Le microprocesseur Neuf active le diagnostic rapide des tensions de grippe

Les Scientifiques de l'Université du Colorado à Boulder et le Centres Pour Le Contrôle Et La Prévention Des Maladies (CDC) ont développé un test microprocesseur-basé qui peut permettre à plus de laboratoires de diagnostiquer des infections de grippe et d'apprendre plus au sujet des virus entraînant la maladie.

Le FluChip a avec succès discerné parmi 72 tensions de grippe - comprenant la tension de grippe aviaire de H5N1 - en moins de 12 heures. La recherche a été aboutie par l'Université du scientifique Kathy L. Rowlen, Ph.D. du Colorado, et a été financée par l'Institut National de l'Allergie et des Maladies Infectieuses (NIAID), une partie des Instituts de la Santé Nationaux (NIH). Elle apparaît dans la question actuelle du Tourillon de la Microbiologie Clinique.

Les Laboratoires en travers des Etats-Unis peuvent faire les tests de base pour déterminer le type et le sous-type d'un virus de la grippe dans plusieurs heures. Cependant, seulement la CDC et une poignée d'autres laboratoires ont internationalement les installations de haut niveau de sécurité biologique requises pour réaliser les essais spécialisés qui indiquent les petits groupes critiques au sujet d'autres caractéristiques techniques du virus de l'origine géographique et. Puisque la technologie de FluChip pourrait être utilisée dans les installations plus élémentaires de sécurité biologique, elle pourrait augmenter la capacité diagnostique de grippe en permettant à plus de laboratoires de déterminer l'origine géographique d'un virus neuf émergent et si sa source est humaine ou non-humaine ; apprenez comment étroitement lié un virus neuf est à ceux qui a diffusé précédemment ; et trouvez les altérations génétiques qui peuvent signaler le virus deviennent plus virulentes.

« La capacité recensent à rapidement et exactement des tensions de la grippe serait inestimable aux efforts internationaux de contrôle de grippe, » dit Directeur Anthony S. Fauci, M.D. de NIAID « que C'est une avance d'une manière encourageante. »

« Cette recherche de pointe est indispensable à nos efforts pour protéger la santé du pays, et elle peut fournir un outil neuf dans notre boîte à outils dans la lutte contre la grippe, » dit Directeur Julie Gerberding de CDC, M.D. « Ceci est un excellent exemple des avances que nous pouvons réaliser quand les chercheurs du gouvernement et scolaires travaillent ensemble, et nous attendons avec intérêt la future collaboration. »

Le FluChip est un type de puce ADN, généralement appelé une puce de gène. Bien Qu'il y ait de nombreuses variations, des puces ADN peuvent être effectuées à l'aide d'un bras robotique pour relâcher des centaines ou des milliers d'endroits de matériel génétique - ADN ou ARN - de séquence connue sur un guide de microscope. Les endroits, sondes appelées, sont alors exposés à un échantillon de composition inconnue : par exemple, matériau pris d'une personne avec une maladie de non disgnostiqué. Sonde que les séquences du gène de correspondance de bactéries ou de virus présents dans l'échantillon ont comme conséquence la capture du gène cible. En analysant la configuration des objectifs capturés, les médecins peuvent diagnostiquer la cause de l'infection.

Un défi principal en concevant une puce de gène pour le diagnostic de grippe détermine quelles séquences du gène de virus de la grippe à utiliser en tant que sondes, M. Rowlen de notes. Dans un papier d'accouplement, les chercheurs décrivent une voie neuve puissante d'analyser des immenses quantités d'information génétique de virus de la grippe pour trouver les séquences les plus instructives. « Notre objectif était de développer une technique performante pour le mien de grandes bases de données pour recenser les régions du génome de grippe qui sont en grande partie les mêmes de la tension à la tension ainsi qu'aux séquences tension-particulières, » M. Rowlen dit.

Commençant par une piscine de presque 5.000 séquences du gène de grippe, les chercheurs avaient l'habitude le procédé d'exploitation de données pour sélecter 55 Séquences d'ARN de grippe pour l'usage en tant que sondes sur le FluChip. Parmi eux étaient les sondes choisies pour activer le dépistage de deux des tensions de grippe les plus communes diffusant actuel chez l'homme, des tensions H1N1 et H3N2, ainsi que du H5N1 de tension de grippe aviaire.

La CDC a fourni des isolats de grippe à l'Université des chercheurs du Colorado pour recenser utilisant le FluChip. Les échantillons ont compris les tensions de grippe qui infectent des êtres humains, des chevaux, des oiseaux et des porcs. La CDC a partagé ses compétences techniques sur la grippe et a fonctionné à côté de l'Université du personnel du Colorado dans des laboratoires de CDC pour traiter les échantillons de grippe, pour tester la technologie de FluChip et pour analyser les résultats. Les résultats Combinés après deux séries des tests ont prouvé que le FluChip a permis à des utilisateurs d'obtenir des informations correctes sur le type et le sous-type - a considéré une pleine caractérisation d'une tension - de 72 pour cent des échantillons. Des informations Complètes sur le type - mais seulement l'information partielle sur le sous-type - ont été obtenues pour 13 pour cent des échantillons, alors que 10 pour cent des échantillons pourraient être recensés par le type seulement (aucune informations sur le sous-type). Cela a pris environ 11 heures pour effectuer les tests et apprendre les identités des tensions, enregistrez les scientifiques.

« Nous avons été étonnés et heureux à quel point la puce exécutée dans ces premiers tests, » indique M. Rowlen. Les chercheurs de la CDC et de l'Université du Colorado continuent à polir le FluChip et l'espoir de porter le temps global prié pour obtenir le pleins type et caractérisation de sous-type à l'une heure au-dessous de.

Développant le gène des puces améliorées pour le diagnostic de grippe dépend, en partie, de la disponibilité publique disponible des données de séquence génomique, des notes Karen Lacourciere, Ph.D., officier de programme de grippe de NIAID. En plus des bases de données de séquence de génome de grippe renfermées au Laboratoire National de Los Alamos et à la CDC, les chercheurs ont également utilisé l'information du Projet NIAID-supporté de Séquençage du Génome de Grippe. NIAID effectue rapidement ce GenBank traversant disponible de l'information de séquence publiquement -, une base de données en ligne internationale et explorable financée par NIH. Ce moyen augmente la capacité des chercheurs de sélecter des séquences d'objectif pour les puces diagnostiques de prochain rétablissement, M. Lacourciere dit.

NIH et CDC sont deux des 13 composants principaux du Département des Services Sociaux et de Hygiène.

www.cdc.gov et www.nih.gov.