hayan heredado probablemente mucha de la información que especificaba su estructura y aspectos básicos de la función de sus antepasados, pero es también posible que han estado ajustadas en un cierto plazo para tener sus propias características idiosincrásicas en células específicas,” dijo al Dr. Ranganathan, que también es investigador (HHMI) del Howard Hughes Medical Institute. “Estamos sugiriendo que las funciones que las proteínas tienen son hoy el resultado de ajustar un patrón ancestral básico que ahora hemos imaginado.”

Las proteínas, que realizan las funciones de la vida de la carrocería, se componen de las moléculas llamadas los aminoácidos, que se atan juntos en cadenas largas. Estas cadenas colocan sobre uno a, o doblan, de una variedad de maneras. Sus formas tridimensionales específicas ayudan a las proteínas para realizar sus funciones biológicas.

Por décadas, los científicos han sabido que la serie de los aminoácidos que componen una proteína determina su función de la proteína la estructura y. Qué no se ha sabido es lo que produce la información contenida dentro de esa serie la estructura apropiada.

Todas las proteínas se componen de 20 aminoácidos específicos. Incluso para una pequeña proteína compuesta de 100 aminoácidos, el número de combinaciones posibles de aminoácidos es staggering, muchas veces más que el número de átomos en el universo sabido.

¿“Cómo la naturaleza ideó las series correctas que dieron lugar a proteínas de funcionamiento? De alguna manera, encontró una manera, el” Dr. Ranganathan dijo. “Una implicación de nuestro trabajo es que el proceso evolutivo del proteína-diseño puede no ser tan complejo como fue pensado previamente.”

La investigación anterior ha mostrado eso para un grupo dado de proteínas relacionadas, o la familia de la proteína, todos los miembros de la familia comparte las estructuras y las funciones comunes. Examinando a más de 100 piezas de una familia de la proteína, el grupo al sudoeste de UT encontró que las proteínas comparten una configuración específica de las reglas de selección del aminoácido que son únicas a esa familia.

“Qué hemos encontrado somos la carrocería de la información que es fundamental antigua dentro de cada familia de la proteína, y que es suficiente la información para especificar la estructura de las proteínas del moderno-día,” el Dr. Ranganathan dijo.

Él y sus personas probaron sus “reglas nuevamente descubiertas” espigadas del archivo evolutivo introduciéndolas en un programa de computadora que él desarrolló. El programa generó series de los aminoácidos, que los investigadores entonces “detrás-tradujeron” para crear genes artificiales. Insertado una vez en bacterias del laboratorio, los genes produjeron las proteínas artificiales según lo predicho.

“Encontramos que cuando están aisladas, nuestras proteínas artificiales exhiben el mismo alcance de la estructura y la función que es exhibida por el equipo que comienza de proteínas naturales,” el Dr. Ranganathan dijo. “La prueba real será ponerlas nuevamente dentro de un organismo vivo tal como moscas de la levadura o del vinagre y considerar cómo compiten con las proteínas naturales en un sentido evolutivo.”

Otros investigadores al sudoeste de UT implicados en el trabajo son autores importantes Michael Socolich, especialista de la investigación de HHMI, y el Dr. Guillermo Russ, instructor auxiliar de la farmacología; Steve Lockless, estudiante de medicina; Prashant Mishra, estudiante del programa de entrenamiento del científico médico; Brezo Lee, técnico de HHMI; y el Dr. Kevin Gardner, profesor adjunto de la bioquímica y de la farmacología. Los investigadores de Massachusetts Institute of Technology también participaron.