Un virus de virus-infection

Utilisant le système de compteur séquentiel de génome des 454 sciences de la vie, une compagnie de Roche, les scientifiques français ont recensé un petit virus qui peut réellement être parasite à plus grand.

Le virus de 50 nanomètre, nommé Spoutnik, est associé à une tension neuve du mimivirus géant de polyphaga d'Acanthamoeba (APMV) et est censé représenter une famille actuel inconnue des virus. L'étude, intitulée « le virophage comme seul parasite du mimivirus géant, » est apparue dans la question du 4 septembre de la nature (1).

La relation entre Spoutnik et le mimivirus semble être avantageuse pour la reproduction virale de Spoutnik. Seule, Spoutnik ne reproduit pas très bien en cellules d'amibe. Cependant, quand l'amibe est également infectée avec le mimivirus, Spoutnik prospère et se multiplie dans l'usine virale produite par le mimivirus. En raison des parallèles dans sa durée de vie utile avec des bactériophages, le virus a été classifié comme « virophage ».

Le génome de Spoutnik, comme déterminé par le fusil de chasse 454 ordonnançant, est des 18 kilobases ADN bicaténaire circulaire et contient les gènes qui sont liés aux virus infectant chacun des trois domaines de la durée : Eukarya, archéobactéries et bactéries. Par conséquent, le virophage a pu être un véhicule négociant le transfert de gène transversal entre les virus géants. La découverte jette la lumière sur les seules interactions entre les virus et a des implications sur l'évolution de ces agents infectieux, de même qu'évidents du gène se mélangeant et s'assortir dans le virophage.

« Cette étude est encore un autre exemple de la façon dont 454 ordonnançant active des découvertes dans des endroits complet neufs de biologie. , S'affiche longtemps de l'ensemble de novo droit permis par système de compteur séquentiel de génome de cette substance virale nouvelle, » a dit Chris McLeod, le Président et Directeur Général hautement précis des 454 sciences de la vie. « Développer notre compréhension des virus et de leurs interactions entre eux peut faciliter une analyse plus profonde dans les maladies infectieuses de combat.  »

Les 454 sciences de la vie, un centre d'excellence de la science appliquée de Roche, développent et commercialisent 454 novateurs le système de ordonnancement pour l'ordonnancement du l'ultra-haut-débit ADN. Les applications spécifiques comprennent l'ordonnancement de novo et le re-ordonnancement des génomes, du metagenomics, de l'analyse d'ARN, et de l'ordonnancement visé des régions d'intérêt d'ADN. Les cachets du système 454 de ordonnancement sont sa préparation des échantillons simple et impartiale et longtemps, séquence hautement précise s'affiche, y compris l'appareiller-extrémité s'affiche. La technologie du système 454 de ordonnancement a activé des centaines d'études pair-observées dans de divers domaines de recherches, tels que la recherche de cancer et de maladie infectieuse, la découverte de médicaments, la biologie marine, l'anthropologie, la paléontologie et beaucoup plus.

(1) La Scola, B., Desnues, C., Pagnier, I., Robert, C., Barrassi, L., Fournous, G., Merchat, M., Suzan-Monti, M., Forterre, P., Koonin, E., Raoult, D. Nature, 2008, le 4 septembre. 455(7209) : 100-4. DOI : 10.1038/nature07218