Un virus d'infezione

Facendo uso del sistema del sequenziatore del genoma da 454 scienze biologiche, una società di Roche, scienziati francesi ha identificato un piccolo virus che può realmente essere parassitario a più grand'.

Il virus di 50 nanometro, nominato Sputnik, è associato con un nuovo sforzo del mimivirus gigante di polyphaga di Acanthamoeba (APMV) ed è creduto di rappresentare una famiglia corrente sconosciuta dei virus. Lo studio, intitolato “il virophage come parassita unico del mimivirus gigante,„ è comparso nell'emissione del 4 settembre della natura (1).

La relazione fra lo sputnik e il mimivirus sembra essere utile per la riproduzione virale dello sputnik. Da sè, lo sputnik non ripiega molto bene in celle dell'ameba. Tuttavia, quando l'ameba egualmente è infettata con il mimivirus, lo sputnik prospera e moltiplica nella fabbrica virale creata per il mimivirus. dovuto le parallele nel suo ciclo di vita con i batteriofagi, il virus è stato classificato come “virophage„.

Il genoma di sputnik, come determinato dal fucile da caccia 454 che ordina, è un DNA a doppia elica circolare di kilobase 18 e contiene i geni che sono collegati ai virus che infettano ciascuno dei tre domini di vita: Eukarya, Archaea e batteri. Di conseguenza, il virophage ha potuto essere un veicolo che media il trasferimento laterale del gene fra i virus giganti. La scoperta fa luce sulle interazioni uniche fra i virus ed ha implicazioni sull'evoluzione di questi agenti infettante, come è evidenti dal gene che si mescola e corrispondere all'interno del virophage.

“Questo studio è ancora un altro esempio di come 454 che ordinano stanno permettendo alle scoperte nelle aree completamente nuove di biologia. , Lungamente legge del montaggio diretto permesso sistema di de novo del sequenziatore del genoma del questo le specie virali novelle,„ ha detto Chris McLeod, il presidente e direttore generale altamente accurato di 454 scienze biologiche. “Sviluppare la nostra comprensione dei virus e delle loro interazioni tra loro può facilitare la comprensione più profonda nelle malattie infettive di combattimento. „

454 scienze biologiche, un centro di eccellenza di scienza applicata di Roche, mettono a punto e commercializzano il sistema d'ordinamento 454 innovatori per l'ordinamento del DNA di ultra-alto-capacità di lavorazione. Le applicazioni specifiche includono de novo che ordina e cheordina dei genoma, del metagenomics, dell'analisi del RNA e dell'ordinamento mirato a delle regioni del DNA di interesse. Gli marchi di garanzia del sistema d'ordinamento 454 sono il suo preparato del campione semplice e imparziale e lungamente, sequenza altamente accurata legge, compreso l'accoppiare-estremità legge. La tecnologia del sistema d'ordinamento 454 ha permesso alle centinaia di studi pari-esaminati nei diversi campi della ricerca, come la ricerca della malattia infettiva e del cancro, la scoperta della droga, la biologia marina, l'antropologia, la paleontologia e molto.

(1) La Scola, B., Desnues, C., Pagnier, I., Robert, C., Barrassi, L., Fournous, G., Merchat, M., Suzan-Monti, M., Forterre, P., Koonin, E., Raoult, D. Nature, 2008, il 4 settembre. 455(7209): 100-4. DOI: 10.1038/nature07218