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Recurso novo principal da e-ciência para biólogos

A universidade de Manchester e o instituto europeu europeu da bioinformática de laboratório de biologia molecular (EMBL-EBI) lançaram um recurso novo principal da e-ciência para os biólogos - que poderiam acelerar a pesquisa em tratamentos para a gripe H1N1 e o cancro.

Biocatalogue.org, um registro centralizado de serviços de Web curated da ciência da vida, está sendo lançado oficialmente esta semana na 17a conferência internacional anual sobre sistemas inteligentes para a biologia molecular e na 8a conferência européia sobre a conferência computacional da biologia (ISMB-ECCB 2009) em Éstocolmo.

Este tipo de acesso sistemático tem o potencial acelerar significativamente o trabalho dos pesquisadores nos campos médicos, agronómicos e farmacêuticos. O serviço permite que os pesquisadores descubram, anotem, registrem e usem serviços com suporte na internet biológicos.

Biocatalogue.org já tem ao redor 1.000 serviços de Web biológicos - e cada vez mais será registrado e anotado por fornecedores de serviços, por curador e por usuários numa base diária.

Os serviços são monitorados por mecanismos automatizados e pela comunidade de usuário para suas disponibilidade e confiança. Um sistema simples do sinal indica o estado actual de um serviço de Web.

Além do que o fornecimento dos meios alcançar programmatically ferramentas e bases de dados da ciência da vida sobre o Internet, a facilidade actua como um lugar onde os pesquisadores possam contactar e encontrar os peritos e os mantenedores destes serviços.

Os serviços de Web ganharam um impulso como meios para empacotar dados existentes e recursos computacionais em um formulário que fosse favorável para o uso e a composição por aplicações do terceiro.

A comunidade da ciência da vida está entre os primeiros adoptantes de serviços de Web. Taverna, uma bancada dos trabalhos que sejam popular dentro da comunidade da ciência da vida - e que seja desenvolvida comum por cientistas de computador na universidade de Manchester - fornece o acesso sobre a 3.500 serviços de Web que podem ser compor por cientistas para construir e decretar suas in silico experiências.

Mas uma das questões principais que impede a adopção e o uso largos de serviços de Web é a dificuldade em encontrar aqueles que executam a análise o cientista está interessada dentro.

Com Biocatalogue.org, os serviços de Web são anotados pelos curador peritos, prestadores de serviços e pela comunidade mais larga que usa etiquetas, avaliação, comentários e ontologias. As ferramentas automatizadas da mineração e da monitoração são usadas igualmente.

O projecto foi conduzido pelo prof. Carole Goble na universidade de Manchester e de Rodrigo López em EMBL EBI.

Outros contribuinte incluem Khalid Belhajjame, Franck Tanoh, Jiten Bhagat, Katy Wolstencroft e Robert Stevens da universidade de Manchester e Eric Nzuobontane, Hamish McWilliam e Thomas Laurent de EMBL EBI.

O projecto é financiado pela biotecnologia e pelo Conselho de Pesquisa das ciências biológicas (BBSRC).

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