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Cómo el virus del VIH se transforma para escape el sistema inmune de la carrocería

Un estudio colaborativo pionero ha descubierto cómo el virus del VIH evade el sistema inmune del cuerpo humano.

Computador-intensivos de la investigación - de científicos el de la Columbia Británica centre para la excelencia en HIV/AIDS, Hospital General de Massachusetts, (MGH) Microsoft investigan y el laboratorio de Los Alamos - métodos estadísticos altamente, punta usados nacionales de participación colaborativos de la investigación para investigar cómo el virus del VIH se transforma para escape el sistema inmune de la carrocería.

Específicamente, la “clase 1 de HLA, es un elemento de control de la inmunorespuesta humana. La capacidad del VIH de escape el reconocimiento por la clase 1 de HLA sale de la carrocería incapaz de encontrar y de luchar el virus.

El estudio, publicado en la aplicación de julio los patógeno de PLoS, es la investigación sobre la base de la población más grande de cómo las variaciones naturales en la clase 1 de HLA pueden influenciar serie genética del VIH, así como la primera caracterización de cambios en genes múltiples del VIH en respuesta a la presión evolutiva HLA-asociada.

Los investigadores correlacionaron con éxito los sitios dentro de los genes determinados del VIH en donde las variaciones pueden perfeccionar la capacidad del virus de escape el reconocimiento inmune, mostrando que éste es fiable basado sobre el perfil individual de la clase 1 del HLA del paciente de VIH.

“Ésta es una novela y una descripción avanzada de cómo el sistema inmune humano ataca el virus, y de cómo responde, dice al Dr. Richard Harrigan, director de los laboratorios de la investigación del centro y co-autor del estudio. “Mientras que sabíamos siempre la carrocería ataca el virus y el virus cambia a la presión del regate, nosotros es más exacto ahora en saber éste suceso en gente. ”

Mientras que el estudio tiene valor en la ayuda de la comunidad científica entienda cómo la presión inmune afecta el VIH, promesa del asimiento de estas conclusión enorme en términos de esfuerzos globales del VIH, dice al Dr. Zabrina Brumme, el autor importante del estudio. “Lograr una comprensión más profundizada de las maneras de las cuales el VIH se transforma para evitar el sistema inmune humano ayudará con el diseño de una vacuna del VIH,” dice a Brumme, que ahora está con el centro de investigación del SIDA de los socios en MGH.

Los datos cerco de la cohorte del HOME RUN de la Columbia Británica, un grupo grande crónico de VIH-infectado, los individuos del tratamiento-na've para el cual HLA class-1 que pulsaban y ARN del VIH genotyping fue realizado.

Microsoft investiga ofreció personales y avance las herramientas de software para realizar análisis estadístico altamente sofisticado. Algoritmos desarrollados por David Heckerman, investigador del guía del aprendizaje de máquina y grupo de las estadísticas aplicadas en la investigación de Microsoft y co-autor del estudio, y sus personas permitidas para un análisis más profundizado de los conjuntos de datos. “Creamos las herramientas de software para ayudar a investigadores a explotar la potencia de calcular a más rápidamente y determinar exacto los elementos cruciales de una vacuna efectiva del VIH,” dijo a Heckerman.

La idea original para el revelado de estos métodos estadísticos vino del Dr. Bette Korber en el laboratorio nacional de Los Alamos. Korber y el Dr. Tanmoy Bhattacharya y Marco Daniels de los co-investigadores trabajaron con Heckerman en más lejos desarrollar la aproximación estadística punta.

Los resultados del estudio demuestran que las aproximaciones sobre la base de la población podrían complementar estudios funcionales más pequeños ofreciendo un retrato del entero-gen o del entero-virus del escape inmune. La investigación anterior del centro publicada en el gorrón de enfermedades infecciosas investigó A.C. el papel de la variación de la clase 1 de HLA en la reacción a la terapia anti-VIH. “Moviéndose adelante, desplegaremos nuestra investigación genética a otros genes del VIH. También investigaremos el papel de la medicación,” dice Harrigan.