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Comment le virus VIH subit une mutation pour échapper au système immunitaire de l'organisme

Une étude collaborative pilote a découvert comment le virus VIH élude le système immunitaire du corps humain.

L'ordinateur-intensif de collaboration de recherches - en faisant participer des scientifiques de la Colombie-Britannique centrez pour l'excellence dans le HIV/SIDA, (MGH) le Massachusetts General Hospital, la recherche de Microsoft et le laboratoire national de Los Alamos - utilisé fortement, méthodes de recherche statistiques tranchantes pour vérifier comment le virus VIH subit une mutation pour échapper au système immunitaire de l'organisme.

Particulièrement, la « classe 1 de HLA, est une partie commande de la réaction immunitaire humaine. La capacité du VIH d'échapper à la reconnaissance par la classe 1 de HLA laisse le fuselage incapable de trouver et de combattre le virus.

L'étude, publiée dans l'édition de juillet des agents pathogènes de PLoS, est la plus grande enquête basée sur la population sur la façon dont les variations naturelles de la classe 1 de HLA peuvent influencer la séquence génétique de VIH, ainsi que la première caractérisation des changements des gènes multiples de VIH en réponse à la pression évolutionnaire HLA-associée.

Les chercheurs ont avec succès tracé des sites dans les gènes particuliers de VIH où les variations peuvent améliorer la capacité du virus d'échapper à la reconnaissance immunisée, montrant que c'est prévisible basé sur le profil individuel de la classe 1 du HLA de patient de VIH.

« C'est un roman et une description avancée de la façon dont le système immunitaire humain attaque le virus, et de la façon dont il répond, dit M. Richard Harrigan, directeur des laboratoires de recherche du centre et co-auteur d'étude. « Tandis que nous savions toujours le fuselage attaque le virus et le virus change en la pression d'esquive, nous sont maintenant plus exact en sachant ceci se produit dans les gens.  »

Tandis que l'étude est valeur en aidant la communauté scientifique comprenez comment la pression immunisée influence le VIH, promesse énorme de prise de ces découvertes en termes d'efforts globaux de VIH, dit M. Zabrina Brumme, l'auteur important de l'étude. La « réalisation d'une compréhension plus en profondeur des voies desquelles le VIH subit une mutation pour éviter le système immunitaire humain aidera avec le modèle d'un vaccin de VIH, » dit Brumme, qui est maintenant avec le centre de recherche de SIDA d'associés à MGH.

Des caractéristiques ont été rassemblées de la cohorte de HOMER de Colombie-Britannique, un grand groupe continuel de VIH-infecté, des personnes de demande de règlement-na've pour qui HLA class-1 tapant et génotypage d'ARN de VIH ont été exécutées.

La recherche de Microsoft a fourni le personnel et a avancé des outils logiciels pour effectuer l'analyse statistique hautement sophistiquée. Les algorithmes développés par David Heckerman, chercheur de fil de l'apprentissage automatique et groupe de statistiques appliquées à Microsoft recherchent et étudient le co-auteur, et son équipe permise pour plus d'analyse en profondeur des ensembles de données. « Nous avons produit les outils logiciels pour aider des chercheurs à exploiter le pouvoir de calculer à plus rapidement et recenser exactement les éléments essentiels d'un vaccin efficace de VIH, » a dit Heckerman.

L'idée originelle pour l'élaboration de ces méthodes statistiques est venue de M. Bette Korber au laboratoire national de Los Alamos. Korber et M. Tanmoy Bhattacharya et Marcus Daniels de Co-chercheurs ont travaillé avec Heckerman en développant davantage l'approche statistique tranchante.

Les résultats d'étude expliquent que les approches basées sur la population pourraient compléter de plus petites études fonctionnelles en fournissant une illustration d'entier-gène ou d'entier-virus d'évasion immunisée. BC la recherche précédente de centre publiée dans le tourillon des maladies infectieuses a vérifié le rôle de la variation de la classe 1 de HLA sur la réaction au traitement d'anti-VIH. « Avançant, nous augmenterons notre recherche génétique à d'autres gènes de VIH. Nous vérifierons également le rôle de la pharmacothérapie, » dit Harrigan.