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Nuevo recurso importante de la e-ciencia para los biólogos

La universidad de Manchester y el instituto europeo europeo de la bioinformática del laboratorio de biología molecular (EMBL-EBI) han puesto en marcha un nuevo recurso importante de la e-ciencia para los biólogos - que podrían acelerar la investigación en los tratamientos para la gripe H1N1 y el cáncer.

Biocatalogue.org, un registro centralizado de los servicios web curated de las ciencias de la vida, se está lanzando oficialmente esta semana en la 17ma Conferencia Internacional anual sobre los sistemas inteligentes para la biología molecular y la 8va conferencia europea sobre la conferencia de cómputo de la biología (ISMB-ECCB 2009) en Estocolmo.

Este tipo de acceso sistemático tiene el potencial de acelerar importante el trabajo de investigadores en los campos médicos, agronómicos y farmacéuticos. El servicio permite que los investigadores descubran, que anoten, que registren y que utilicen servicios en Internet biológicos.

Biocatalogue.org tiene alrededor 1.000 servicios web biológicos - y cada vez más será registrado y anotado ya por los prestatarios de servicios, los guardianes y los utilizadores sobre una base diaria.

Los servicios son vigilados por los mecanismos automatizados y por la comunidad de utilizador para su disponibilidad y confiabilidad. Un sistema simple del semáforo visualiza el estado actual de un servicio web.

Además de ofrecer los medios programáticamente de llegar hasta las herramientas y las bases de datos de las ciencias de la vida sobre el Internet, la instalación actúa como lugar en donde los investigadores pueden contacto y encontrar los expertos y a los sostenes de estos servicios.

Los servicios web han ganado un impulso como los medios para empaquetar datos existentes y recursos de cómputo en una forma que es favorable para el uso y la composición por usos de los terceros.

La comunidad de las ciencias de la vida está entre los primeros adoptantes de servicios web. Taverna, una mesa de trabajo del flujo de trabajo que sea popular dentro de la comunidad de las ciencias de la vida - y que fue desarrollada en común por los informáticos en la universidad de Manchester - ofrece el acceso sobre a 3.500 servicios web que puedan ser compuestos por los científicos para construir y decretar sus in silico experimentos.

Pero uno de los puntos principales que obstaculiza la adopción y el uso amplios de servicios web es la dificultad en el localización de los que realicen el análisis el científico está interesado hacia adentro.

Con Biocatalogue.org, a la comunidad más ancha anotan a los servicios web por los guardianes expertos, proveedores de servicios y que usa etiquetas, el aforo, comentarios y las ontologías. Las herramientas automatizadas de la explotación minera y de la supervisión también se utilizan.

El proyecto ha sido llevado por profesor Carola Goble en la universidad de Manchester y de Rodrigo López en EMBL EBI.

Otros contribuidores incluyen Khalid Belhajjame, Franck Tanoh, Jiten Bhagat, Katy Wolstencroft y Roberto Stevens de la universidad de Manchester y Eric Nzuobontane, Hamish McWilliam y Thomas Laurent de EMBL EBI.

El proyecto es financiado por la biotecnología y el Consejo de Investigación de las ciencias biológicas (BBSRC).

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