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Oxford Nanopore anuncia a publicação do papel da análise do ADN

As tecnologias de Oxford Nanopore (“Oxford Nanopore”) anunciaram hoje a publicação da pesquisa nova na nanotecnologia da natureza, demonstrando a identificação exacta e contínua de bases do ADN usando nanopores.

O sistema pode igualmente directamente identificar o cytosine misturado, importante no estudo do epigenetics. Esta pesquisa marca o progresso significativo para o objetivo de Oxford Nanopore de desenvolver o primeiro ADN etiqueta-livre, único da molécula que arranja em seqüência a tecnologia.

Um método de identificar únicas moléculas que não confia na rotulagem fluorescente cara e complexa é central a conseguir a melhoria dramática seguinte no custo e na velocidade da análise do genoma. É possível conseguir este objetivo monitorando uma corrente elétrica simples que passa através de um nanopore. Enquanto único as bases do ADN passam através do nanopore, causas de cada base um rompimento característico da corrente que permite que a molécula seja identificada.

O papel de hoje da nanotecnologia da natureza descreve o uso da tecnologia do nanopore identificar bases do ADN com confiança muito alta para a integração em um ADN novo altamente competitivo que arranja em seqüência o sistema. Os resultados foram conseguidos com a alteração de um nanopore da proteína, incluindo o acessório permanente de uma molécula do adaptador a sua superfície interna.

A publicação igualmente demonstra que o cytosine misturado pode ser distinto das quatro bases do ADN usando o mesmo método. Isto é importante no estudo do cancro, onde o methylation do genoma é implicado mas as técnicas existentes do estudo exigem a rotulagem complexa da amostra do ADN.

“A ciência da detecção do ADN do nanopore é agora exacta e seguro bastante para apoiar uma tecnologia industrial da descoberta,” disse o professor Hagan Bayley, fundador de Oxford Nanopore e um autor do papel. “A simplicidade e a versatilidade dos nanopores como um sistema de detecção intrigaram pesquisadores académicos por quase duas décadas. Nós antecipamos que com o ritmo rápido da ciência, os dispositivos do nanopore estarão usados logo para a medida do ADN e das muitas outras moléculas.”

“Os resultados deste papel fornecem a validação do elevado desempenho do elemento de detecção do nanopore de nosso ADN que arranja em seqüência o sistema,” disse o Dr. Gordon Sanghera, CEO de tecnologias de Oxford Nanopore. “Nós continuamos a revelação rápida desta tecnologia, cujos custo, velocidade e a versatilidade vantajosos promete permitir um paradigma novo da análise do ADN.”

A pesquisa inclui outros resultados essenciais para um nanopore integrado que arranja em seqüência o sistema. Para sua tecnologia de BASETM, Oxford Nanopore acopla um nanopore da proteína com uma enzima processive do exonuclease. Esta enzima fende bases individuais do ADN de uma costa do ADN e introduz as bases individuais no nanopore para a identificação. Este estudo mostra que as condições de funcionamento do nanopore são compatíveis com aquelas de um exonuclease. Além há uma probabilidade alta que cada base do ADN translocates o nanopore de modo que uma base não seja lida duas vezes.

Discriminação dos nucleotides:

A precisão da identificação de bases do ADN foi determinada como segue: As distribuições das bases como dNMPs foram cabidas a Gaussians e as áreas da sobreposição máxima foram determinadas dar valores da confiança para a identidade baixa. As porcentagens dos eventos obrigatórios que poderiam ser atribuídos a cada base com uma confiança que aproxima 100% em uma concentração alta de sal (800 milímetros) eram 99,9% (g), 99,7% (T), 99,8% (a) e 99,99% (c). Onde há uma ambigüidade em um atendimento baixo, as identidades das únicas duas bases alternativas possíveis são sabidas.

Esta pesquisa foi concluída no verão de 2008 na universidade de Oxford e de Oxford Nanopore, onde os cientistas continuam a melhorar neste desempenho.

Sobre tecnologias Ltd. de Oxford Nanopore

Oxford Nanopore foi fundado em 2005 na ciência do professor Hagan Bayley da universidade de Oxford. Desde seu início, a empresa centrou-se sobre a tecnologia tornando-se do nanopore em um sistema producible em massa do biochip e do leitor para a análise molecular. Nanopores foi pesquisado por mais de 15 anos nas instituições académicos as mais prestigiosas de um número de mundo que incluem Harvard, MIT, NIST, a universidade de Massachusetts, a universidade de Texas A&M, e a universidade de Oxford.

A tecnologia de BASETM (Bayley que arranja em seqüência) usa um nanopore adaptado da proteína acoplado com uma enzima processive do exonuclease para arranjar em seqüência o ADN. A enzima fende bases individuais de uma costa do ADN, e introduz sequencialmente as bases na abertura do nanopore. Uma corrente iónica está correndo através continuamente do nanopore, e como as bases individuais viajam através do nanopore, cada uma cria um rompimento característico nesta corrente. Este sinal é gravado electronicamente e interpretado para identificar a base do ADN. As futuras gerações de nanopore que arranjam em seqüência a tecnologia podem arranjar em seqüência polímeros do ADN directamente ou utilizar os nanpores feitos de materiais sintéticos.

A tecnologia é etiqueta-livre e sensível no nível da único-molécula, em significar que remove a necessidade para etiquetas fluorescentes, a imagem lactente óptica e a instrumentação, e na necessidade para a preparação complexa da amostra que inclui a amplificação do ADN. Escalando acima em um processo arranjando em seqüência maciça paralelo em uma microplaqueta da disposição, este método tem o potencial entregar melhorias dramáticas no custo, na velocidade, na simplicidade e na versatilidade de arranjar em seqüência.

Em janeiro de 2009, Oxford Nanopore anunciou uma aliança estratégica com Illumina, Inc, incluindo um investimento do acordo e de lucro da comercialização acelerar a revelação da tecnologia BAIXA. Sob os termos do acordo da comercialização, Illumina exclusivamente introduzirá no mercado, venderá, distribuirá, e prestará serviços de manutenção aos produtos BAIXOS da tecnologia desenvolvidos por Oxford Nanopore para o ADN que arranja em seqüência nos mercados da pesquisa e do diagnóstico em uma base mundial.

Nanopores para a detecção de outros analytes

Oferta de Nanopores um sistema de detecção modular. Com as alterações químicas ou genéticas ao poro, o biosenor pode ser adaptado para a análise de outras moléculas do interesse. Estes puderam incluir biomarkers médicos, drogas de abuso, agentes do bioterrorismo e muito mais analytes. A tecnologia que apoia a análise dos nanopores pôde igualmente ser usada para a selecção do íon-canal, com aplicações na revelação da droga.

Source:

http://www.nanoporetech.com

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