Um vírus decontaminação

Usando o sistema do sequencer do genoma de 454 ciências da vida, uma empresa de Roche, cientistas franceses identificou um vírus pequeno que pudesse realmente ser parasítico a um maior.

O vírus de 50 nanômetro, nomeado Esputinique, é associado com uma tensão nova do mimivirus gigante do polyphaga de Acanthamoeba (APMV) e acreditado representar uma família actualmente desconhecida dos vírus. O estudo, autorizado “o virophage como um parasita original do mimivirus gigante,” apareceu na introdução do 4 de setembro da natureza (1).

O relacionamento entre o esputinique e o mimivirus parece ser benéfico para a reprodução viral do esputinique. No seus próprios, o esputinique não replicate muito bem em pilhas da ameba. Contudo, quando a ameba é contaminada igualmente com o mimivirus, o esputinique prospera e multiplica na fábrica viral criada pelo mimivirus. Devido às paralelas em seu ciclo de vida com bacteriófagos, o vírus foi classificado como um “virophage”.

O genoma do esputinique, como determinado pela espingarda 454 que arranja em seqüência, é um ADN dobro-encalhado circular do kilobase 18 e contem os genes que são ligados aos vírus que contaminam cada um dos três domínios da vida: Eukarya, Archaea e bactérias. Conseqüentemente, o virophage podia ser um veículo que negocia transferência lateral do gene entre vírus gigantes. A descoberta derrama a luz nas interacções originais entre vírus e tem implicações na evolução destes agentes infecciosos, como é evidentes do gene que mistura e combinar dentro do virophage.

“Este estudo é contudo um outro exemplo de como 454 que arranjam em seqüência estão permitindo descobertas em áreas completamente novas da biologia. , Lê por muito tempo do conjunto directo permitido sistema de novo do sequencer do genoma desta espécie viral nova,” disse Chris McLeod, a presidente e director geral altamente exacta de 454 ciências da vida. “Desenvolver nossa compreensão dos vírus e das suas interacções um com o outro pode facilitar uma introspecção mais profunda em combater doenças infecciosas. ”

454 ciências da vida, um centro de excelência de ciência aplicada de Roche, desenvolvem e comercializam 454 inovativos o sistema arranjando em seqüência para arranjar em seqüência do ADN da ultra-alto-produção. As aplicações específicas incluem de novo que arranja em seqüência e quearranja em seqüência dos genomas, do metagenomics, da análise do RNA, e de arranjar em seqüência visado de regiões do ADN de interesse. As indicações do sistema 454 arranjando em seqüência são sua preparação da amostra simples, imparcial e por muito tempo, a seqüência altamente exacta lê, incluindo o emparelhar-fim lê. A tecnologia do sistema 454 arranjando em seqüência permitiu centenas de estudos par-revistos em campos diversos da pesquisa, tais como a pesquisa do cancro e da doença infecciosa, a descoberta da droga, a biologia marinha, a antropologia, a paleontologia e o muito mais.

(1) La Scola, B., Desnues, C., Pagnier, I., Robert, C., Barrassi, L., Fournous, G., Merchat, M., Suzan-Monti, M., Forterre, P., Koonin, E., Raoult, D. Natureza, 2008, o 4 de setembro. 455(7209): 100-4. DOI: 10.1038/nature07218