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Como o vírus do VIH se transforma para escapar o sistema imunitário do corpo

Um estudo colaborador de abertura de caminhos descobriu como o vírus do VIH ilude o sistema imunitário de corpo humano.

Computador-intensivos da pesquisa - cientistas o do Columbia Britânica centre para a excelência em HIV/AIDS, Hospital Geral de Massachusetts, (MGH) Microsoft pesquisam e o laboratório de Los Alamos - os métodos estatísticos altamente, pioneiros usados nacionais de envolvimento colaboradores da pesquisa para investigar como o vírus do VIH se transforma para escapar o sistema imunitário do corpo.

Especificamente, de “a classe 1 HLA, é uma peça de controlo da resposta imune humana. A capacidade do VIH para escapar o reconhecimento pela classe 1 de HLA sae do corpo incapaz de encontrar e de lutar o vírus.

O estudo, publicado na introdução de julho dos micróbios patogénicos de PLoS, é a investigação população-baseada a maior de como as variações naturais na classe 1 de HLA podem influenciar a seqüência genética do VIH, assim como a primeira caracterização das mudanças em genes múltiplos do VIH em resposta a pressão evolucionária HLA-associada.

Os pesquisadores traçaram com sucesso os locais dentro dos genes particulares do VIH onde as variações podem melhorar a capacidade do vírus para escapar o reconhecimento imune, mostrando que este é predizível baseado no perfil individual da classe 1 do HLA de paciente de VIH.

“Esta é uma novela e uma descrição avançada de como o sistema imunitário humano ataca o vírus, e de como responde, diz o Dr. Richard Harrigan, director dos laboratórios de investigação do centro e co-autor do estudo. “Quando nós soubemos sempre o corpo ataca o vírus e o vírus muda à pressão do rodeio, nós é agora mais exacto em saber este acontece nos povos. ”

Quando o estudo for valioso em ajudar a comunidade científica compreenda como a pressão imune impacta o VIH, promessa tremenda da posse destes resultados em termos dos esforços globais do VIH, diz o Dr. Zabrina Brumme, autor principal do estudo. “Conseguir uma compreensão mais detalhada das maneiras em que o VIH se transforma para evitar o sistema imunitário humano ajudará com o projecto de uma vacina do VIH,” diz Brumme, que é agora com o centro de pesquisa do AIDS dos sócios em MGH.

Os dados foram recolhidos da coorte do LOCAL do Columbia Britânica, um grande grupo de VIH-contaminado crônica, os indivíduos do tratamento-na've para quem HLA class-1 que datilografam e o RNA do VIH que genotyping foi executado.

Microsoft pesquisa forneceu pessoais e ferramentas de software avançado para executar análise estatística altamente sofisticada. Algoritmos desenvolvidos por David Heckerman, pesquisador do chumbo da aprendizagem de máquina e grupo das estatísticas aplicadas na pesquisa de Microsoft e o co-autor do estudo, e sua equipe permitida a análise mais detalhada das séries de dados. “Nós criamos as ferramentas de software para ajudar pesquisadores a explorar a potência da computação a mais rapidamente e para identificar exactamente os elementos cruciais de uma vacina eficaz do VIH,” disse Heckerman.

A ideia original para a revelação destes métodos estatísticos veio do Dr. Bette Korber no laboratório nacional de Los Alamos. Korber e o Dr. Tanmoy Bhattacharya e Marcus Daniels dos co-pesquisadores trabalharam com o Heckerman mais em desenvolver a aproximação estatística pioneiro.

Os resultados do estudo demonstram que as aproximações população-baseadas poderiam complementar estudos funcionais menores fornecendo uma imagem do inteiro-gene ou do inteiro-vírus do escape imune. B.C. a pesquisa precedente do centro publicada no jornal de doenças infecciosas investigou o papel da variação da classe 1 de HLA na resposta à terapia anti-VIH. “Movendo-se para a frente, nós estaremos expandindo nossa pesquisa genética a outros genes do VIH. Nós igualmente estaremos investigando o papel do farmacoterapia,” diz Harrigan.