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L'empreinte digital génétique démasque les vandales microbiens

Pour la première fois l'analyse de l'ADN peut recenser les micros-organismes papier-dégradants.

Ceci est rendu possible par un processus moléculaire développé pour les documents infectés fongiques à l'université de Vienne avec le support à partir des fonds autrichiens FWF de la Science. La substance fongique peut être maintenant clairement recensée au moyen d'une région d'ADN connue sous le nom d'ITS1, la facilitant pour choisir des contre-mesures efficaces pour économiser les documents historiques.

Il est généralement assez facile de dire comment les ravages du temps prennent leur péage sur les papiers historiquement précieux. Vu les bonnes conditions, micros-organismes tels que des champignons peuvent coloniser un document et graduellement le dégrader. Les méthodes néanmoins conventionnelles pour l'identification précise de ces champignons sont élaborées et imprécises. Elles exigent relativement un grand nombre de matériau d'échantillonnage ainsi que l'identification microscopique de bouturage et suivante de l'échantillon fongique - un prolongé et sujet aux erreurs, procédé. Une équipe aboutie par M. Guadalupe Pinar à l'université du service de Vienne de la chimie médicinale a maintenant développé un procédé pour rapidement et sans équivoque classifiant la substance fongique sur la base de leur ADN.

Mutations multiples

M. Pinar a tiré profit d'une caractéristique spéciale du matériel génétique de beaucoup d'espèces fongiques - une région d'ADN connue sous le nom d'ITS1 qui montre d'énormes différences dans l'ordonnancement des paires de bases d'ADN d'une tension à l'autre. Donnant la source de ces caractéristiques discernantes, M. Pinar a dit : « La région ITS1 est sujette souvent à des mutations spontanées. Ce sont inoffensifs car ce ¹ t de doesn de région d'ADN ont n'importe quel fonctionnement reconnaissable dans le génome et les jeux fongiques aucune partie directe dans la survie d'une substance fongique. Mais les mutations ont comme conséquence chaque ¹ fongique de substance ayant sa propre région ITS1 typique et pour cette raison une empreinte digital très indubitable. »

Un grand nombre d'ADN sont exigés pour analyser ces différences de séquence dans des relations biologiques moléculaires. Elles pourraient théoriquement être obtenues à l'aide d'un grand nombre de matériau de base - mais ce n'est pas une option avec les documents historiques.

Les chercheurs ont maintenant employé des méthodes de pointe pour copier des quantités suffisantes de l'ADN requis. Astrid Michaelsen, une biologiste certifiée et associée du ¹ s de M. Pinar team, expliqué : « Nous employons l'amplification en chaîne par polymérase, un procédé très efficace pour copier différentes régions d'ADN. Il nous permet de produire un grand nombre d'éclats ITS1 avec un niveau élevé de pureté, même lorsque seulement très les petites quantités de matériau fongique sont procurables pour l'extraction d'ADN. Ceci permet pour donner des soins maximum aux documents infectés. »

Briser le moulage

Une fois que les éclats ITS1 suffisants ont été copiés l'analyse de l'ADN réelle peut être effectuée. Dans une technique connue sous le nom d'électrophorèse en gel de gradient de dénaturant, les éclats ITS1 sont appliqués à un gel qui est soumis à une charge électrique. Les échantillons ITS1 dans ce domaine de tension couvrent différentes distances selon les mutations, ainsi chaque distance est caractéristique d'une substance fongique donnée. Un échange même d'une paire de bases a comme conséquence les différences qui permettent à la substance fongique exacte d'être recensée.

La méthode neuve a un autre avantage par rapport aux techniques conventionnelles - même des champignons morts peuvent être employés comme matériau de base. Michaelsen a commenté : Les « champignons deviennent inactifs sur le papier après environ 20 ans, mais le matériau de base pour nos méthodes, l'ADN, peut être aussi bien isolé dans un tel matériau. Ceci signifie que les échantillons sur lesquels les champignons sont inactifs mais le processus de dégradation soit encore actuel peuvent également être vérifiés suivre nos méthodes. C'est où les techniques conventionnelles tombent vers le bas, car elles se fondent sur cultiver les champignons viables. »

Les découvertes de ce projet desserré par FWF autrichien de fonds de la Science permettront maintenant pour développer les mesures de réfection et de conservation qui sont conçues en fonction chaque type de champignon. Ceci sera effectué en coopération avec l'Istituto Centrale selon la La Patologia del Libro à Rome, qui fournit également les échantillons historiques. La découverte autrichienne aidera à préserver les trésors culturels pour des générations futures.