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Oxford Nanopore annuncia la pubblicazione del documento dell'analisi del DNA

Le tecnologie di Oxford Nanopore (“Oxford Nanopore„) oggi hanno annunciato la pubblicazione di nuova ricerca in nanotecnologia della natura, dimostrando l'identificazione accurata e continua delle basi del DNA facendo uso dei nanopores.

Il sistema può anche direttamente identificare la citosina metilata, importante nello studio del epigenetics. Questa ricerca traccia il progresso significativo verso lo scopo di Oxford Nanopore di sviluppare il primo DNA contrassegno contrassegno e singolo della molecola che ordina la tecnologia.

Un metodo di identificazione delle molecole singole che non conta sul contrassegno fluorescente costoso e complesso è centrale a raggiungere il forte progresso seguente nel costo e nella velocità dell'analisi del genoma. È possibile raggiungere questo scopo riflettendo una corrente elettrica semplice che passa attraverso un nanopore. Mentre singolo le basi del DNA attraversano il nanopore, cause di ogni base una rottura caratteristica della corrente che permette che la molecola sia identificata.

L'odierno articolo di nanotecnologia della natura descrive l'uso della tecnologia del nanopore identificare le basi del DNA con fiducia molto alta per integrazione in un nuovo DNA altamente non Xerox che ordina il sistema. I risultati sono stati raggiunti con modifica di un nanopore della proteina, compreso il collegamento permanente di una molecola del convertitore alla sua superficie interna.

La pubblicazione egualmente dimostra che la citosina metilata può essere distinta dalle quattro basi del DNA facendo uso dello stesso metodo. Ciò è importante nello studio su cancro, in cui la metilazione del genoma è implicata ma le tecniche attuali di studio richiedono il contrassegno complesso del campione del DNA.

“La scienza di percezione del DNA del nanopore ora è accurata ed abbastanza affidabile supportare una tecnologia industriale di innovazione,„ ha detto il professor Hagan Bayley, fondatore di Oxford Nanopore e un autore del documento. “La semplicità e la versatilità dei nanopores come sistema di percezione ha intrigato i ricercatori accademici per quasi due decadi. Anticipiamo che con il passo veloce della scienza, le unità del nanopore presto saranno utilizzate per la misura di DNA e di molte altre molecole.„

“I risultati da questo documento forniscono la convalida del rendimento elevato dell'elemento sensibile del nanopore del nostro DNA che ordina il sistema,„ ha detto il Dott. Gordon Sanghera, CEO delle tecnologie di Oxford Nanopore. “Continuiamo lo sviluppo rapido di questa tecnologia, di cui costo, sensibilità e la versatilità vantaggiosi promette di permettere ad un nuovo paradigma dell'analisi del DNA.„

La ricerca comprende altri risultati essenziali per un nanopore integrato che ordina il sistema. Per la sua tecnologia di BASETM, Oxford Nanopore coppia un nanopore della proteina con un enzima processive di exonuclease. Questo enzima fende le diverse basi del DNA da un filo di DNA ed introduce le diverse basi nel nanopore per l'identificazione. Questo studio indica che le condizioni di gestione del nanopore sono compatibili con quelle di un exonuclease. Inoltre c'è un'alta probabilità che ogni base del DNA sposta il nanopore in moda da non leggere due volte una base.

Distinzione dei nucleotidi:

L'accuratezza dell'identificazione delle basi del DNA è stata determinata come segue: Le distribuzioni delle basi come dNMPs misura a Gaussians e le aree di coincidenza di punta sono state determinate per dare i valori di fiducia per l'identità bassa. Le percentuali degli eventi obbligatori che potrebbero essere definiti ad ogni base con una fiducia che si avvicina a 100% ad un'alta concentrazione nel sale (800 millimetri) erano 99,9% (G), 99,7% (t), 99,8% (A) e 99,99% (C). Dove c'è ambiguità in una chiamata bassa, le identità di sole due basi alternative possibili sono conosciute.

Questa ricerca è stata conclusa di estate di 2008 all'università di Oxford e di Oxford Nanopore, in cui gli scienziati continuano a migliorare su questa prestazione.

Circa tecnologie srl di Oxford Nanopore.

Oxford Nanopore è stata fondata nel 2005 sulla scienza del professor Hagan Bayley dell'università di Oxford. Dal suo inizio, la società ha messo a fuoco sulla tecnologia di sviluppo del nanopore in un sistema producibile di massa del lettore e del biochip per l'analisi molecolare. Nanopores è stato ricercato per più di 15 anni alle istituzioni accademiche più prestigiose dell'una serie di mondo compreso Harvard, il MIT, il NIST, l'università di Massachusetts, la Texas A&M University e l'università di Oxford.

La tecnologia di BASETM (Bayley che ordina) usa un nanopore adattato della proteina accoppiato con un enzima processive di exonuclease per ordinare il DNA. L'enzima fende le diverse basi da un filo di DNA ed in sequenza introduce le basi nell'apertura diaframma del nanopore. Una corrente ionica sta attraversando continuamente il nanopore e mentre le diverse basi attraversano through il nanopore, ciascuna crea una rottura caratteristica in questa corrente. Questo segnale è registrato elettronicamente ed è interpretato per identificare la base del DNA. Le generazioni future di nanopore che ordinano la tecnologia possono ordinare direttamente i polimeri del DNA o utilizzare i nanpores fatti dei materiali sintetici.

La tecnologia è contrassegna contrassegno e sensibile al livello della unico molecola, al significato a del che elimina l'esigenza dei contrassegni fluorescenti, della rappresentazione ottica e della strumentazione ed all'esigenza del preparato complesso del campione compreso l'amplificazione del DNA. Sottoponendo a operazioni di disgaggio su in un trattamento d'ordinamento in maniera massiccia parallelo su un chip di schiera, questo metodo ha il potenziale di consegnare i forti progressi nel costo, nella velocità, nella semplicità e nella versatilità di ordinamento.

Nel gennaio 2009, Oxford Nanopore ha annunciato un'alleanza strategica con Illumina, inc, compreso un accordo di commercializzazione e un investimento azionario accelerare lo sviluppo di tecnologia BASSA. Ai sensi dell'accordo di commercializzazione, Illumina esclusivamente commercializzerà, venderà, distribuirà ed assisterà i prodotti BASSI della tecnologia sviluppati da Oxford Nanopore per DNA che ordina nei servizi di sistema diagnostico e della ricerca su scala mondiale.

Nanopores per la rilevazione di altri analiti

Offerta di Nanopores un sistema di percezione modulare. Con le modifiche chimiche o genetiche al poro, il biosenor può adattarsi per l'analisi di altre molecole di interesse. Questi hanno potuto includere i biomarcatori medici, le droghe di abuso, gli agenti di bioterrorismo e molti altri analiti. La tecnologia che supporta l'analisi dei nanopores potrebbe anche essere utilizzata per la selezione del canale ionico, con le applicazioni nello sviluppo della droga.

Source:

http://www.nanoporetech.com

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