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Cómo influencia corta de RNAs muchas proteínas

Durante la década pasada, los microRNAs han emergido algo asombrosamente mientras que regulan a los protagonistas en los genes de la manera. Estos recortes cortos del ARN hacen su trabajo obrando recíprocamente con el mensajero RNAs, que actúan como heliografías para la creación de la proteína.

Pero porque cada microRNA puede apuntar a centenares de mensajero RNAs-y no ha estado sin obstrucción cómo apunta efectivo cada uno de esos mensajero que los RNAs-científicos no han podido fijar el impacto final de microRNAs en la producción de la proteína.

Ahora, en el primer estudio en grande de su clase, los científicos en el Whitehead Institute y la Facultad de Medicina de Harvard han mirado más completo el rendimiento de la proteína de los genes apuntados por los microRNAs específicos. Los resultados se denuncian en la aplicación en línea del 30 de julio de 2008 la naturaleza.

“Esto es la primera vez que un conjunto de datos en grande se ha utilizado para observar el efecto de microRNAs sobre la producción de millares de proteínas,” dice la pieza y al investigador David Bartel de Whitehead del Howard Hughes Medical Institute, que es autor co-mayor en el estudio. La “tecnología anterior nos permitió observar solamente cómo los microRNAs afectan al mensajero RNAs. Eso proveyó de nosotros la información crucial sobre su implicación en la primera fase de traslación de la proteína pero de no su efecto final sobre la expresión génica.”

El estudio confirma que los microRNAs ajustan típicamente la producción de la proteína, ofreciendo mucho menos de un efecto represivo que se ha visto para algunos factores de la transcripción, las proteínas que pueden también actuar como reguladores del gen. El estudio también muestra que los microRNAs operan principal degradando al mensajero RNAs del objetivo bastante que simple lanzando una llave de tuercas en la traslación de la proteína.

Además, los investigadores mostraron que los microRNAs producen su impacto más grande cuando obran recíprocamente con una parte específica de la molécula del ARN de mensajero que no cifra para las proteínas.

Trabajando en colaboración con el laboratorio del co-mayor-autor Steven Gygi, profesor adjunto de la biología celular en la Facultad de Medicina de Harvard, el laboratorio de Bartel introdujo microRNAs individuales en las células humanas y después utilizó la espectrometría de masa cuantitativa para medir los cambios resultantes en niveles de la proteína.

Además, el trabajo con la persona Fernando Camargo, investigadores de Whitehead utilizó un modelo knockout del ratón que faltaba un único microRNA (microRNA-223) sabido para influenciar la producción y la función de los glóbulos blancos llamó neutrófilos. Los investigadores después midieron y compararon los niveles de la proteína de neutrófilos de ratones normales y de ratones que faltaban microRNA-223.

“Midiendo la proteína nivela, podríamos ilustrar que los microRNAs ajustan la expresión génica bastante que simple trabajando como interruptor para girar un gen con./desc.,” decimos Daehyun Baek, autor del co-guía en el papel y un becario postdoctoral en el laboratorio de Bartel. “El modelo knockout del ratón nos habilitó más exacto al indicador las acciones recíprocas de microRNAs con sus objetivos reguladores, y confirmar lo que encontramos anterior en células humanas.”

“Asombrosamente, los niveles de la proteína de células que faltaban microRNA-223 igualaron casi los de células normales,” agrega Gygi. “Este microRNA cambió el nivel de la expresión de centenares de proteínas, pero solamente por una pequeña cantidad.”

Determinar las proteínas influenciadas por la presencia de miR-223 también permitió a los investigadores evaluar diversas predicciones que los científicos habían hecho con respecto a qué genes son regulados por cada miRNA.

“Todavía no podemos predecir perfectamente que los genes son apuntados por un microRNA determinado, pero por lo menos ahora conocemos cuáles de los métodos propuestos de la predicción son los más útiles,” decimos Bartel.

Comparando niveles de la proteína y midiendo niveles del ARN, los investigadores demostraron que los microRNAs son más probables cambiar la expresión génica desestabilizando al mensajero RNAs bastante que simple violando las reglas encima del proceso de traslación de la proteína.

“Había habido una sospecha que suceso la mayoría de la regla del microRNA de una forma que no cambia realmente la cantidad de ARN de mensajero,” dice Bartel. “Encontramos que esto no era verdad, por lo menos para este microRNA determinado.”

Escrito por Cristin Carr.