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La técnica Nueva usando el modelado del ordenador determina efectos secundarios potenciales de productos farmacéuticos

La identificación Con Anticipación de efectos nocivos de drogas antes de que se prueben en seres humanos es crucial en desarrollar la nueva terapéutica, pues los efectos inesperados explican un tercero de todos los incidentes de la droga durante el proceso de desarrollo.

Ahora los investigadores en la Universidad de California, San Diego (UCSD) han desarrollado una técnica nueva usando el ordenador que modelaba para determinar efectos secundarios potenciales de productos farmacéuticos, y han utilizado la técnica para estudiar una clase de drogas que incluye el tamoxifen, la droga prescrita del tratamiento del cáncer de pecho. Su estudio está actualmente disponible en línea en la Biología De Cómputo de PLoS.

Pastas Convencionales de la pantalla de los métodos de la prueba en los estudios animales antes de juicios humanas con la esperanza de determinar los efectos secundarios de prometer la terapéutica. Las personas del UCSD - llevadas por Philip Bourne, Ph.D., profesor de la farmacología en la Escuela de Skaggs del UCSD de la Farmacia y las Ciencias y los Leus Farmacéuticos Xie, Ph.D., del Centro del Superordenador de San Diego en el UCSD - en lugar utilizan la potencia del modelado de cómputo para revisar las moléculas específicas de la droga usando un depósito mundial, el Banco de Datos de Proteína (PDB), conteniendo decenas de miles de estructuras tridimensionales de la proteína.

Las moléculas de la Droga se diseñan para atar a las proteínas apuntadas para lograr una influencia terapéutica, pero si la pequeña molécula de la droga que funciona como los attaches “dominantes” a una proteína de la lejos-meta que tenga un punto de enlace similar, o el “bloqueo,” los efectos secundarios puede resultar.

Para determinar qué proteínas pudieron ser las metas involuntarias, los investigadores del UCSD toman una única molécula de la droga y buscan cómo puede ser que ate a tanto de las proteínas codificadas por el proteome humano como sea posible. En este estudio de caso publicado, observaban los Moduladores del Receptor del Estrógeno Select (SERMs), una clase de la droga que incluye el tamoxifen, para ilustrar el nuevo enfoque.

“El procedimiento de ordenador desarrollamos comienzo con un modelo tridimensional existente de un farmacéutico, mostrando la estructura de una molécula de la droga limitada a su proteína de la meta; en este caso, los SERM limitan al receptor del estrógeno,” dijo a Bourne, que es codirector del PDB. Los científicos entonces utilizan análisis computarizado para explorar para otros puntos de enlace que correspondan con ese punto de enlace de la droga - como buscar otros bloqueos que se puedan abrir por el mismo clave.

En este estudio, las personas encontraron una meta previamente no identificada de la proteína para SERMs. La identificación de este punto de enlace secundario explica efectos nocivos sabidos, y abre la puerta en la modificación de la droga de una manera que mantenga el atascamiento a la meta prevista, pero reduce el atar al segundo sitio.

“Si una droga tiene efectos secundarios adversos, es probable que la droga también ate a una molécula involuntaria, secundaria; es decir el clave que permite que asocie a su meta ajusta más de un bloqueo,” dijo a Bourne. Él explicó eso usando esta técnica de cómputo para encontrar que otro “bloqueo” podría dar lugar a una de tres cosas: el nuevo bloqueo no pudo mostrar ningún efecto; el bloqueo podía explicar un efecto secundario adverso de la droga; o la investigación podría potencialmente descubrir un nuevo efecto terapéutico para una droga existente - drogue colocar de nuevo.

Los investigadores del UCSD están continuando sus estudios, que Bourne dice puede ser aplicado a cualquier droga en el mercado para el cual una estructura del salto de la droga al receptor existe en el PDB. Bourne acentuó que los resultados de esto se acercan todavía necesitado ser probado experimental.

Jian Wang del Programa de la Bioinformática del UCSD también contribuyó al estudio de PLoS. El trabajo fue utilizado en parte por los Institutos de la Salud Nacionales.

http://www.ucsd.edu/